bp_test/out/find_gaps.out.1

   1 SEQ: NNNNNNNNNNtatcgatcgatcgaacgt
   2 SEQ_NAME: test1
   3 SEQ_LEN: 28
   4 ---
   5 S_LEN: 10
   6 S_ID: test1
   7 S_BEG: 0
   8 S_END: 9
   9 ---
  10 S_LEN: 10
  11 S_ID: test1
  12 S_BEG: 0
  13 S_END: 9
  14 ---
  15 SEQ: tatcgatcgatcgaacgtnnnnnnnnnn
  16 SEQ_NAME: test2
  17 SEQ_LEN: 28
  18 ---
  19 S_LEN: 10
  20 S_ID: test2
  21 S_BEG: 18
  22 S_END: 27
  23 ---
  24 S_LEN: 10
  25 S_ID: test2
  26 S_BEG: 18
  27 S_END: 27
  28 ---
  29 SEQ: tatcgatcNNNNNNNNNNgatcgaacgt
  30 SEQ_NAME: test3
  31 SEQ_LEN: 28
  32 ---
  33 S_LEN: 10
  34 S_ID: test3
  35 S_BEG: 8
  36 S_END: 17
  37 ---
  38 S_LEN: 10
  39 S_ID: test3
  40 S_BEG: 8
  41 S_END: 17
  42 ---
  43 SEQ: NNNNtatcgatcgatcgaacgt
  44 SEQ_NAME: test4
  45 SEQ_LEN: 22
  46 ---
  47 SEQ: tatcgatcgatcgaacgtnnnn
  48 SEQ_NAME: test5
  49 SEQ_LEN: 22
  50 ---
  51 SEQ: tatcgatcNNNNgatcgaacgt
  52 SEQ_NAME: test6
  53 SEQ_LEN: 22
  54 ---