bp_test/out/find_adaptor.out.1

   1 SEQ_NAME: test_full_length_adaptor
   2 SEQ: TCGTATGCCGTCTTCTGCTTG
   3 SEQ_LEN: 21
   4 ADAPTOR_POS: 0
   5 ADAPTOR_LEN: 21
   6 ---
   7 SEQ_NAME: test_begin_match
   8 SEQ: TCGTATGCCGTCTTCTGCTTGactacgt
   9 SEQ_LEN: 28
  10 ADAPTOR_POS: 0
  11 ADAPTOR_LEN: 21
  12 ---
  13 SEQ_NAME: test_middle_match
  14 SEQ: actgactgaTCGTATGCCGTCTTCTGCTTGactacgt
  15 SEQ_LEN: 37
  16 ADAPTOR_POS: 9
  17 ADAPTOR_LEN: 21
  18 ---
  19 SEQ_NAME: test_end_match
  20 SEQ: gactgaTCGTATGCCGTCTTCTGCTTG
  21 SEQ_LEN: 27
  22 ADAPTOR_POS: 6
  23 ADAPTOR_LEN: 21
  24 ---
  25 SEQ_NAME: test_end_trim
  26 SEQ: gtgacactatcgatacgatcgacactgaTCGTA
  27 SEQ_LEN: 33
  28 ---
  29 SEQ_NAME: test_mismatches
  30 SEQ: actgactgaTCGTATtCCGTCTTaTGCTTGactacgt
  31 SEQ_LEN: 37
  32 ---
  33 SEQ_NAME: test_insertions
  34 SEQ: actgactgaTCGTATCCGTCTTTGCTTGactacgt
  35 SEQ_LEN: 37
  36 ---
  37 SEQ_NAME: test_deletions
  38 SEQ: actgactgaTCGTATgGCCGTCTTgCTGCTTGactacgt
  39 SEQ_LEN: 37
  40 ---