]> git.donarmstrong.com Git - biopieces.git/blob - bp_test/out/blast_seq.out.2
fixed encoding bug in read_454
[biopieces.git] / bp_test / out / blast_seq.out.2
1 SEQ: CCGCTTCCCCGGGGTGGCGACCTCGGCGGGCCCGGTGGACATGCCGGCCCTGATCCAGGGCAAAGCCGCGCTGGTTGAAAGCATGCGGTCGGAGAAGTACGTCGATCTGGCCGCGGACTACGGCTGGACGATGATCTCGGGGGACGCATCGTTCACCGGGACCCAGAACGCACCACTGCTCCGGGTCGCCTCCCCGGACGGTACGGTGAGAACGATCGAGGCCGGGCACTACCTCGTGGCCACCGGCGCCGCACCCTGGGTGCCGTCCGTCCCCGGACTGGCCGAGGCCGGGTACCTGACCTCGACCACGGCGATGGAACTGGACGAGGTTCCCGAATCATTGCTGGTCCTGGGCGGGGGCTATGTTGCCCTGGAAATGGCGCAGCTTTTCTCCCGGCTGGGCTCCCGGGTGACCATGCTGGTCCGTTCCCGGCTGGCCTCGCAGGAGGAACCGGAGGCATCCAAGGCCCTTGCGGGGGTGTTTGCCGACGAGGGCATCCGGGTGGTCCGGCGGGCCATGGCCGACTCCGTGGCCTCCGGCCCGGACGGGATCTCGGTGACGGCAAGCGTGGCCGGGGGCGAAGAAGTGTTCCGCGCTTCCCACATCCTCGTGGCACTTGGCCGCCGCCCAGTGACCGAGGGGCTGGACCTTGATGCCGTCGGCGTGAAGATCGGCGCCACAGGCGAGATTCTGGTCGATTCCCGTCTGGCCACGTCCAACCCGCGCATCTGGGCCGCCGGGGACGTGACCGGACATCGGGAGTTCGTTTACGTTGCCGCGGCCCACGGCGCGATGGCCGTGGACAATGCGTTCACCGACGCCCTGGCCGAGGTCGACTACCGGCACCTGCCGCGGGTCACCTTCACCAGTCCCGCCATCGGGTCGGTCGGCATGACGGAAAAGGAAGCCGTCGCTGCCGGGATCCGTTGCGAGTGCCGGGTCCTGCCCCTGGAGTACGTGCCGCGAGCCGTGGTCAACCGCGACACCCGCGGCTTCATCAAGGTTGTCGCCGAGCTCGGCACCGGACGGATCCTGGGCATTTCCGCGGTGGCCAAGGACGCCGGGGAAATCGCCGCCGCCGGCGTCTACATCCT
2 SEQ_NAME: 8D5s
3 SEQ_LEN: 1095
4 ---
5 STRAND: +
6 Q_ID: 8D5s
7 ALIGN_LEN: 360
8 S_ID: gi_22537405_mercuric_reductase_[Streptococcus_agalactiae_2603V/R]
9 REC_TYPE: BLAST
10 IDENT: 40.56
11 E_VAL: 6e-76
12 S_BEG: 147
13 Q_BEG: 4
14 MISMATCHES: 213
15 BIT_SCORE: 270
16 Q_END: 1080
17 GAPS: 3
18 S_END: 498
19 ---
20 STRAND: +
21 Q_ID: 8D5s
22 ALIGN_LEN: 19
23 S_ID: gi_22537405_mercuric_reductase_[Streptococcus_agalactiae_2603V/R]
24 REC_TYPE: BLAST
25 IDENT: 47.37
26 E_VAL: 7.4
27 S_BEG: 116
28 Q_BEG: 634
29 MISMATCHES: 10
30 BIT_SCORE: 17.7
31 Q_END: 578
32 GAPS: 0
33 S_END: 134
34 ---
35 STRAND: +
36 Q_ID: 8D5s
37 ALIGN_LEN: 360
38 S_ID: gi_22538158_mercuric_reductase_[Streptococcus_agalactiae_2603V/R]
39 REC_TYPE: BLAST
40 IDENT: 40.56
41 E_VAL: 2e-75
42 S_BEG: 147
43 Q_BEG: 4
44 MISMATCHES: 213
45 BIT_SCORE: 268
46 Q_END: 1080
47 GAPS: 3
48 S_END: 498
49 ---
50 STRAND: +
51 Q_ID: 8D5s
52 ALIGN_LEN: 19
53 S_ID: gi_22538158_mercuric_reductase_[Streptococcus_agalactiae_2603V/R]
54 REC_TYPE: BLAST
55 IDENT: 47.37
56 E_VAL: 7.4
57 S_BEG: 116
58 Q_BEG: 634
59 MISMATCHES: 10
60 BIT_SCORE: 17.7
61 Q_END: 578
62 GAPS: 0
63 S_END: 134
64 ---
65 STRAND: +
66 Q_ID: 8D5s
67 ALIGN_LEN: 347
68 S_ID: gi_18466556_putative_mercuric_reductase_[Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18]
69 REC_TYPE: BLAST
70 IDENT: 43.80
71 E_VAL: 3e-69
72 S_BEG: 177
73 Q_BEG: 49
74 MISMATCHES: 194
75 BIT_SCORE: 248
76 Q_END: 1086
77 GAPS: 5
78 S_END: 515
79 ---
80 STRAND: +
81 Q_ID: 8D5s
82 ALIGN_LEN: 21
83 S_ID: gi_18466556_putative_mercuric_reductase_[Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18]
84 REC_TYPE: BLAST
85 IDENT: 42.86
86 E_VAL: 1.1
87 S_BEG: 156
88 Q_BEG: 391
89 MISMATCHES: 12
90 BIT_SCORE: 20.4
91 Q_END: 329
92 GAPS: 1
93 S_END: 175
94 ---
95 STRAND: +
96 Q_ID: 8D5s
97 ALIGN_LEN: 16
98 S_ID: gi_18466556_putative_mercuric_reductase_[Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18]
99 REC_TYPE: BLAST
100 IDENT: 56.25
101 E_VAL: 1.1
102 S_BEG: 156
103 Q_BEG: 490
104 MISMATCHES: 7
105 BIT_SCORE: 20.4
106 Q_END: 443
107 GAPS: 1
108 S_END: 170
109 ---
110 STRAND: +
111 Q_ID: 8D5s
112 ALIGN_LEN: 59
113 S_ID: gi_18466556_putative_mercuric_reductase_[Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18]
114 REC_TYPE: BLAST
115 IDENT: 27.12
116 E_VAL: 2.0
117 S_BEG: 25
118 Q_BEG: 1025
119 MISMATCHES: 43
120 BIT_SCORE: 19.6
121 Q_END: 849
122 GAPS: 0
123 S_END: 83
124 ---
125 STRAND: +
126 Q_ID: 8D5s
127 ALIGN_LEN: 16
128 S_ID: gi_18466556_putative_mercuric_reductase_[Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18]
129 REC_TYPE: BLAST
130 IDENT: 37.50
131 E_VAL: 9.7
132 S_BEG: 243
133 Q_BEG: 457
134 MISMATCHES: 10
135 BIT_SCORE: 17.3
136 Q_END: 410
137 GAPS: 0
138 S_END: 258
139 ---
140 STRAND: +
141 Q_ID: 8D5s
142 ALIGN_LEN: 357
143 S_ID: gi_18466613_putative_mercuric_reductase_[Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18]
144 REC_TYPE: BLAST
145 IDENT: 41.46
146 E_VAL: 1e-66
147 S_BEG: 163
148 Q_BEG: 10
149 MISMATCHES: 206
150 BIT_SCORE: 239
151 Q_END: 1071
152 GAPS: 5
153 S_END: 513
154 ---
155 STRAND: +
156 Q_ID: 8D5s
157 ALIGN_LEN: 102
158 S_ID: gi_18466613_putative_mercuric_reductase_[Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18]
159 REC_TYPE: BLAST
160 IDENT: 23.53
161 E_VAL: 0.39
162 S_BEG: 29
163 Q_BEG: 136
164 MISMATCHES: 76
165 BIT_SCORE: 21.9
166 Q_END: 435
167 GAPS: 2
168 S_END: 130
169 ---
170 STRAND: +
171 Q_ID: 8D5s
172 ALIGN_LEN: 341
173 S_ID: gi_15921327_mercuric_reductase_[Sulfolobus_tokodaii_str._7]
174 REC_TYPE: BLAST
175 IDENT: 34.60
176 E_VAL: 3e-51
177 S_BEG: 78
178 Q_BEG: 55
179 MISMATCHES: 221
180 BIT_SCORE: 188
181 Q_END: 1071
182 GAPS: 6
183 S_END: 405
184 ---
185 STRAND: +
186 Q_ID: 8D5s
187 ALIGN_LEN: 363
188 S_ID: gi_16082328_mercuric_reductase_[Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728]
189 REC_TYPE: BLAST
190 IDENT: 36.64
191 E_VAL: 6e-50
192 S_BEG: 69
193 Q_BEG: 1
194 MISMATCHES: 224
195 BIT_SCORE: 184
196 Q_END: 1071
197 GAPS: 9
198 S_END: 418
199 ---
200 STRAND: +
201 Q_ID: 8D5s
202 ALIGN_LEN: 39
203 S_ID: gi_16082328_mercuric_reductase_[Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728]
204 REC_TYPE: BLAST
205 IDENT: 35.90
206 E_VAL: 4.4
207 S_BEG: 10
208 Q_BEG: 372
209 MISMATCHES: 24
210 BIT_SCORE: 18.5
211 Q_END: 485
212 GAPS: 2
213 S_END: 44
214 ---
215 STRAND: +
216 Q_ID: 8D5s
217 ALIGN_LEN: 341
218 S_ID: gi_15899410_mercuric_reductase_(Hg(II)_reductase)_(merA)_[Sulfolobus_solfataricus_P2]
219 REC_TYPE: BLAST
220 IDENT: 33.43
221 E_VAL: 4e-48
222 S_BEG: 76
223 Q_BEG: 55
224 MISMATCHES: 225
225 BIT_SCORE: 177
226 Q_END: 1071
227 GAPS: 6
228 S_END: 403
229 ---
230 STRAND: +
231 Q_ID: 8D5s
232 ALIGN_LEN: 371
233 S_ID: gi_18313475_mercuric_reductase_[Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2]
234 REC_TYPE: BLAST
235 IDENT: 34.23
236 E_VAL: 1e-46
237 S_BEG: 64
238 Q_BEG: 4
239 MISMATCHES: 229
240 BIT_SCORE: 172
241 Q_END: 1071
242 GAPS: 10
243 S_END: 416
244 ---
245 STRAND: +
246 Q_ID: 8D5s
247 ALIGN_LEN: 7
248 S_ID: gi_18313475_mercuric_reductase_[Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2]
249 REC_TYPE: BLAST
250 IDENT: 71.43
251 E_VAL: 9.7
252 S_BEG: 32
253 Q_BEG: 465
254 MISMATCHES: 2
255 BIT_SCORE: 17.3
256 Q_END: 485
257 GAPS: 0
258 S_END: 38
259 ---
260 STRAND: +
261 Q_ID: 8D5s
262 ALIGN_LEN: 361
263 S_ID: gi_14601420_mercuric_reductase_[Aeropyrum_pernix_K1]
264 REC_TYPE: BLAST
265 IDENT: 32.96
266 E_VAL: 1e-44
267 S_BEG: 67
268 Q_BEG: 34
269 MISMATCHES: 234
270 BIT_SCORE: 166
271 Q_END: 1092
272 GAPS: 9
273 S_END: 417
274 ---
275 STRAND: +
276 Q_ID: 8D5s
277 ALIGN_LEN: 32
278 S_ID: gi_14601420_mercuric_reductase_[Aeropyrum_pernix_K1]
279 REC_TYPE: BLAST
280 IDENT: 37.50
281 E_VAL: 0.52
282 S_BEG: 11
283 Q_BEG: 408
284 MISMATCHES: 14
285 BIT_SCORE: 21.6
286 Q_END: 485
287 GAPS: 1
288 S_END: 42
289 ---
290 STRAND: +
291 Q_ID: 8D5s
292 ALIGN_LEN: 11
293 S_ID: gi_14601420_mercuric_reductase_[Aeropyrum_pernix_K1]
294 REC_TYPE: BLAST
295 IDENT: 45.45
296 E_VAL: 4.3
297 S_BEG: 134
298 Q_BEG: 463
299 MISMATCHES: 6
300 BIT_SCORE: 18.5
301 Q_END: 431
302 GAPS: 0
303 S_END: 144
304 ---
305 STRAND: +
306 Q_ID: 8D5s
307 ALIGN_LEN: 360
308 S_ID: gi_13541082_mercuric_reductase_[Thermoplasma_volcanium_GSS1]
309 REC_TYPE: BLAST
310 IDENT: 30.83
311 E_VAL: 1e-44
312 S_BEG: 70
313 Q_BEG: 1
314 MISMATCHES: 246
315 BIT_SCORE: 166
316 Q_END: 1071
317 GAPS: 6
318 S_END: 420
319 ---
320 STRAND: +
321 Q_ID: 8D5s
322 ALIGN_LEN: 38
323 S_ID: gi_13541082_mercuric_reductase_[Thermoplasma_volcanium_GSS1]
324 REC_TYPE: BLAST
325 IDENT: 34.21
326 E_VAL: 3.3
327 S_BEG: 11
328 Q_BEG: 372
329 MISMATCHES: 25
330 BIT_SCORE: 18.9
331 Q_END: 485
332 GAPS: 1
333 S_END: 45
334 ---
335 STRAND: +
336 Q_ID: 8D5s
337 ALIGN_LEN: 13
338 S_ID: gi_13541082_mercuric_reductase_[Thermoplasma_volcanium_GSS1]
339 REC_TYPE: BLAST
340 IDENT: 46.15
341 E_VAL: 5.7
342 S_BEG: 69
343 Q_BEG: 1043
344 MISMATCHES: 7
345 BIT_SCORE: 18.1
346 Q_END: 1081
347 GAPS: 0
348 S_END: 81
349 ---