bp_test/in/read_embl.in

   1 ID   U49845; SV 1; linear; genomic DNA; STD; FUN; 5028 BP.
   2 XX
   3 AC   U49845;
   4 XX
   5 DT   07-MAY-1996 (Rel. 47, Created)
   6 DT   25-MAR-2010 (Rel. 104, Last updated, Version 5)
   7 XX
   8 DE   Saccharomyces cerevisiae TCP1-beta gene, partial cds; and Axl2p (AXL2) and
   9 DE   Rev7p (REV7) genes, complete cds.
  10 XX
  11 KW   .
  12 XX
  13 OS   Saccharomyces cerevisiae (baker's yeast)
  14 OC   Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Saccharomycotina; Saccharomycetes;
  15 OC   Saccharomycetales; Saccharomycetaceae; Saccharomyces.
  16 XX
  17 RN   [1]
  18 RP   1-5028
  19 RX   PUBMED; 8846915.
  20 RA   Roemer T., Madden K., Chang J., Snyder M.;
  21 RT   "Selection of axial growth sites in yeast requires Axl2p, a novel plasma
  22 RT   membrane glycoprotein";
  23 RL   Genes Dev. 10(7):777-793(1996).
  24 XX
  25 RN   [2]
  26 RP   1-5028
  27 RA   Roemer T.;
  28 RT   ;
  29 RL   Submitted (22-FEB-1996) to the INSDC.
  30 RL   Biology, Yale University, New Haven, CT 06520, USA
  31 XX
  32 DR   Ensembl-Gn; YIL139C; Saccharomyces_cerevisiae.
  33 DR   Ensembl-Gn; YIL140W; Saccharomyces_cerevisiae.
  34 DR   Ensembl-Gn; YIL142W; Saccharomyces_cerevisiae.
  35 DR   Ensembl-Tr; YIL139C; Saccharomyces_cerevisiae.
  36 DR   Ensembl-Tr; YIL140W; Saccharomyces_cerevisiae.
  37 DR   Ensembl-Tr; YIL142W; Saccharomyces_cerevisiae.
  38 DR   EnsemblGenomes; YIL139C; Saccharomyces_cerevisiae.
  39 DR   EnsemblGenomes; YIL140W; Saccharomyces_cerevisiae.
  40 DR   EnsemblGenomes; YIL142W; Saccharomyces_cerevisiae.
  41 XX
  42 FH   Key             Location/Qualifiers
  43 FH
  44 FT   source          1..5028
  45 FT                   /organism="Saccharomyces cerevisiae"
  46 FT                   /chromosome="IX"
  47 FT                   /mol_type="genomic DNA"
  48 FT                   /db_xref="taxon:4932"
  49 FT   mRNA            <1..>206
  50 FT                   /product="TCP1-beta"
  51 FT   CDS             <1..206
  52 FT                   /codon_start=3
  53 FT                   /product="TCP1-beta"
  54 FT                   /db_xref="GOA:P39076"
  55 FT                   /db_xref="InterPro:IPR002194"
  56 FT                   /db_xref="InterPro:IPR002423"
  57 FT                   /db_xref="InterPro:IPR012716"
  58 FT                   /db_xref="InterPro:IPR017998"
  59 FT                   /db_xref="PDB:3P9D"
  60 FT                   /db_xref="UniProtKB/Swiss-Prot:P39076"
  61 FT                   /protein_id="AAA98665.1"
  62 FT                   /translation="SSIYNGISTSGLDLNNGTIADMRQLGIVESYKLKRAVVSSASEAA
  63 FT                   EVLLRVDNIIRARPRTANRQHM"
  64 FT   gene            <687..>3158
  65 FT                   /gene="AXL2"
  66 FT   mRNA            <687..>3158
  67 FT                   /gene="AXL2"
  68 FT                   /product="Axl2p"
  69 FT   CDS             687..3158
  70 FT                   /codon_start=1
  71 FT                   /gene="AXL2"
  72 FT                   /product="Axl2p"
  73 FT                   /note="plasma membrane glycoprotein"
  74 FT                   /db_xref="GOA:P38928"
  75 FT                   /db_xref="InterPro:IPR006644"
  76 FT                   /db_xref="InterPro:IPR008009"
  77 FT                   /db_xref="InterPro:IPR013783"
  78 FT                   /db_xref="InterPro:IPR014805"
  79 FT                   /db_xref="InterPro:IPR015919"
  80 FT                   /db_xref="SGD:S000001402"
  81 FT                   /db_xref="UniProtKB/Swiss-Prot:P38928"
  82 FT                   /protein_id="AAA98666.1"
  83 FT                   /translation="MTQLQISLLLTATISLLHLVVATPYEAYPIGKQYPPVARVNESFT
  84 FT                   FQISNDTYKSSVDKTAQITYNCFDLPSWLSFDSSSRTFSGEPSSDLLSDANTTLYFNVI
  85 FT                   LEGTDSADSTSLNNTYQFVVTNRPSISLSSDFNLLALLKNYGYTNGKNALKLDPNEVFN
  86 FT                   VTFDRSMFTNEESIVSYYGRSQLYNAPLPNWLFFDSGELKFTGTAPVINSAIAPETSYS
  87 FT                   FVIIATDIEGFSAVEVEFELVIGAHQLTTSIQNSLIINVTDTGNVSYDLPLNYVYLDDD
  88 FT                   PISSDKLGSINLLDAPDWVALDNATISGSVPDELLGKNSNPANFSVSIYDTYGDVIYFN
  89 FT                   FEVVSTTDLFAISSLPNINATRGEWFSYYFLPSQFTDYVNTNVSLEFTNSSQDHDWVKF
  90 FT                   QSSNLTLAGEVPKNFDKLSLGLKANQGSQSQELYFNIIGMDSKITHSNHSANATSTRSS
  91 FT                   HHSTSTSSYTSSTYTAKISSTSAAATSSAPAALPAANKTSSHNKKAVAIACGVAIPLGV
  92 FT                   ILVALICFLIFWRRRRENPDDENLPHAISGPDLNNPANKPNQENATPLNNPFDDDASSY
  93 FT                   DDTSIARRLAALNTLKLDNHSATESDISSVDEKRDSLSGMNTYNDQFQSQSKEELLAKP
  94 FT                   PVQPPESPFFDPQNRSSSVYMDSEPAVNKSWRYTGNLSPVSDIVRDSYGSQKTVDTEKL
  95 FT                   FDLEAPEKEKRTSRDVTMSSLDPWNSNISPSPVRKSVTPSPYNVTKHRNRHLQNIQDSQ
  96 FT                   SGKNGITPTTMSTSSSDDFVPVKDGENFCWVHSMEPDRRPSKKRLVDFSNKSNVNVGQV
  97 FT                   KDIHGRIPEML"
  98 FT   gene            complement(<3300..>4037)
  99 FT                   /gene="REV7"
 100 FT   mRNA            complement(<3300..>4037)
 101 FT                   /gene="REV7"
 102 FT                   /product="Rev7p"
 103 FT   CDS             complement(3300..4037)
 104 FT                   /codon_start=1
 105 FT                   /gene="REV7"
 106 FT                   /product="Rev7p"
 107 FT                   /db_xref="GOA:P38927"
 108 FT                   /db_xref="InterPro:IPR003511"
 109 FT                   /db_xref="SGD:S000001401"
 110 FT                   /db_xref="UniProtKB/Swiss-Prot:P38927"
 111 FT                   /protein_id="AAA98667.1"
 112 FT                   /translation="MNRWVEKWLRVYLKCYINLILFYRNVYPPQSFDYTTYQSFNLPQF
 113 FT                   VPINRHPALIDYIEELILDVLSKLTHVYRFSICIINKKNDLCIEKYVLDFSELQHVDKD
 114 FT                   DQIITETEVFDEFRSSLNSLIMHLEKLPKVNDDTITFEAVINAIELELGHKLDRNRRVD
 115 FT                   SLEEKAEIERDSNWVKCQEDENLPDNNGFQPPKIKLTSLVGSDVGPLIIHQFSEKLISG
 116 FT                   DDKILNGVYSQYEEGESIFGSLF"
 117 XX
 118 SQ   Sequence 5028 BP; 1510 A; 1074 C; 835 G; 1609 T; 0 other;
 119      gatcctccat atacaacggt atctccacct caggtttaga tctcaacaac ggaaccattg        60
 120      ccgacatgag acagttaggt atcgtcgaga gttacaagct aaaacgagca gtagtcagct       120
 121      ctgcatctga agccgctgaa gttctactaa gggtggataa catcatccgt gcaagaccaa       180
 122      gaaccgccaa tagacaacat atgtaacata tttaggatat acctcgaaaa taataaaccg       240
 123      ccacactgtc attattataa ttagaaacag aacgcaaaaa ttatccacta tataattcaa       300
 124      agacgcgaaa aaaaaagaac aacgcgtcat agaacttttg gcaattcgcg tcacaaataa       360
 125      attttggcaa cttatgtttc ctcttcgagc agtactcgag ccctgtctca agaatgtaat       420
 126      aatacccatc gtaggtatgg ttaaagatag catctccaca acctcaaagc tccttgccga       480
 127      gagtcgccct cctttgtcga gtaattttca cttttcatat gagaacttat tttcttattc       540
 128      tttactctca catcctgtag tgattgacac tgcaacagcc accatcacta gaagaacaga       600
 129      acaattactt aatagaaaaa ttatatcttc ctcgaaacga tttcctgctt ccaacatcta       660
 130      cgtatatcaa gaagcattca cttaccatga cacagcttca gatttcatta ttgctgacag       720
 131      ctactatatc actactccat ctagtagtgg ccacgcccta tgaggcatat cctatcggaa       780
 132      aacaataccc cccagtggca agagtcaatg aatcgtttac atttcaaatt tccaatgata       840
 133      cctataaatc gtctgtagac aagacagctc aaataacata caattgcttc gacttaccga       900
 134      gctggctttc gtttgactct agttctagaa cgttctcagg tgaaccttct tctgacttac       960
 135      tatctgatgc gaacaccacg ttgtatttca atgtaatact cgagggtacg gactctgccg      1020
 136      acagcacgtc tttgaacaat acataccaat ttgttgttac aaaccgtcca tccatctcgc      1080
 137      tatcgtcaga tttcaatcta ttggcgttgt taaaaaacta tggttatact aacggcaaaa      1140
 138      acgctctgaa actagatcct aatgaagtct tcaacgtgac ttttgaccgt tcaatgttca      1200
 139      ctaacgaaga atccattgtg tcgtattacg gacgttctca gttgtataat gcgccgttac      1260
 140      ccaattggct gttcttcgat tctggcgagt tgaagtttac tgggacggca ccggtgataa      1320
 141      actcggcgat tgctccagaa acaagctaca gttttgtcat catcgctaca gacattgaag      1380
 142      gattttctgc cgttgaggta gaattcgaat tagtcatcgg ggctcaccag ttaactacct      1440
 143      ctattcaaaa tagtttgata atcaacgtta ctgacacagg taacgtttca tatgacttac      1500
 144      ctctaaacta tgtttatctc gatgacgatc ctatttcttc tgataaattg ggttctataa      1560
 145      acttattgga tgctccagac tgggtggcat tagataatgc taccatttcc gggtctgtcc      1620
 146      cagatgaatt actcggtaag aactccaatc ctgccaattt ttctgtgtcc atttatgata      1680
 147      cttatggtga tgtgatttat ttcaacttcg aagttgtctc cacaacggat ttgtttgcca      1740
 148      ttagttctct tcccaatatt aacgctacaa ggggtgaatg gttctcctac tattttttgc      1800
 149      cttctcagtt tacagactac gtgaatacaa acgtttcatt agagtttact aattcaagcc      1860
 150      aagaccatga ctgggtgaaa ttccaatcat ctaatttaac attagctgga gaagtgccca      1920
 151      agaatttcga caagctttca ttaggtttga aagcgaacca aggttcacaa tctcaagagc      1980
 152      tatattttaa catcattggc atggattcaa agataactca ctcaaaccac agtgcgaatg      2040
 153      caacgtccac aagaagttct caccactcca cctcaacaag ttcttacaca tcttctactt      2100
 154      acactgcaaa aatttcttct acctccgctg ctgctacttc ttctgctcca gcagcgctgc      2160
 155      cagcagccaa taaaacttca tctcacaata aaaaagcagt agcaattgcg tgcggtgttg      2220
 156      ctatcccatt aggcgttatc ctagtagctc tcatttgctt cctaatattc tggagacgca      2280
 157      gaagggaaaa tccagacgat gaaaacttac cgcatgctat tagtggacct gatttgaata      2340
 158      atcctgcaaa taaaccaaat caagaaaacg ctacaccttt gaacaacccc tttgatgatg      2400
 159      atgcttcctc gtacgatgat acttcaatag caagaagatt ggctgctttg aacactttga      2460
 160      aattggataa ccactctgcc actgaatctg atatttccag cgtggatgaa aagagagatt      2520
 161      ctctatcagg tatgaataca tacaatgatc agttccaatc ccaaagtaaa gaagaattat      2580
 162      tagcaaaacc cccagtacag cctccagaga gcccgttctt tgacccacag aataggtctt      2640
 163      cttctgtgta tatggatagt gaaccagcag taaataaatc ctggcgatat actggcaacc      2700
 164      tgtcaccagt ctctgatatt gtcagagaca gttacggatc acaaaaaact gttgatacag      2760
 165      aaaaactttt cgatttagaa gcaccagaga aggaaaaacg tacgtcaagg gatgtcacta      2820
 166      tgtcttcact ggacccttgg aacagcaata ttagcccttc tcccgtaaga aaatcagtaa      2880
 167      caccatcacc atataacgta acgaagcatc gtaaccgcca cttacaaaat attcaagact      2940
 168      ctcaaagcgg taaaaacgga atcactccca caacaatgtc aacttcatct tctgacgatt      3000
 169      ttgttccggt taaagatggt gaaaattttt gctgggtcca tagcatggaa ccagacagaa      3060
 170      gaccaagtaa gaaaaggtta gtagattttt caaataagag taatgtcaat gttggtcaag      3120
 171      ttaaggacat tcacggacgc atcccagaaa tgctgtgatt atacgcaacg atattttgct      3180
 172      taattttatt ttcctgtttt attttttatt agtggtttac agatacccta tattttattt      3240
 173      agtttttata cttagagaca tttaatttta attccattct tcaaatttca tttttgcact      3300
 174      taaaacaaag atccaaaaat gctctcgccc tcttcatatt gagaatacac tccattcaaa      3360
 175      attttgtcgt caccgctgat taatttttca ctaaactgat gaataatcaa aggccccacg      3420
 176      tcagaaccga ctaaagaagt gagttttatt ttaggaggtt gaaaaccatt attgtctggt      3480
 177      aaattttcat cttcttgaca tttaacccag tttgaatccc tttcaatttc tgctttttcc      3540
 178      tccaaactat cgaccctcct gtttctgtcc aacttatgtc ctagttccaa ttcgatcgca      3600
 179      ttaataactg cttcaaatgt tattgtgtca tcgttgactt taggtaattt ctccaaatgc      3660
 180      ataatcaaac tatttaagga agatcggaat tcgtcgaaca cttcagtttc cgtaatgatc      3720
 181      tgatcgtctt tatccacatg ttgtaattca ctaaaatcta aaacgtattt ttcaatgcat      3780
 182      aaatcgttct ttttattaat aatgcagatg gaaaatctgt aaacgtgcgt taatttagaa      3840
 183      agaacatcca gtataagttc ttctatatag tcaattaaag caggatgcct attaatggga      3900
 184      acgaactgcg gcaagttgaa tgactggtaa gtagtgtagt cgaatgactg aggtgggtat      3960
 185      acatttctat aaaataaaat caaattaatg tagcatttta agtataccct cagccacttc      4020
 186      tctacccatc tattcataaa gctgacgcaa cgattactat tttttttttc ttcttggatc      4080
 187      tcagtcgtcg caaaaacgta taccttcttt ttccgacctt ttttttagct ttctggaaaa      4140
 188      gtttatatta gttaaacagg gtctagtctt agtgtgaaag ctagtggttt cgattgactg      4200
 189      atattaagaa agtggaaatt aaattagtag tgtagacgta tatgcatatg tatttctcgc      4260
 190      ctgtttatgt ttctacgtac ttttgattta tagcaagggg aaaagaaata catactattt      4320
 191      tttggtaaag gtgaaagcat aatgtaaaag ctagaataaa atggacgaaa taaagagagg      4380
 192      cttagttcat cttttttcca aaaagcaccc aatgataata actaaaatga aaaggatttg      4440
 193      ccatctgtca gcaacatcag ttgtgtgagc aataataaaa tcatcacctc cgttgccttt      4500
 194      agcgcgtttg tcgtttgtat cttccgtaat tttagtctta tcaatgggaa tcataaattt      4560
 195      tccaatgaat tagcaatttc gtccaattct ttttgagctt cttcatattt gctttggaat      4620
 196      tcttcgcact tcttttccca ttcatctctt tcttcttcca aagcaacgat ccttctaccc      4680
 197      atttgctcag agttcaaatc ggcctctttc agtttatcca ttgcttcctt cagtttggct      4740
 198      tcactgtctt ctagctgttg ttctagatcc tggtttttct tggtgtagtt ctcattatta      4800
 199      gatctcaagt tattggagtc ttcagccaat tgctttgtat cagacaattg actctctaac      4860
 200      ttctccactt cactgtcgag ttgctcgttt ttagcggaca aagatttaat ctcgttttct      4920
 201      ttttcagtgt tagattgctc taattctttg agctgttctc tcagctcctc atatttttct      4980
 202      tgccatgact cagattctaa ttttaagcta ttcaatttct ctttgatc                   5028
 203 //