bp_test/in/find_adaptor.in

   1 SEQ_NAME: test_full_length_adaptor
   2 SEQ: TCGTATGCCGTCTTCTGCTTG
   3 SEQ_LEN: 21
   4 ---
   5 SEQ_NAME: test_begin_match
   6 SEQ: TCGTATGCCGTCTTCTGCTTGactacgt
   7 SEQ_LEN: 28
   8 ---
   9 SEQ_NAME: test_middle_match
  10 SEQ: actgactgaTCGTATGCCGTCTTCTGCTTGactacgt
  11 SEQ_LEN: 37
  12 ---
  13 SEQ_NAME: test_end_match
  14 SEQ: gactgaTCGTATGCCGTCTTCTGCTTG
  15 SEQ_LEN: 27
  16 ---
  17 SEQ_NAME: test_end_trim
  18 SEQ: gtgacactatcgatacgatcgacactgaTCGTA
  19 SEQ_LEN: 33
  20 ---
  21 SEQ_NAME: test_mismatches
  22 SEQ: actgactgaTCGTATtCCGTCTTaTGCTTGactacgt
  23 SEQ_LEN: 37
  24 ---
  25 SEQ_NAME: test_insertions
  26 SEQ: actgactgaTCGTATCCGTCTTTGCTTGactacgt
  27 SEQ_LEN: 37
  28 ---
  29 SEQ_NAME: test_deletions
  30 SEQ: actgactgaTCGTATgGCCGTCTTgCTGCTTGactacgt
  31 SEQ_LEN: 37
  32 ---