bp_bin/swapcase_seq

   1 #!/usr/bin/env ruby
   2
   3 require 'optparse'
   4 require 'pp'
   5
   6 options = {}
   7
   8 optparse = OptionParser.new do |opts|
   9   opts.on( '-?', '--help', 'Display this screen' ) do
  10                 biopiece = $0.split( "/" ).last
  11                 exec "print_wiki --data_in #{ ENV[ 'BP_DIR' ] }/bp_usage/#{ biopiece }.wiki --help"
  12     exit
  13   end
  14
  15         opts.on( '-v', '--verbose' ) do
  16                 options[ :verbose ] = true
  17         end
  18
  19         opts.on( '-I', '--stream_in FILE', Time ) do |arg|
  20                 options[:stream_in] = arg
  21         end
  22
  23 #       opts.on( '-I', '--stream_in FILE', "Mandatory argument" ) do |arg|
  24 #               options[:stream_in] = arg
  25 #       end
  26
  27         opts.on( '-O', '--stream_in FILE', "Mandatory argument" ) do |arg|
  28                 options[:stream_out] = arg
  29         end
  30 end
  31
  32 optparse.parse!
  33
  34 pp "Options:", options
  35 pp "ARGV:", ARGV
  36
  37 if ARGV.length == 0 then
  38         biopiece = $0.split( "/" ).last
  39         exec "print_wiki --data_in #{ ENV[ 'BP_DIR' ] }/bp_usage/#{ biopiece }.wiki"
  40 end