bp_bin/print_wiki

   1 #!/usr/bin/env perl -w
   2
   3 # Copyright (C) 2007-2009 Martin A. Hansen.
   4
   5 # This program is free software; you can redistribute it and/or
   6 # modify it under the terms of the GNU General Public License
   7 # as published by the Free Software Foundation; either version 2
   8 # of the License, or (at your option) any later version.
   9
  10 # This program is distributed in the hope that it will be useful,
  11 # but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  12 # MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  13 # GNU General Public License for more details.
  14
  15 # You should have received a copy of the GNU General Public License
  16 # along with this program; if not, write to the Free Software
  17 # Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
  18
  19 # http://www.gnu.org/copyleft/gpl.html
  20
  21
  22 # >>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> DESCRIPTION <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
  23
  24 # Prints a wiki page in ASCII format.
  25
  26 # >>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>><<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
  27
  28
  29 use strict;
  30 use Maasha::Biopieces;
  31 use Maasha::Gwiki;
  32
  33
  34 # >>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>><<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
  35
  36
  37 my ( $options, $default, $wiki, $lines );
  38
  39 $default = $ENV{ 'BP_DIR' } . "/bp_usage/" . ( split "/", $0 )[ -1 ]. ".wiki";
  40
  41 $options = Maasha::Biopieces::parse_options(
  42     [
  43         { long => 'data_in', short => 'i', type => 'file!', mandatory => 'no', default => $default, allowed => undef, disallowed => undef },
  44     ]
  45 );
  46
  47 $wiki = Maasha::Gwiki::gwiki_read( $options->{ 'data_in' } );
  48
  49 ( $wiki->[ 2 ], $wiki->[ 3 ], $wiki->[ 0 ], $wiki->[ 1 ] ) = ( $wiki->[ 0 ], $wiki->[ 1 ], $wiki->[ 2 ], $wiki->[ 3 ] );
  50
  51 if ( not $options->{ "help" } ) {
  52     @{ $wiki } = grep { $_->[ 0 ]->{ 'SECTION' } =~ /Biopiece|summary|Usage|Options|Help/ } @{ $wiki };
  53 }
  54
  55 $lines = Maasha::Gwiki::gwiki2ascii( $wiki );
  56
  57 print STDERR "$_\n" foreach @{ $lines };
  58
  59
  60 # >>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>><<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
  61
  62
  63 BEGIN
  64 {
  65     $run_time_beg = Maasha::Biopieces::run_time();
  66
  67     Maasha::Biopieces::log_biopiece();
  68 }
  69
  70
  71 END
  72 {
  73     $run_time_end = Maasha::Biopieces::run_time();
  74
  75     Maasha::Biopieces::run_time_print( $run_time_beg, $run_time_end, $options );
  76 }
  77
  78 # >>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>><<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
  79
  80
  81 __END__
  82