artwork/brochure/brochure_debian-neurodebian.tex

   1 %-*- mode: latex; fill-column: 70 -*-
   2 % ex: set sts=4 ts=4 sw=4 et tw=70:
   3 %&pdflatex
   4
   5 \documentclass[letterpaper,landscape]{report}
   6 \usepackage[landscape,margin=0.5cm]{geometry}
   7 \usepackage{color}
   8 \usepackage{flowfram}
   9 %\usepackage{booktabs}           % for rules in tables
  10 \usepackage{tabularx}           % for column-width tables
  11 \usepackage[table]{xcolor}      % color control
  12
  13 \usepackage[colorlinks]{hyperref}
  14
  15 \usepackage{multicol}
  16 \setlength{\columnseprule}{1pt} % for visible divider
  17 \setlength{\columnsep}{1cm}
  18
  19 \usepackage{graphicx}
  20 \graphicspath{
  21  {../}
  22 }
  23
  24 \usepackage{enumitem}           % useful for control of listings
  25 \usepackage[compact,raggedright]{titlesec}
  26 \usepackage{comment}
  27
  28 \newcommand{\epigraph}[3]{\textit{#1}\linebreak \vspace{-1.5em} \begin{flushright}\hspace{5em}\ --\ #2\linebreak\small{#3} \end{flushright}}
  29
  30 \pagestyle{empty}
  31 \parindent=0pt
  32
  33 % Attempts to change bg color of *section headings
  34 %\definecolor{secbgcol}{rgb}{0.9, 0.85, 0.85}
  35 %\titleformat{\section}
  36 %{\color{red}\normalfont\Large\bfseries}{\ndsection}{1em}{}
  37 %\titleformat{\subsection}
  38 %{\color{red}\normalfont\large\bfseries}{\begin{flushright}\hfill\thesubsection
  39 %  \end{flushright}}{1em}{}
  40 %
  41 %\usepackage{pstricks}
  42
  43 % To create tables within multicols
  44 \makeatletter
  45 \newenvironment{ndtable}
  46   {\def\@captype{table}}
  47   {}
  48
  49
  50 \newcommand{\ndheading}[3]{%
  51 \vspace{0.5em}
  52 \begin{ndtable}%
  53 \rowcolors[\hline]{1}{#2}{} \arrayrulecolor{#3}
  54 \begin{tabularx}{\columnwidth}{>{\centering\arraybackslash}X}\vspace{-.5em}\normalfont\large\bfseries
  55   #1\\\end{tabularx}
  56 \end{ndtable}
  57 \vspace{-.5em}
  58 }
  59
  60 \newcommand{\ndsection}[1]{\ndheading{#1}{red!20}{red!30!gray}}
  61 \newcommand{\ndsubsection}[1]{\ndheading{#1}{red!10}{red!30!gray}}
  62
  63
  64 \begin{document}
  65
  66 %%
  67 %% DEBIAN
  68 %%
  69 \begin{multicols}{3}    % 3 columns
  70
  71 \begin{center}
  72 \noindent
  73 \includegraphics[width=0.5\columnwidth]{openlogo}
  74 %\includegraphics[width=0.5\columnwidth]{openlogo-vsop}
  75
  76 \url{http://www.debian.org}
  77 %\ndsection{Debian GNU/Linux}
  78
  79 \section*{The Universal Operating System}
  80 % \hrule
  81 \end{center}
  82 \vspace{-1em}
  83
  84 \ndsection{Debian}
  85
  86 was founded by Ian Murdock in August 1993 with the goal
  87 to create an easy to install and maintain non-commercial GNU/Linux
  88 operating system that would be able to compete in the
  89 commercial market.  Since then Debian established itself as an
  90 independent and unique project driven by more than 3000
  91 enthusiastic contributors all around the globe.
  92 Principles of \emph{do-ocracy} and democracy backed up by evolving transparent
  93 standards allowed Debian to deliver the most comprehensive operating system -- not
  94 only by amount of integrated software, but also by
  95 number of the supported hardware architectures.
  96 % Current installer of Debian has been translated more that to 60 languages.
  97 % (12 ???  officially supported architectures).
  98 % Well appreciated
  99 The high quality and openness of Debian made it the foundation of choice for
 100 more than 120 derivative GNU/Linux distributions, such as Ubuntu and
 101 Mint.
 102
 103 \ndsubsection{Debian is}
 104 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=0.8em]
 105 \item[V\textnormal{ersatile}]\hfill\url{http://packages.debian.org}\\
 106   Over 15000 software packages maintained by experts to provide
 107   a stable system for \textit{any} field of application.
 108 \item[S\textnormal{ecure}]\hfill\url{http://www.debian.org/security}\\
 109   Security updates guarantee safe operation.
 110 %\item[S]table
 111 % \item[S\textnormal{imple}]\blank\\
 112 %   Single command is enough to install or upgrade single
 113 %   software or the entire system at once
 114 \item[O\textnormal{pen}]\hfill\url{http://www.debian.org/social_contract}\\
 115   All software is free and open-source (FOSS).\\
 116   Debian is governed by public democratic processes.
 117 \item[P\textnormal{opular}]\hfill\url{http://www.debian.org/users}\\
 118   Used by governments, companies, educational institutions.
 119 \end{description}
 120
 121 \begin{comment}
 122 Original: Very Special Old Pale
 123
 124 Could also stand for
 125 Very (Special|Stable) Operating Platform
 126 \end{comment}
 127
 128 %\ndsection{Understand Debian}
 129 \columnbreak
 130 \ndsubsection{Three Debian suites}
 131
 132 % Debian distribution comes in 3 major flavors
 133
 134 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc,topsep=0em]
 135
 136 %\item[Unstable] \emph{Constantly changing distribution}\\
 137 \item[Development]\hfill\emph{Unstable} (always \emph{sid})\\
 138   Never \emph{released}, constantly evolving platform to integrate new
 139   versions of software into Debian.\\
 140   %entry point for the software to appear in Debian.\\
 141   Despite its name, \emph{Unstable} is a good platform for those
 142   requiring the most recent versions of software.
 143
 144 %\item[Testing] \emph{Constantly changing future release candidate}\\
 145 \item[``Almost-ready-to-release'']\hfill\emph{Testing} (now \emph{squeeze})\\
 146 %  What to become a next \emph{Stable} release candidate.\\
 147   Software versions known to be secure and of good quality.
 148 %  Software migrated from \emph{Unstable} which is known to be of good
 149 %  quality.  Immediate updates are provided only
 150 %  to assure secure and robust performance. \\
 151   \emph{Testing} provides a good balance between stability and recency
 152   of software.
 153
 154 %\item[Stable] \emph{Official release}\\
 155 \item[Official release]\hfill\emph{Stable} (now \emph{lenny})\\
 156   % Software verified to be well tested and secure,
 157   % Very stable (hence the name) and secure
 158   % but might be lacking the most recent versions.\\% of the software.\\
 159   % of not the most recent versions. \\
 160   \emph{Stable} is released ``when it is ready'', \emph{i.e.} when
 161   \emph{Testing} is assured to be robust. %, on average bi-yearly.
 162   Complementary updates keep the
 163   system secure. \\
 164   \emph{Stable} is the choice where stability and security are of
 165   primary importance.
 166 \end{description}
 167
 168 \begin{comment}
 169 \ndsubsection{It has names}
 170
 171 The code names of Debian releases are names of characters from the Toy
 172 Story animation, e.g. sid, squeeze, lenny.  \emph{Unstable}
 173 flavor always called \emph{sid}, while a new name chosen for every
 174 upcoming release and assigned to \emph{Testing} to become a code name
 175 of the release when it becomes \emph{Stable}.\\  At the moment
 176 \emph{squeeze} is \emph{Testing}, and \emph{lenny} is \emph{Stable}.
 177 As soon as \emph{squeeze} gets released, \emph{Testing} will be given
 178 a new name -- \emph{wheezy}.
 179 \end{comment}
 180
 181 \ndsubsection{Three Debian components}
 182
 183 % Debian distribution comes in 3 major flavors
 184 %Debian Free Software Guidelines (DFSG)\\
 185 %\url{http://www.debian.org/social_contract}
 186
 187 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc,topsep=0em]
 188 \item[Free as in freedom]\hfill\emph{main}\\
 189   % This is the actual Debian with full support.\\
 190   All software in \emph{main} is distributed under FOSS licenses
 191   compliant with Debian Free Software Guidelines (DFSG) to assure
 192   complete freedom to use, modify, and (re-)distribute.
 193 \item[Wanna-be free]\hfill\emph{contrib}\\
 194   FOSS depending on \emph{non-free} 3rd party software.
 195 %  Software which, despite being free itself, depends on
 196 %  \emph{non-free} 3rd party software, rendering it useless without
 197 \item[Somewhat free]\hfill\emph{non-free}\\
 198   Software under restrictive licenses available at no charge.
 199  % removing some freedoms
 200  % (\emph{e.g.} non-commercial use only), but which is allowed to be
 201  % used for free and re-distributed (\emph{e.g. NVidia drivers})
 202 \end{description}
 203
 204
 205 \ndsubsection{Debian enthusiastic experts}
 206 % could be simply 'Debian People' or 'Debian Community'
 207
 208 Debian is the only major operating system developed
 209 solely by volunteer individuals who collaborate via the Internet.
 210 Debian developers, teams or individual contributors improve the operating
 211 system not by writing new applications (in most cases), but by
 212 \begin{itemize}[nolistsep,topsep=0em,leftmargin=1pc]
 213 \item integrating existing software into Debian
 214 \item fixing and communicating bug reports to original developers
 215 \item assuring overall quality of the distribution
 216 \item improving documentation and translations
 217 \item providing user support
 218 \end{itemize}
 219
 220 Packaged software in Debian have individual maintainers who are
 221 often also users of a particular software, and who are therefore interested in its
 222 reliable operation. Certain fields of applications have dedicated maintainer
 223 teams, such as Debian-Science or Debian-Med.
 224
 225 %\columnbreak
 226 \ndsubsection{How to get Debian}
 227
 228 %\subsubsection*{Stable}
 229 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc,style=nextline]
 230 \item[Install on a hard-drive] \url{http://get.debian.net/}
 231 \item[Boot from CD/USB] \url{http://get.debian.net/live/}
 232 \item[Run in a Virtual Machine] \url{http://neuro.debian.net/vm.html}
 233 \item[More options (e.g. buy pre-installed machine)] \url{http://debian.org/distrib}
 234 \item[Testing/Unstable version] \url{http://www.debian.org/devel/debian-installer}
 235 \end{description}
 236
 237 % \ndsubsection{Get \emph{Testing/Unstable} Debian}
 238 %
 239 % Install on a hard-drive or in a Virtual Machine\\
 240 % \url{http://www.debian.org/devel/debian-installer}
 241 %
 242
 243 \ndsubsection{How to install software}
 244
 245 GUI (Synaptic): \textit{Select and click ``Apply''}\\
 246 \includegraphics[width=\columnwidth]{shots/synaptic-fslview}
 247
 248 Command line: \texttt{apt-get install <packagename>}
 249
 250
 251
 252 \ndsubsection{How to upgrade the entire system}
 253
 254 GUI (Synaptic):
 255
 256 \quad\textit{Click ``Mark All Upgrades'', ``Apply''}\\
 257 Command line:
 258
 259 \quad\texttt{apt-get update; apt-get dist-upgrade}
 260
 261 \ndsubsection{How to get support}
 262
 263 \url{http://www.debian.org/support}
 264
 265 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc,style=nextline]
 266 %\item[GUI]
 267 %  Use \emph{Synaptic Package Manager}
 268 \item[Software bug]
 269   \texttt{reportbug <packagename>}
 270 \item[Community support]
 271   %\begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc]
 272   %\item[Mailing lists]
 273   \url{http://www.debian.org/MailingLists}\\
 274   \url{http://forums.debian.net}\\
 275   \url{http://ask.debian.net}
 276   %\end{description}
 277 \item[Commercial support]
 278   \url{http://www.debian.org/consultants}
 279 \end{description}
 280
 281 \begin{comment}
 282 \ndsection{Reasons to choose Debian}
 283 \paragraph{It is maintained by its users}
 284
 285 If something needs to be fixed or improved, we just do it.
 286
 287 \paragraph{Unparalleled support}
 288
 289 Mail sent to the mailing lists often gets answers within 15 minutes (or less),
 290 for free, and by the people who developed it. Compare that to typical phone
 291 support: hours spent on the phone, for money, only to get someone who doesn't
 292 know the system well enough to even understand your question.
 293
 294 \paragraph{You wouldn't be alone in your choice}
 295
 296 A wide range of organizations and individuals use Debian. See our Who's Using
 297 Debian? page for a description of some high-profile sites which use Debian, and
 298 have chosen to submit a short description of how they use Debian and why.
 299
 300 \paragraph{The best packaging system in the world.}
 301
 302 Tired of old files from software three versions old cluttering your system? Or
 303 installing a piece of software only to find it causes your system to crash
 304 because of software conflicts? Dpkg, Debian's endured packaging system, takes
 305 care of these issues for you.
 306
 307 \paragraph{Easy installation}
 308
 309 If you have heard that GNU/Linux is difficult to install, then you haven't
 310 tried Debian lately. We are constantly improving the installation process. You
 311 can do the installation directly from CD, DOS, floppies or even over the
 312 network.
 313
 314 \paragraph{Incredible amounts of software}
 315
 316 Debian comes with over 25000 different pieces of software. Every bit of it is
 317 free. If you have proprietary software that runs under GNU/Linux, you can still
 318 use it - in fact, there may even be an installer in Debian that will
 319 automatically install and set up everything for you.
 320
 321 \paragraph{Packages well integrated}
 322
 323 Debian surpasses all other distributions in how well its packages are
 324 integrated. Since all software is packaged by a coherent group, not only can
 325 all packages be found at a single site, but you can be assured that we have
 326 already worked out all issues regarding complicated dependencies. While we feel
 327 that the deb format has some advantages over the rpm format, it is the
 328 integration between the packages that makes a Debian system more robust.
 329
 330 \paragraph{Source code}
 331
 332 If you are a software developer, you will appreciate the fact that there are
 333 hundreds of development tools and languages, plus millions of lines of source
 334 code in the base system. All of the software in the main distribution meets the
 335 criteria of the Debian Free Software Guidelines (DFSG). This means that you can
 336 freely use this code to study from, or to incorporate into new free software
 337 projects. There are also plenty of tools and code suitable for use in
 338 proprietary projects.
 339
 340 \paragraph{Easy upgrades}
 341
 342 Due to our packaging system, upgrading to a new version of Debian is a snap.
 343 Just run apt-get update ; apt-get dist-upgrade (or aptitude update; aptitude
 344 dist-upgrade in newer releases) and you can upgrade from a CD in a matter of
 345 minutes or point apt at one of the over 300 Debian mirrors and upgrade over the
 346 net.
 347
 348 \rotatebox{90}{\includegraphics[height=.9\columnwidth]{distro-dev}}
 349 \rotatebox{90}{Description}
 350
 351 \paragraph{Multiple architectures and kernels}
 352
 353 Currently Debian supports an impressive number of CPU architectures: alpha,
 354 amd64, armel, hppa, i386, ia64, mips, mipsel, powerpc, s390, and sparc. It also
 355 runs on GNU Hurd and FreeBSD kernels besides Linux, and with the debootstrap
 356 utility you will be hard-pressed to find a device that can't run Debian.
 357
 358 \paragraph{Bug tracking system}
 359
 360 Debian's bug tracking system is publicly available. We don't try to hide the
 361 fact that software doesn't always work the way users want. Users are encouraged
 362 to submit bug reports and are notified when and why the bug was closed. This
 363 system allows Debian to respond to problems quickly and honestly.
 364
 365
 366 \ndsection{Acknowledgements}
 367 \end{comment}
 368
 369 \end{multicols}
 370
 371
 372 \pagebreak
 373 %%
 374 %% NeuroDEBIAN
 375 %%
 376 \begin{multicols}{3}    % 3 columns
 377
 378 \begin{center}
 379 \noindent
 380 \vspace{-3em}
 381 \includegraphics[width=\columnwidth]{logo_tuned/label}
 382
 383 \url{http://neuro.debian.net}
 384 %\ndsection{NeuroDebian Project:}
 385 \section*{The Universal Research Platform}
 386 % \hrule
 387 \end{center}
 388 \vspace{-1em}
 389
 390 \ndsection{NeuroDebian is}
 391
 392 a Debian project aiming to provide the Neuroscience community with a
 393 stable and versatile research platform -- the Debian OS.
 394 Since 2005, NeuroDebian integrates neuroscience software into the Debian
 395 operating system to allow neuroscientists to benefit from the advantages of
 396 the universal operating system in their day-to-day research activities.
 397 The NeuroDebian repository
 398 (\url{http://neuro.debian.net}) offers the latest research software for
 399 all Debian suites (and various releases of Ubuntu).
 400 The combination of a stable generic
 401 operating system, Debian, and a variety of conveniently accessible research
 402 software creates a versatile research platform for neuroscience that offers the
 403 latest methodologies of the field for everyone, for free.
 404 These advantages make NeuroDebian increasingly popular among
 405 neuroscientists and scientific software developers.
 406
 407
 408 \ndsubsection{NeuroDebian is NOT}
 409
 410 yet another Debian GNU/Linux derivative distribution.  All work done
 411 by the NeuroDebian project targets the official Debian operating system. This
 412 approach helps to increase the longevity of the project by relying on the
 413 efforts of thousands of Debian contributors.
 414
 415
 416 \ndsubsection{Benefits from Debian integration}
 417
 418 \begin{itemize}[nolistsep,leftmargin=1pc]
 419
 420 % rephrase to outline the benefit, not burden
 421 \item Debian standards and policies guarantee quality and robustness
 422
 423 \item Debian centralized bug tracking system provides a unified
 424   single-point of entry for bug reporting and troubleshooting for any
 425   software in Debian
 426
 427 \item Debian makes software available through a world-wide distribution
 428   network, thus offloading bandwidth demands
 429
 430 \item Other Debian enthusiasts take care about large-scale aspects of
 431   deployment, quality assurance, porting and integration at the level
 432   of the entire distribution:
 433
 434 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc]
 435 \item[Porting] Software sources get built for 11 hardware
 436   architectures and 3 kernels (Linux, HURD, kFreeBSD). Porter teams
 437   maintain build infrastructure and help making the code
 438   platform-agnostic.
 439 \item[QA] Whole-archive rebuilds assure robustness of packaging and
 440   warn about upcoming problems (core libraries upgrades) beforehand.
 441 \item[Internationalization (I18n)] Translator teams help localizing
 442   software for more than 60 languages
 443 \end{description}
 444
 445 \item Neuroscience software becomes 1st-class citizen within Debian
 446   project, which guarantees its availability, longevity, smooth
 447   installation and upgrades
 448
 449 \item Participation in the Debian community helps to assure Debian's
 450   aptness for the neuroscientific software demands
 451
 452 \end{itemize}
 453
 454
 455 \ndsubsection{NeuroDebian software coverage}
 456 \begin{flushright}
 457 \vspace{-0.5em}
 458 \url{http://neuro.debian.net/pkgs.html}
 459 \vspace{-1em}
 460 \end{flushright}
 461 \textit{Electrophysiology:} BioSig, Sigviewer, Brian, \ldots\\
 462 \textit{Machine Learning:} PyMVPA, scikits.learn, \ldots\\
 463 \textit{Medical Imaging:} AFNI, FSL, Mricron, NiPy, Voxbo, \ldots\\
 464 \textit{Psychophysics:} PsychoPy, PyEPL, PyOptical\\
 465
 466
 467
 468 %\columnbreak
 469
 470 \ndsubsection{How to get NeuroDebian}
 471 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc]
 472 \item[Debian/Ubuntu]\url{neuro.debian.net} repository
 473 \item[Others] NeuroDebian Virtual Machine
 474 % Here place a left-top corner of OSX with seamless mode
 475 \end{description}
 476 \begin{comment}
 477 \ndsubsection{Developers oriented information}
 478
 479 %\columnbreak
 480
 481 \ndsubsection{Who is using NeuroDebian}
 482
 483 \noindent
 484 %\includegraphics[width=\columnwidth]{usage_worldmap}
 485
 486 buga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga duga
 487 \end{comment}
 488
 489 \def\blank{\hspace{0em}\vspace{-1em}}
 490 \columnbreak
 491 \ndsubsection{Work-in-progress}
 492
 493 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc,topsep=1em,style=nextline]
 494
 495 \item[Expanded coverage]\blank
 496   \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc,topsep=0em,style=nextline]
 497   \item[Electrophysiology] BioSig, Brian, NEURON, \ldots
 498   \item[Matlab/Octave toolboxes] SPM, EEGLAB, \ldots
 499   \end{description}
 500 \vspace{0.5em}
 501 \epigraph{Having FreeSurfer integrated into the Debian operating system by the NeuroDebian team would have enormous benefits for us, and for the thousands of users of FreeSurfer across the world.}{Prof. Bruce Fischl}{Director, Computational Core at Martinos Center at Massachusetts General Hospital, Charlestown, Massachusetts, USA}
 502 \item[Improved quality assurance]
 503   Extended integration and regression testing
 504 \item[Available snapshotting service]
 505   % Entire NeuroDebian repository for any given past moment
 506   All versions of packages readily available
 507 \item[Data as the 1st class citizen]
 508   \url{http://neuro.debian.net/datasets.html}
 509 \item[Universal availability]\blank
 510   % \begin{itemize}[nolistsep,leftmargin=1pc,topsep=0em]
 511   % \item Virtual Appliance enhancements
 512   %\item
 513   Cloud computing
 514   %\end{itemize}
 515
 516 \end{description}
 517
 518
 519 \ndsubsection{Testimonials}
 520 \begin{flushright}
 521 \vspace{-0.5em}
 522 \url{http://neuro.debian.net/testimonials.html}
 523 \vspace{-0.5em}
 524 \end{flushright}
 525
 526
 527 \epigraph{The approach taken with NeuroDebian is plainly the most appropriate
 528 approach to software distribution for the dominant platform in brain
 529 image analysis, and I have great confidence that this project will be
 530 a major asset to the neuroscience community in facilitating the
 531 distribution of stable software, improving the reliability and
 532 replicability of analyses, and in helping to improve software
 533 development practices.}{Prof. Daniel Y. Kimberg}{Director, Data
 534 Processing Facility, Center for Functional Neuroimaging, University of
 535 Pennsylvania, Philadelphia, USA}
 536
 537 \ndsubsection{Acknowledgements}
 538
 539 NeuroDebian is grateful to all Debian developers and contributors for the
 540 development of Debian OS, and to Prof. James V. Haxby (PBS Department,
 541 Dartmouth College) for his continued support and endless supply of
 542 Italian espresso (\url{http://neuro.debian.net/coffeeart.html}).
 543
 544 %\columnbreak
 545 \end{multicols}
 546
 547
 548
 549 \end{document}
 550
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