artwork/brochure/brochure_debian-neurodebian.tex

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   4
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   7 \usepackage{color}
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   9 \usepackage[colorlinks]{hyperref}
  10
  11 \usepackage{multicol}
  12 \setlength{\columnseprule}{1pt} % for visible divider
  13 \setlength{\columnsep}{1cm}
  14
  15 \usepackage{graphicx}
  16 \graphicspath{
  17  {../}
  18 }
  19
  20 \usepackage{enumitem}           % useful for control of listings
  21 \usepackage[compact,raggedleft]{titlesec}
  22 \usepackage{comment}
  23
  24 \newcommand{\epigraph}[3]{\textit{#1}\linebreak \vspace{-1.5em} \begin{flushright}\hspace{5em}\ --\ #2\linebreak\small{#3} \end{flushright}}
  25
  26 \pagestyle{empty}
  27 \parindent=0pt
  28
  29 % Attempts to change bg color of *section headings
  30 %\definecolor{secbgcol}{rgb}{0.9, 0.85, 0.85}
  31 %\titleformat{\section}
  32 %{\color{red}\normalfont\Large\bfseries}{\thesection}{1em}{}
  33 %\titleformat{\subsection}
  34 %{\color{red}\normalfont\large\bfseries}{\begin{flushright}\hfill\thesubsection
  35 %  \end{flushright}}{1em}{}
  36 %
  37
  38 \begin{document}
  39
  40 %%
  41 %% DEBIAN
  42 %%
  43 \begin{multicols}{3}    % 3 columns
  44
  45 \begin{center}
  46 \noindent
  47 \includegraphics[width=0.5\columnwidth]{openlogo}
  48 %\includegraphics[width=0.5\columnwidth]{openlogo-vsop}
  49
  50 \url{http://www.debian.org}
  51 %\section*{Debian GNU/Linux}
  52
  53 \section*{The Universal Operating System}
  54 \hrule
  55 \end{center}
  56 \vspace{-1em}
  57
  58 \section*{Debian project}
  59 was founded by Ian Murdock in August 1993 with the goal
  60 to create an easy to install and maintain non-commercial GNU/Linux
  61 distribution that would be able to effectively compete in the
  62 commercial market.  Since then Debian established itself as an
  63 independent and unique project driven by more than 3,000 of
  64 enthusiastic Debian developers and contributors all around the globe.
  65 Principles of \emph{do-ocracy} and democracy backed up by evolving open
  66 standards allowed Debian to deliver the comprehensive operating system largest not
  67 only in its coverage of integrated software, but also in the
  68 number of the supported hardware architectures.
  69 % Current installer of Debian has been translated more that to 60 languages.
  70 % (12 ???  officially supported architectures).
  71 % Well appreciated
  72 Acknowledged quality and openness of Debian made it the choice for
  73 more than 120 derivative GNU/Linux distributions, such as Ubuntu and
  74 Mint.
  75
  76 \subsection*{Debian is}
  77 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=0.8em]
  78 \item[V\textnormal{ersatile}]\hfill\url{http://packages.debian.org}\\
  79   Over 15,000 software products maintained to provide
  80   a stable system for any field of application
  81 \item[S\textnormal{ecure}]\hfill\url{http://www.debian.org/security}\\
  82   Security updates guarantee virus-free safe operation
  83 %\item[S]table
  84 % \item[S\textnormal{imple}]\blank\\
  85 %   Single command is enough to install or upgrade single
  86 %   software or the entire system at once
  87 \item[O\textnormal{pen}]\hfill\url{http://www.debian.org/social_contract}\\
  88   All software is free and open-source (FOSS).\\
  89   Debian project decisions are voted for in public
  90 \item[P\textnormal{opular}]\hfill\url{http://www.debian.org/users}\\
  91   Used by governments, companies, education institutions
  92 \end{description}
  93
  94 \begin{comment}
  95 Original: Very Special Old Pale
  96
  97 Could also stand for
  98 Very (Special|Stable) Operating Platform
  99 \end{comment}
 100
 101 %\section*{Understand Debian}
 102 \columnbreak
 103 \subsection*{Debian suites}
 104
 105 % Debian distribution comes in 3 major flavors
 106
 107 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc,topsep=1em]
 108
 109 %\item[Unstable] \emph{Constantly changing distribution}\\
 110 \item[Development]\hfill\emph{Unstable} (always \emph{sid})\\
 111   Never \emph{released}, constantly evolving platform to integrate new
 112   versions of software in Debian.\\
 113   %entry point for the software to appear in Debian.\\
 114   Despite its name, \emph{Unstable} is a good platform for those
 115   requiring the most recent versions of software
 116
 117 %\item[Testing] \emph{Constantly changing future release candidate}\\
 118 \item[``Always-ready-to-release'']  \emph{Testing} (now \emph{squeeze})\\
 119 %  What to become a next \emph{Stable} release candidate.\\
 120   Software versions known to be secure and of good quality.
 121 %  Software migrated from \emph{Unstable} which is known to be of good
 122 %  quality.  Immediate updates are provided only
 123 %  to assure secure and robust performance. \\
 124   \emph{Testing} provides a good balance between stability and recency
 125   of software
 126
 127 %\item[Stable] \emph{Official release}\\
 128 \item[Official release]\hfill\emph{Stable} (now \emph{lenny})\\
 129   % Software verified to be well tested and secure,
 130   % Very stable (hence the name) and secure
 131   % but might be lacking the most recent versions.\\% of the software.\\
 132   % of not the most recent versions. \\
 133   \emph{Stable} is released ``when it is ready'', \emph{i.e.} when
 134   \emph{Testing} is assured to be robust. %, on average bi-yearly.
 135   Complementary updates keep the
 136   system secure. \\
 137   \emph{Stable} is the choice where stability and security are of
 138   primary importance.
 139 \end{description}
 140
 141 \begin{comment}
 142 \subsection*{It has names}
 143
 144 The code names of Debian releases are names of characters from the Toy
 145 Story animation, e.g. sid, squeeze, lenny.  \emph{Unstable}
 146 flavor always called \emph{sid}, while a new name chosen for every
 147 upcoming release and assigned to \emph{Testing} to become a code name
 148 of the release when it becomes \emph{Stable}.\\  At the moment
 149 \emph{squeeze} is \emph{Testing}, and \emph{lenny} is \emph{Stable}.
 150 As soon as \emph{squeeze} gets released, \emph{Testing} will be given
 151 a new name -- \emph{wheezy}.
 152 \end{comment}
 153
 154 \subsection*{Debian components}
 155
 156 % Debian distribution comes in 3 major flavors
 157 %Debian Free Software Guidelines (DFSG)\\
 158 %\url{http://www.debian.org/social_contract}
 159
 160 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc,topsep=1em]
 161 \item[Free as in freedom]\hfill\emph{main}\\
 162   % This is the actual Debian with full support.\\
 163   All software in \emph{main} is distributed under FOSS licenses
 164   compliant with Debian Free Software Guidelines (DFSG) to assure
 165   complete freedom to use, modify, and (re-)distribute
 166 \item[Not free \emph{en bloc}]\hfill\emph{contrib}\\
 167   FOSS depending on \emph{non-free} 3rd party software
 168 %  Software which, despite being free itself, depends on
 169 %  \emph{non-free} 3rd party software, rendering it useless without
 170 \item[Somewhat free]\hfill\emph{non-free}\\
 171   Software under restrictive licenses
 172  % removing some freedoms
 173  % (\emph{e.g.} non-commercial use only), but which is allowed to be
 174  % used for free and re-distributed (\emph{e.g. NVidia drivers})
 175 \end{description}
 176
 177
 178 \subsection*{Debian is driven by enthusiastic experts}
 179 % could be simply 'Debian People' or 'Debian Community'
 180
 181 Debian is the only major Linux distribution developed
 182 cooperatively solely by individuals through the Internet, in the
 183 same spirit as Linux and other FOSS.\\
 184 Debian developers, teams and the community contribute to the
 185 project not by writing new applications (in most cases), but by
 186 \begin{itemize}[nolistsep,topsep=0em,leftmargin=1pc]
 187 \item integrating existing software into Debian
 188 \item fixing and communicating bug reports to upstream developers
 189 \item assuring overall quality of the distribution
 190 \item improving documentation and internationalization
 191 \item providing user support
 192 \end{itemize}
 193
 194 Packaged software in Debian have individual maintainers which are
 195 often also the users of that software, so they are interested in its
 196 reliable operation.  Individual maintainers often join the teams, such
 197 as Debian-Science or Debian-Med, based on the common field of
 198 interest.
 199
 200 %\columnbreak
 201 \subsection*{HOWTO get Debian}
 202
 203 %\subsubsection*{Stable}
 204 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc,style=nextline]
 205 \item[Install on a hard-drive] \url{http://get.debian.net/}
 206 \item[Boot from CD/USB] \url{http://get.debian.net/live/}
 207 \item[Run in a Virtual Machine] \url{http://neuro.debian.net/vm.html}
 208 \item[More options (e.g. buy pre-installed)] \url{http://debian.org/distrib}
 209 \item[Testing/Unstable version] \url{http://www.debian.org/devel/debian-installer}
 210 \end{description}
 211
 212 % \subsection*{Get \emph{Testing/Unstable} Debian}
 213 %
 214 % Install on a hard-drive or in a Virtual Machine\\
 215 % \url{http://www.debian.org/devel/debian-installer}
 216 %
 217
 218 \subsection*{HOWTO install software X}
 219
 220 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc,style=nextline]
 221
 222 \item[GUI (Synaptic Package Manager)]
 223 %  \emph{Synaptic Package Manager}
 224   Select X and click ``Apply''\\
 225   \includegraphics[width=0.95\columnwidth]{shots/synaptic-fslview}
 226 \item[Command line]
 227   apt-get install X
 228 \end{description}
 229
 230
 231
 232 \subsection*{HOWTO upgrade the entire system}
 233
 234 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc,style=nextline]
 235 \item[GUI (Synaptic Package Manager)]
 236   Click ``Mark All Upgrades'', ``Apply''
 237 \item[Command line]
 238   apt-get update; apt-get dist-upgrade
 239 \end{description}
 240
 241 \subsection*{HOWTO get support}
 242
 243 \url{http://www.debian.org/support}
 244
 245 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc,style=nextline]
 246 %\item[GUI]
 247 %  Use \emph{Synaptic Package Manager}
 248 \item[Software bug]
 249   reportbug X
 250 \item[Community support]
 251   %\begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc]
 252   %\item[Mailing lists]
 253   \url{http://www.debian.org/MailingLists}\\
 254   \url{http://forums.debian.net}\\
 255   \url{http://ask.debian.net}
 256   %\end{description}
 257 \item[Commercial support]
 258   \url{http://www.debian.org/consultants}
 259 \end{description}
 260
 261 \begin{comment}
 262 \section*{Reasons to choose Debian}
 263 \paragraph{It is maintained by its users}
 264
 265 If something needs to be fixed or improved, we just do it.
 266
 267 \paragraph{Unparalleled support}
 268
 269 Mail sent to the mailing lists often gets answers within 15 minutes (or less),
 270 for free, and by the people who developed it. Compare that to typical phone
 271 support: hours spent on the phone, for money, only to get someone who doesn't
 272 know the system well enough to even understand your question.
 273
 274 \paragraph{You wouldn't be alone in your choice}
 275
 276 A wide range of organizations and individuals use Debian. See our Who's Using
 277 Debian? page for a description of some high-profile sites which use Debian, and
 278 have chosen to submit a short description of how they use Debian and why.
 279
 280 \paragraph{The best packaging system in the world.}
 281
 282 Tired of old files from software three versions old cluttering your system? Or
 283 installing a piece of software only to find it causes your system to crash
 284 because of software conflicts? Dpkg, Debian's endured packaging system, takes
 285 care of these issues for you.
 286
 287 \paragraph{Easy installation}
 288
 289 If you have heard that GNU/Linux is difficult to install, then you haven't
 290 tried Debian lately. We are constantly improving the installation process. You
 291 can do the installation directly from CD, DOS, floppies or even over the
 292 network.
 293
 294 \paragraph{Incredible amounts of software}
 295
 296 Debian comes with over 25000 different pieces of software. Every bit of it is
 297 free. If you have proprietary software that runs under GNU/Linux, you can still
 298 use it - in fact, there may even be an installer in Debian that will
 299 automatically install and set up everything for you.
 300
 301 \paragraph{Packages well integrated}
 302
 303 Debian surpasses all other distributions in how well its packages are
 304 integrated. Since all software is packaged by a coherent group, not only can
 305 all packages be found at a single site, but you can be assured that we have
 306 already worked out all issues regarding complicated dependencies. While we feel
 307 that the deb format has some advantages over the rpm format, it is the
 308 integration between the packages that makes a Debian system more robust.
 309
 310 \paragraph{Source code}
 311
 312 If you are a software developer, you will appreciate the fact that there are
 313 hundreds of development tools and languages, plus millions of lines of source
 314 code in the base system. All of the software in the main distribution meets the
 315 criteria of the Debian Free Software Guidelines (DFSG). This means that you can
 316 freely use this code to study from, or to incorporate into new free software
 317 projects. There are also plenty of tools and code suitable for use in
 318 proprietary projects.
 319
 320 \paragraph{Easy upgrades}
 321
 322 Due to our packaging system, upgrading to a new version of Debian is a snap.
 323 Just run apt-get update ; apt-get dist-upgrade (or aptitude update; aptitude
 324 dist-upgrade in newer releases) and you can upgrade from a CD in a matter of
 325 minutes or point apt at one of the over 300 Debian mirrors and upgrade over the
 326 net.
 327
 328 \rotatebox{90}{\includegraphics[height=.9\columnwidth]{distro-dev}}
 329 \rotatebox{90}{Description}
 330
 331 \paragraph{Multiple architectures and kernels}
 332
 333 Currently Debian supports an impressive number of CPU architectures: alpha,
 334 amd64, armel, hppa, i386, ia64, mips, mipsel, powerpc, s390, and sparc. It also
 335 runs on GNU Hurd and FreeBSD kernels besides Linux, and with the debootstrap
 336 utility you will be hard-pressed to find a device that can't run Debian.
 337
 338 \paragraph{Bug tracking system}
 339
 340 Debian's bug tracking system is publicly available. We don't try to hide the
 341 fact that software doesn't always work the way users want. Users are encouraged
 342 to submit bug reports and are notified when and why the bug was closed. This
 343 system allows Debian to respond to problems quickly and honestly.
 344
 345
 346 \section*{Acknowledgements}
 347 \end{comment}
 348
 349 \end{multicols}
 350
 351
 352 \pagebreak
 353 %%
 354 %% NeuroDEBIAN
 355 %%
 356 \begin{multicols}{3}    % 3 columns
 357
 358 \begin{center}
 359 \noindent
 360 \vspace{-3em}
 361 \includegraphics[width=\columnwidth]{logo_tuned/label}
 362
 363 \url{http://neuro.debian.net}
 364 %\section*{NeuroDebian Project:}
 365 \section*{The Ultimate Research Platform}
 366 \hrule
 367
 368 \end{center}
 369
 370 \section*{NeuroDebian}
 371
 372 is a Debian project aiming to provide Neuroscience community with a
 373 stable and versatile research platform -- the Debian OS.  NeuroDebian
 374 (formerly known as Experimental Psychology, ExpPsy) was initiated in
 375 2006 to provide packaging of PyEPL and FSL software so they could
 376 become an integral part of Debian, thus seamlessly available to users
 377 of Debian or any derived distribution.  Since 2006 software coverage
 378 of NeuroDebian increased more than ten-fold.  NeuroDebian repository
 379 \url{http://neuro.debian.net} makes recent versions of the software
 380 available not only for the \emph{Development} but also for previous
 381 releases of Debian and Ubuntu.  The tandem of a stable generic
 382 operating system, Debian, together with new versions of research
 383 software from NeuroDebian repository compose the ultimate research
 384 platform -- stable versatile environment with recent neuroscientific
 385 methodologies just 1-click away.  Such stability, ease of software
 386 installation and system maintenance and constantly growing coverage of
 387 software solutions made NeuroDebian project popular among
 388 neuroscientists and scientific software developers.
 389
 390
 391 \subsection*{NeuroDebian is NOT}
 392
 393 a yet another Debian GNU/Linux derivative distribution.  All work done
 394 within NeuroDebian project targets software inclusion in the official
 395 Debian distribution.
 396
 397
 398 \subsection*{Advantages from Debian integration}
 399
 400 \begin{itemize}[nolistsep,leftmargin=1pc]
 401
 402 % rephrase to outline the benefit, not burden
 403 \item Debian standards and policies guaranty quality and robustness
 404
 405 \item Debian centralized bug tracking system provides a unified
 406   single-point of entry for bug reporting and troubleshooting for any
 407   software in Debian
 408
 409 \item Debian makes software available within world-wide distribution
 410   network, thus offloading bandwidth demands
 411
 412 \item Other Debian enthusiasts take care about large-scale aspects of
 413   deployment, quality assurance, porting and integration at the level
 414   of the entire distribution:
 415
 416 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc]
 417 \item[Porting] Software sources get built for 11 hardware
 418   architectures and 3 kernels (Linux, HURD, kFreeBSD). Ports teams
 419   maintain build infrastructure and help making the code
 420   platform-agnostic.
 421 \item[QA] Whole-archive rebuilds assure robustness of packaging and
 422   warn about upcoming problems (core libraries upgrades) beforehand.
 423 \item[Internationalization (I18n)] I18n teams contribute by localizing
 424   software for more than 50 languages
 425 \end{description}
 426
 427 \item Neuroscience software becomes 1st-class citizen within Debian
 428   project, which guarantees its availability, longevity, smooth
 429   installation and upgrades
 430
 431 \item Participation in the Debian community helps to assure Debian's
 432   aptness for the neuroscientific software demands
 433
 434 \end{itemize}
 435
 436
 437 \subsection*{NeuroDebian coverage}
 438 \begin{flushright}
 439 \vspace{-0.5em}
 440 \url{http://neuro.debian.net/pkgs.html}
 441 \vspace{-1em}
 442 \end{flushright}
 443 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc,topsep=0em]
 444 \item[Electrophysiology] BioSig, Sigviewer, Brian, \ldots
 445 \item[Machine Learning] PyMVPA, scikits.learn, \ldots
 446 \item[Medical Imaging] AFNI, Caret, FSL, Mricron, NiPy, Voxbo, \ldots
 447 \item[Psychophysics] PsychoPy, PyEPL
 448 \end{description}
 449
 450
 451
 452 %\columnbreak
 453
 454 \subsection*{HOWTO get NeuroDebian}
 455 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc]
 456 \item[Debian/Ubuntu]\url{neuro.debian.net} repository
 457 \item[Others] NeuroDebian Virtual Machine
 458 % Here place a left-top corner of OSX with seamless mode
 459 \end{description}
 460 \begin{comment}
 461 \subsection*{Developers oriented information}
 462
 463 %\columnbreak
 464
 465 \subsection*{Who is using NeuroDebian}
 466
 467 \noindent
 468 %\includegraphics[width=\columnwidth]{usage_worldmap}
 469
 470 buga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga duga
 471 \end{comment}
 472
 473 \def\blank{\hspace{0em}\vspace{-1em}}
 474 \columnbreak
 475 \subsection*{Work-in-progress}
 476
 477 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc,topsep=1em,style=nextline]
 478
 479 \item[Expanded coverage]\blank
 480   \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc,topsep=0em,style=nextline]
 481   \item[Electrophysiology] BioSig, Brian, NEURON, \ldots
 482   \item[Matlab/Octave toolboxes] SPM, EEGLAB, \ldots
 483   \end{description}
 484 \vspace{0.5em}
 485 \epigraph{Having FreeSurfer integrated into the Debian operating system by the NeuroDebian team would have enormous benefits for us, and for the thousands of users of FreeSurfer across the world.}{Prof. Bruce Fischl}{Director, Computational Core at Martinos Center at Massachusetts General Hospital, Charlestown, Massachusetts, USA}
 486 \item[Improved quality assurance]
 487   Extended integration and regression testing
 488 \item[Available snapshotting service]
 489   % Entire NeuroDebian repository for any given past moment
 490   All versions of packages readily available
 491 \item[Data as the 1st class citizen]
 492   \url{http://neuro.debian.net/datasets.html}
 493 \item[Universal availability]\blank
 494   % \begin{itemize}[nolistsep,leftmargin=1pc,topsep=0em]
 495   % \item Virtual Appliance enhancements
 496   %\item
 497   Cloud computing
 498   %\end{itemize}
 499
 500 \end{description}
 501
 502
 503 \subsection*{Testimonials}
 504 \begin{flushright}
 505 \vspace{-0.5em}
 506 \url{http://neuro.debian.net/testimonials.html}
 507 \vspace{-1em}
 508 \end{flushright}
 509
 510
 511 \epigraph{The approach taken with NeuroDebian is plainly the most appropriate
 512 approach to software distribution for the dominant platform in brain
 513 image analysis, and I have great confidence that this project will be
 514 a major asset to the neuroscience community in facilitating the
 515 distribution of stable software, improving the reliability and
 516 replicability of analyses, and in helping to improve software
 517 development practices.}{Prof. Daniel Y. Kimberg}{Director, Data
 518 Processing Facility, Center for Functional Neuroimaging, University of
 519 Pennsylvania, Philadelphia, USA}
 520
 521 \subsection*{Acknowledgements}
 522
 523 We are grateful to all Debian developers and contributors for the
 524 development of Debian OS, and to Prof. James V. Haxby (PBS Department,
 525 Dartmouth College) for his continued support and endless supply of
 526 Italian espresso (\url{http://neuro.debian.net/coffeeart.html}).
 527
 528 %\columnbreak
 529 \end{multicols}
 530
 531
 532
 533 \end{document}
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