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[neurodebian.git] / artwork / brochure / brochure_debian-neurodebian.tex
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2 % ex: set sts=4 ts=4 sw=4 et tw=70:
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4
5 \documentclass[letterpaper,landscape]{report}
6 \usepackage[landscape,margin=0.5cm]{geometry}
7 \usepackage{color}
8 \usepackage{flowfram}
9 \usepackage[colorlinks]{hyperref}
10
11 \usepackage{multicol}
12 \setlength{\columnseprule}{1pt} % for visible divider
13 \setlength{\columnsep}{1cm}
14
15 \usepackage{graphicx}
16 \graphicspath{
17  {../}
18 }
19
20 \usepackage{enumitem}           % useful for control of listings
21 \usepackage[compact,raggedright]{titlesec}
22 \usepackage{comment}
23
24 \newcommand{\epigraph}[3]{\textit{#1}\linebreak \vspace{-1.5em} \begin{flushright}\hspace{5em}\ --\ #2\linebreak\small{#3} \end{flushright}}
25
26 \pagestyle{empty}
27 \parindent=0pt
28
29 % Attempts to change bg color of *section headings
30 %\definecolor{secbgcol}{rgb}{0.9, 0.85, 0.85}
31 %\titleformat{\section}
32 %{\color{red}\normalfont\Large\bfseries}{\thesection}{1em}{}
33 %\titleformat{\subsection}
34 %{\color{red}\normalfont\large\bfseries}{\begin{flushright}\hfill\thesubsection
35 %  \end{flushright}}{1em}{}
36 %
37
38 \begin{document}
39
40 %%
41 %% DEBIAN
42 %%
43 \begin{multicols}{3}    % 3 columns
44
45 \begin{center}
46 \noindent
47 \includegraphics[width=0.5\columnwidth]{openlogo}
48 %\includegraphics[width=0.5\columnwidth]{openlogo-vsop}
49
50 \url{http://www.debian.org}
51 %\section*{Debian GNU/Linux}
52
53 \section*{The Universal Operating System}
54 \hrule
55 \end{center}
56 \vspace{-1em}
57
58 \section*{Debian project}
59 was founded by Ian Murdock in August 1993 with the goal
60 to create an easy to install and maintain non-commercial GNU/Linux
61 distribution that would be able to effectively compete in the
62 commercial market.  Since then Debian established itself as an
63 independent and unique project driven by more than 3000
64 enthusiastic contributors all around the globe.
65 Principles of \emph{do-ocracy} and democracy backed up by evolving transparent
66 standards allowed Debian to deliver the most comprehensive operating system -- not
67 only by amount of integrated software, but also by
68 number of the supported hardware architectures.
69 % Current installer of Debian has been translated more that to 60 languages.
70 % (12 ???  officially supported architectures).
71 % Well appreciated
72 Widely acknowledged quality and openness of Debian made it the foundation of choice for
73 more than 120 derivative GNU/Linux distributions, such as Ubuntu and
74 Mint.
75
76 \subsection*{Debian is}
77 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=0.8em]
78 \item[V\textnormal{ersatile}]\hfill\url{http://packages.debian.org}\\
79   Over 15000 software packages maintained by experts to provide
80   a stable system for \textit{any} field of application.
81 \item[S\textnormal{ecure}]\hfill\url{http://www.debian.org/security}\\
82   Security updates guarantee safe operation.
83 %\item[S]table
84 % \item[S\textnormal{imple}]\blank\\
85 %   Single command is enough to install or upgrade single
86 %   software or the entire system at once
87 \item[O\textnormal{pen}]\hfill\url{http://www.debian.org/social_contract}\\
88   All software is free and open-source (FOSS).\\
89   Debian is governed by public democratic processes.
90 \item[P\textnormal{opular}]\hfill\url{http://www.debian.org/users}\\
91   Used by governments, companies, educational institutions
92 \end{description}
93
94 \begin{comment}
95 Original: Very Special Old Pale
96
97 Could also stand for
98 Very (Special|Stable) Operating Platform
99 \end{comment}
100
101 %\section*{Understand Debian}
102 \columnbreak
103 \subsection*{Three Debian suites}
104
105 % Debian distribution comes in 3 major flavors
106
107 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc,topsep=1em]
108
109 %\item[Unstable] \emph{Constantly changing distribution}\\
110 \item[Development]\hfill\emph{Unstable} (always \emph{sid})\\
111   Never \emph{released}, constantly evolving platform to integrate new
112   versions of software in Debian.\\
113   %entry point for the software to appear in Debian.\\
114   Despite its name, \emph{Unstable} is a good platform for those
115   requiring the most recent versions of software
116
117 %\item[Testing] \emph{Constantly changing future release candidate}\\
118 \item[``Always-ready-to-release'']\hfill\emph{Testing} (now \emph{squeeze})\\
119 %  What to become a next \emph{Stable} release candidate.\\
120   Software versions known to be secure and of good quality.
121 %  Software migrated from \emph{Unstable} which is known to be of good
122 %  quality.  Immediate updates are provided only
123 %  to assure secure and robust performance. \\
124   \emph{Testing} provides a good balance between stability and recency
125   of software
126
127 %\item[Stable] \emph{Official release}\\
128 \item[Official release]\hfill\emph{Stable} (now \emph{lenny})\\
129   % Software verified to be well tested and secure,
130   % Very stable (hence the name) and secure
131   % but might be lacking the most recent versions.\\% of the software.\\
132   % of not the most recent versions. \\
133   \emph{Stable} is released ``when it is ready'', \emph{i.e.} when
134   \emph{Testing} is assured to be robust. %, on average bi-yearly.
135   Complementary updates keep the
136   system secure. \\
137   \emph{Stable} is the choice where stability and security are of
138   primary importance.
139 \end{description}
140
141 \begin{comment}
142 \subsection*{It has names}
143
144 The code names of Debian releases are names of characters from the Toy
145 Story animation, e.g. sid, squeeze, lenny.  \emph{Unstable}
146 flavor always called \emph{sid}, while a new name chosen for every
147 upcoming release and assigned to \emph{Testing} to become a code name
148 of the release when it becomes \emph{Stable}.\\  At the moment
149 \emph{squeeze} is \emph{Testing}, and \emph{lenny} is \emph{Stable}.
150 As soon as \emph{squeeze} gets released, \emph{Testing} will be given
151 a new name -- \emph{wheezy}.
152 \end{comment}
153
154 \subsection*{Three Debian components}
155
156 % Debian distribution comes in 3 major flavors
157 %Debian Free Software Guidelines (DFSG)\\
158 %\url{http://www.debian.org/social_contract}
159
160 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc,topsep=1em]
161 \item[Free as in freedom]\hfill\emph{main}\\
162   % This is the actual Debian with full support.\\
163   All software in \emph{main} is distributed under FOSS licenses
164   compliant with Debian Free Software Guidelines (DFSG) to assure
165   complete freedom to use, modify, and (re-)distribute
166 \item[Wanna-be free]\hfill\emph{contrib}\\
167   FOSS depending on \emph{non-free} 3rd party software
168 %  Software which, despite being free itself, depends on
169 %  \emph{non-free} 3rd party software, rendering it useless without
170 \item[Somewhat free]\hfill\emph{non-free}\\
171   Software under restrictive licenses available at no charge
172  % removing some freedoms
173  % (\emph{e.g.} non-commercial use only), but which is allowed to be
174  % used for free and re-distributed (\emph{e.g. NVidia drivers})
175 \end{description}
176
177
178 \subsection*{Debian is driven by enthusiastic experts}
179 % could be simply 'Debian People' or 'Debian Community'
180
181 Debian is the only major operating system developed
182 solely by volunteer individuals that collaborate via the Internet.
183 Debian developers, teams or individual contributors improve the operating
184 system not by writing new applications (in most cases), but by
185 \begin{itemize}[nolistsep,topsep=0em,leftmargin=1pc]
186 \item integrating existing software into Debian
187 \item fixing and communicating bug reports to original developers
188 \item assuring overall quality of the distribution
189 \item improving documentation and translations
190 \item providing user support
191 \end{itemize}
192
193 Packaged software in Debian have individual maintainers which are
194 often also users of a particular software, and are therefore interested in its
195 reliable operation. Certain field of applications have dedicated maintainer
196 teams, such as Debian-Science or Debian-Med.
197
198 %\columnbreak
199 \subsection*{How to get Debian}
200
201 %\subsubsection*{Stable}
202 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc,style=nextline]
203 \item[Install on a hard-drive] \url{http://get.debian.net/}
204 \item[Boot from CD/USB] \url{http://get.debian.net/live/}
205 \item[Run in a Virtual Machine] \url{http://neuro.debian.net/vm.html}
206 \item[More options (e.g. buy pre-installed machine)] \url{http://debian.org/distrib}
207 \item[Testing/Unstable version] \url{http://www.debian.org/devel/debian-installer}
208 \end{description}
209
210 % \subsection*{Get \emph{Testing/Unstable} Debian}
211 %
212 % Install on a hard-drive or in a Virtual Machine\\
213 % \url{http://www.debian.org/devel/debian-installer}
214 %
215
216 \subsection*{How to install software}
217
218 GUI (Synaptic): \textit{Select and click ``Apply''}\\
219 \includegraphics[width=\columnwidth]{shots/synaptic-fslview}
220
221 Command line: \texttt{apt-get install <packagename>}
222
223
224
225 \subsection*{How to upgrade the entire system}
226
227 GUI (Synaptic):
228
229 \quad\textit{Click ``Mark All Upgrades'', ``Apply''}\\
230 Command line:
231
232 \quad\texttt{apt-get update; apt-get dist-upgrade}
233
234 \subsection*{How to get support}
235
236 \url{http://www.debian.org/support}
237
238 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc,style=nextline]
239 %\item[GUI]
240 %  Use \emph{Synaptic Package Manager}
241 \item[Software bug]
242   \texttt{reportbug <packagename>}
243 \item[Community support]
244   %\begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc]
245   %\item[Mailing lists] 
246   \url{http://www.debian.org/MailingLists}\\
247   \url{http://forums.debian.net}\\
248   \url{http://ask.debian.net}
249   %\end{description}
250 \item[Commercial support]
251   \url{http://www.debian.org/consultants}
252 \end{description}
253
254 \begin{comment}
255 \section*{Reasons to choose Debian}
256 \paragraph{It is maintained by its users}
257
258 If something needs to be fixed or improved, we just do it.
259
260 \paragraph{Unparalleled support}
261
262 Mail sent to the mailing lists often gets answers within 15 minutes (or less),
263 for free, and by the people who developed it. Compare that to typical phone
264 support: hours spent on the phone, for money, only to get someone who doesn't
265 know the system well enough to even understand your question.
266
267 \paragraph{You wouldn't be alone in your choice}
268
269 A wide range of organizations and individuals use Debian. See our Who's Using
270 Debian? page for a description of some high-profile sites which use Debian, and
271 have chosen to submit a short description of how they use Debian and why.
272
273 \paragraph{The best packaging system in the world.}
274
275 Tired of old files from software three versions old cluttering your system? Or
276 installing a piece of software only to find it causes your system to crash
277 because of software conflicts? Dpkg, Debian's endured packaging system, takes
278 care of these issues for you.
279
280 \paragraph{Easy installation}
281
282 If you have heard that GNU/Linux is difficult to install, then you haven't
283 tried Debian lately. We are constantly improving the installation process. You
284 can do the installation directly from CD, DOS, floppies or even over the
285 network.
286
287 \paragraph{Incredible amounts of software}
288
289 Debian comes with over 25000 different pieces of software. Every bit of it is
290 free. If you have proprietary software that runs under GNU/Linux, you can still
291 use it - in fact, there may even be an installer in Debian that will
292 automatically install and set up everything for you.
293
294 \paragraph{Packages well integrated}
295
296 Debian surpasses all other distributions in how well its packages are
297 integrated. Since all software is packaged by a coherent group, not only can
298 all packages be found at a single site, but you can be assured that we have
299 already worked out all issues regarding complicated dependencies. While we feel
300 that the deb format has some advantages over the rpm format, it is the
301 integration between the packages that makes a Debian system more robust.
302
303 \paragraph{Source code}
304
305 If you are a software developer, you will appreciate the fact that there are
306 hundreds of development tools and languages, plus millions of lines of source
307 code in the base system. All of the software in the main distribution meets the
308 criteria of the Debian Free Software Guidelines (DFSG). This means that you can
309 freely use this code to study from, or to incorporate into new free software
310 projects. There are also plenty of tools and code suitable for use in
311 proprietary projects.
312
313 \paragraph{Easy upgrades}
314
315 Due to our packaging system, upgrading to a new version of Debian is a snap.
316 Just run apt-get update ; apt-get dist-upgrade (or aptitude update; aptitude
317 dist-upgrade in newer releases) and you can upgrade from a CD in a matter of
318 minutes or point apt at one of the over 300 Debian mirrors and upgrade over the
319 net.
320
321 \rotatebox{90}{\includegraphics[height=.9\columnwidth]{distro-dev}}
322 \rotatebox{90}{Description}
323
324 \paragraph{Multiple architectures and kernels}
325
326 Currently Debian supports an impressive number of CPU architectures: alpha,
327 amd64, armel, hppa, i386, ia64, mips, mipsel, powerpc, s390, and sparc. It also
328 runs on GNU Hurd and FreeBSD kernels besides Linux, and with the debootstrap
329 utility you will be hard-pressed to find a device that can't run Debian.
330
331 \paragraph{Bug tracking system}
332
333 Debian's bug tracking system is publicly available. We don't try to hide the
334 fact that software doesn't always work the way users want. Users are encouraged
335 to submit bug reports and are notified when and why the bug was closed. This
336 system allows Debian to respond to problems quickly and honestly.
337
338
339 \section*{Acknowledgements}
340 \end{comment}
341
342 \end{multicols}
343
344
345 \pagebreak
346 %%
347 %% NeuroDEBIAN
348 %%
349 \begin{multicols}{3}    % 3 columns
350
351 \begin{center}
352 \noindent
353 \vspace{-3em}
354 \includegraphics[width=\columnwidth]{logo_tuned/label}
355
356 \url{http://neuro.debian.net}
357 %\section*{NeuroDebian Project:}
358 \section*{The Ultimate Research Platform}
359 \hrule
360
361 \end{center}
362
363 \section*{NeuroDebian}
364
365 is a Debian project aiming to provide Neuroscience community with a
366 stable and versatile research platform -- the Debian OS.  NeuroDebian
367 (formerly known as Experimental Psychology, ExpPsy) was initiated in
368 2006 to provide packaging of PyEPL and FSL software so they could
369 become an integral part of Debian, thus seamlessly available to users
370 of Debian or any derived distribution.  Since 2006 software coverage
371 of NeuroDebian increased more than ten-fold.  NeuroDebian repository
372 \url{http://neuro.debian.net} makes recent versions of the software
373 available not only for the \emph{Development} but also for previous
374 releases of Debian and Ubuntu.  The tandem of a stable generic
375 operating system, Debian, together with new versions of research
376 software from NeuroDebian repository compose the ultimate research
377 platform -- stable versatile environment with recent neuroscientific
378 methodologies just 1-click away.  Such stability, ease of software
379 installation and system maintenance and constantly growing coverage of
380 software solutions made NeuroDebian project popular among
381 neuroscientists and scientific software developers.
382
383
384 \subsection*{NeuroDebian is NOT}
385
386 a yet another Debian GNU/Linux derivative distribution.  All work done
387 within NeuroDebian project targets software inclusion in the official
388 Debian distribution.
389
390
391 \subsection*{Benefits from Debian integration}
392
393 \begin{itemize}[nolistsep,leftmargin=1pc]
394
395 % rephrase to outline the benefit, not burden
396 \item Debian standards and policies guaranty quality and robustness
397
398 \item Debian centralized bug tracking system provides a unified
399   single-point of entry for bug reporting and troubleshooting for any
400   software in Debian
401
402 \item Debian makes software available within world-wide distribution
403   network, thus offloading bandwidth demands
404
405 \item Other Debian enthusiasts take care about large-scale aspects of
406   deployment, quality assurance, porting and integration at the level
407   of the entire distribution:
408
409 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc]
410 \item[Porting] Software sources get built for 11 hardware
411   architectures and 3 kernels (Linux, HURD, kFreeBSD). Ports teams
412   maintain build infrastructure and help making the code
413   platform-agnostic.
414 \item[QA] Whole-archive rebuilds assure robustness of packaging and
415   warn about upcoming problems (core libraries upgrades) beforehand.
416 \item[Internationalization (I18n)] I18n teams contribute by localizing
417   software for more than 50 languages
418 \end{description}
419
420 \item Neuroscience software becomes 1st-class citizen within Debian
421   project, which guarantees its availability, longevity, smooth
422   installation and upgrades
423
424 \item Participation in the Debian community helps to assure Debian's
425   aptness for the neuroscientific software demands
426
427 \end{itemize}
428
429
430 \subsection*{NeuroDebian coverage}
431 \begin{flushright}
432 \vspace{-0.5em}
433 \url{http://neuro.debian.net/pkgs.html}
434 \vspace{-1em}
435 \end{flushright}
436 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc,topsep=0em]
437 \item[Electrophysiology] BioSig, Sigviewer, Brian, \ldots
438 \item[Machine Learning] PyMVPA, scikits.learn, \ldots
439 \item[Medical Imaging] AFNI, Caret, FSL, Mricron, NiPy, Voxbo, \ldots
440 \item[Psychophysics] PsychoPy, PyEPL
441 \end{description}
442
443
444
445 %\columnbreak
446
447 \subsection*{HOWTO get NeuroDebian}
448 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc]
449 \item[Debian/Ubuntu]\url{neuro.debian.net} repository
450 \item[Others] NeuroDebian Virtual Machine
451 % Here place a left-top corner of OSX with seamless mode
452 \end{description}
453 \begin{comment}
454 \subsection*{Developers oriented information}
455
456 %\columnbreak
457
458 \subsection*{Who is using NeuroDebian}
459
460 \noindent
461 %\includegraphics[width=\columnwidth]{usage_worldmap}
462
463 buga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga duga
464 \end{comment}
465
466 \def\blank{\hspace{0em}\vspace{-1em}}
467 \columnbreak
468 \subsection*{Work-in-progress}
469
470 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc,topsep=1em,style=nextline]
471
472 \item[Expanded coverage]\blank
473   \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc,topsep=0em,style=nextline]
474   \item[Electrophysiology] BioSig, Brian, NEURON, \ldots
475   \item[Matlab/Octave toolboxes] SPM, EEGLAB, \ldots
476   \end{description}
477 \vspace{0.5em}
478 \epigraph{Having FreeSurfer integrated into the Debian operating system by the NeuroDebian team would have enormous benefits for us, and for the thousands of users of FreeSurfer across the world.}{Prof. Bruce Fischl}{Director, Computational Core at Martinos Center at Massachusetts General Hospital, Charlestown, Massachusetts, USA}
479 \item[Improved quality assurance]
480   Extended integration and regression testing
481 \item[Available snapshotting service]
482   % Entire NeuroDebian repository for any given past moment
483   All versions of packages readily available
484 \item[Data as the 1st class citizen]
485   \url{http://neuro.debian.net/datasets.html}
486 \item[Universal availability]\blank
487   % \begin{itemize}[nolistsep,leftmargin=1pc,topsep=0em]
488   % \item Virtual Appliance enhancements
489   %\item
490   Cloud computing
491   %\end{itemize}
492
493 \end{description}
494
495
496 \subsection*{Testimonials}
497 \begin{flushright}
498 \vspace{-0.5em}
499 \url{http://neuro.debian.net/testimonials.html}
500 \vspace{-1em}
501 \end{flushright}
502
503
504 \epigraph{The approach taken with NeuroDebian is plainly the most appropriate
505 approach to software distribution for the dominant platform in brain
506 image analysis, and I have great confidence that this project will be
507 a major asset to the neuroscience community in facilitating the
508 distribution of stable software, improving the reliability and
509 replicability of analyses, and in helping to improve software
510 development practices.}{Prof. Daniel Y. Kimberg}{Director, Data
511 Processing Facility, Center for Functional Neuroimaging, University of
512 Pennsylvania, Philadelphia, USA}
513
514 \subsection*{Acknowledgements}
515
516 We are grateful to all Debian developers and contributors for the
517 development of Debian OS, and to Prof. James V. Haxby (PBS Department,
518 Dartmouth College) for his continued support and endless supply of
519 Italian espresso (\url{http://neuro.debian.net/coffeeart.html}).
520
521 %\columnbreak
522 \end{multicols}
523
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526 \end{document}
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