artwork/brochure/brochure_debian-neurodebian.tex

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   4
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   7 \usepackage{color}
   8 \usepackage{flowfram}
   9 \usepackage[colorlinks]{hyperref}
  10
  11 \usepackage{multicol}
  12 \setlength{\columnseprule}{1pt} % for visible divider
  13 \setlength{\columnsep}{1cm}
  14
  15 \usepackage{graphicx}
  16 \graphicspath{
  17  {../}
  18 }
  19
  20 \usepackage{enumitem}           % useful for control of listings
  21 \usepackage[compact,raggedleft]{titlesec}
  22 \usepackage{comment}
  23
  24 \newcommand{\epigraph}[3]{\textit{#1}\linebreak \vspace{-1.5em} \begin{flushright}\hspace{5em}\ --\ #2\linebreak\small{#3} \end{flushright}}
  25
  26 \pagestyle{empty}
  27 \parindent=0pt
  28
  29 % Attempts to change bg color of *section headings
  30 %\definecolor{secbgcol}{rgb}{0.9, 0.85, 0.85}
  31 %\titleformat{\section}
  32 %{\color{red}\normalfont\Large\bfseries}{\thesection}{1em}{}
  33 %\titleformat{\subsection}
  34 %{\color{red}\normalfont\large\bfseries}{\begin{flushright}\hfill\thesubsection
  35 %  \end{flushright}}{1em}{}
  36 %
  37
  38 \begin{document}
  39
  40 %%
  41 %% DEBIAN
  42 %%
  43 \begin{multicols}{3}    % 3 columns
  44
  45 \begin{center}
  46 \noindent
  47 %\includegraphics[width=0.5\columnwidth]{openlogo}
  48 \includegraphics[width=0.5\columnwidth]{openlogo-vsop}
  49
  50 \url{http://www.debian.org}
  51 %\section*{Debian GNU/Linux}
  52
  53 \section*{The Universal Operating System}
  54 \end{center}
  55 \noindent
  56 Debian project was founded by Ian Murdock in August 1993 with the goal
  57 to create an easy to install and maintain non-commercial GNU/Linux
  58 distribution that would be able to effectively compete in the
  59 commercial market.  Since then Debian established itself as an
  60 independent and unique project driven by more than 3,000 of
  61 enthusiastic Debian developers and contributors all around the globe.
  62 Principles of \emph{do-ocracy} and democracy backed up by evolving open
  63 standards allowed Debian to deliver the comprehensive operating system largest not
  64 only in its coverage of integrated software, but also in the
  65 number of the supported hardware architectures.
  66 % Current installer of Debian has been translated more that to 60 languages.
  67 % (12 ???  officially supported architectures).
  68 % Well appreciated
  69 Acknowledged quality and openness of Debian made it the choice for
  70 more than 120 derivative GNU/Linux distributions, such as Ubuntu and
  71 Mint.
  72
  73 \subsection*{Debian is}
  74 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=0.8em,style=nextline]
  75 \item[V\textnormal{ersatile}] Over 15,000 software products maintained to provide
  76   a secure and stable system for any field of application
  77   (\url{http://packages.debian.org})
  78 %\item[S]ecure
  79 %\item[S]table
  80 \item[S\textnormal{imple}] Single command is enough to install or upgrade single
  81   software or the entire system at once
  82 \item[O\textnormal{pen}] All software is free and open-source (FOSS).\\
  83   Debian project decisions are voted for in public
  84 \item[P\textnormal{opular}] Used by governments, companies, education
  85   institutions (\url{http://www.debian.org/users/})
  86 \end{description}
  87
  88 \begin{comment}
  89 Original: Very Special Old Pale
  90
  91 Could also stand for
  92 Very (Special|Stable) Operating Platform
  93 \end{comment}
  94
  95 %\section*{Understand Debian}
  96
  97 \subsection*{Debian suites}
  98
  99 % Debian distribution comes in 3 major flavors
 100
 101 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc,topsep=1em]
 102
 103 %\item[Unstable] \emph{Constantly changing distribution}\\
 104 \item[Development]\hfill\emph{Unstable} (always \emph{sid})\\
 105   Never \emph{released}, constantly evolving platform to integrate new
 106   versions of software in Debian.\\
 107   %entry point for the software to appear in Debian.\\
 108   Despite its name, \emph{Unstable} is a good platform for those
 109   requiring the most recent versions of software
 110
 111 %\item[Testing] \emph{Constantly changing future release candidate}\\
 112 \item[``Always-ready-to-release'']  \emph{Testing} (now \emph{squeeze})\\
 113 %  What to become a next \emph{Stable} release candidate.\\
 114   Software migrated from \emph{Unstable} which is known to be of good
 115   quality.  Immediate updates are provided only
 116   to assure secure and robust performance. \\
 117   \emph{Testing} provides a good balance between stability and recency
 118   of software
 119
 120 %\item[Stable] \emph{Official release}\\
 121 \item[Official release]\hfill\emph{Stable} (now \emph{lenny})\\
 122   Software verified to be well tested and secure,
 123   % Very stable (hence the name) and secure
 124   but might be lacking the most recent versions.\\% of the software.\\
 125   % of not the most recent versions. \\
 126   \emph{Stable} is released based on \emph{Testing} ``when it is
 127   ready'', on average bi-yearly.  Complementary updates keep the
 128   system secure and robust.\\
 129   \emph{Stable} is the choice where robustness and security are of
 130   primary importance.
 131 \end{description}
 132
 133 \begin{comment}
 134 \subsection*{It has names}
 135
 136 The code names of Debian releases are names of characters from the Toy
 137 Story animation, e.g. sid, squeeze, lenny.  \emph{Unstable}
 138 flavor always called \emph{sid}, while a new name chosen for every
 139 upcoming release and assigned to \emph{Testing} to become a code name
 140 of the release when it becomes \emph{Stable}.\\  At the moment
 141 \emph{squeeze} is \emph{Testing}, and \emph{lenny} is \emph{Stable}.
 142 As soon as \emph{squeeze} gets released, \emph{Testing} will be given
 143 a new name -- \emph{wheezy}.
 144 \end{comment}
 145
 146 \subsection*{Debian components}
 147
 148 % Debian distribution comes in 3 major flavors
 149 %Debian Free Software Guidelines (DFSG)\\
 150 %\url{http://www.debian.org/social_contract}
 151
 152 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc,topsep=1em]
 153 \item[Free as in freedom]\hfill\emph{main}\\
 154   This is the actual Debian with full support.\\
 155   All software in \emph{main} is distributed under FOSS licenses
 156   compliant with Debian Free Software Guidelines (DFSG) to assure
 157   complete freedom to use, modify, and (re-)distribute
 158 \item[Not free \emph{en bloc}]\hfill\emph{contrib}\\
 159   Software which, despite being free itself, depends on
 160   \emph{non-free} 3rd party software, rendering it useless without
 161 \item[Somewhat free]\hfill\emph{non-free}\\
 162   Software which is under a restrictive license removing some freedoms
 163   (\emph{e.g.} non-commercial use only), but which is allowed to be
 164   used for free and re-distributed (\emph{e.g. NVidia drivers})
 165 \end{description}
 166
 167
 168 \subsection*{Debian is driven by enthusiastic experts}
 169 % could be simply 'Debian People' or 'Debian Community'
 170
 171 Debian is the only major Linux distribution that is being developed
 172 cooperatively solely by many individuals through the Internet, in the
 173 same spirit as Linux and other free software.\\
 174 The Debian developers, teams and the community contribute to the
 175 project not by writing new applications (in most cases), but by
 176 \begin{itemize}[nolistsep,leftmargin=1pc]
 177 \item packaging existing software into Debian
 178   according to the open standards of the project
 179 \item assuring quality of the overall Debian distribution
 180 \item fixing and communicating bug reports to upstream developers
 181 \item improving documentation and internationalization
 182 \item providing user support
 183 \end{itemize}
 184
 185 Packaged software in Debian have individual maintainers which are
 186 often also the users of that software, so they are interested to have
 187 it functioning correctly.  Often individual maintainers join
 188 the teams, such as Debian-Science or Debian-Med, based on the common
 189 field of interest.
 190
 191 %\columnbreak
 192 \subsection*{HOWTO get Debian}
 193
 194 %\subsubsection*{Stable}
 195 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc,style=nextline]
 196 \item[Install on a hard-drive] \url{http://get.debian.net/}
 197 \item[Boot from CD/USB] \url{http://get.debian.net/live/}
 198 \item[Run in a Virtual Machine] \url{http://neuro.debian.net/vm.html}
 199 \item[More options (e.g. buy pre-installed)] \url{http://debian.org/distrib}
 200 \item[Testing/Unstable version] \url{http://www.debian.org/devel/debian-installer}
 201 \end{description}
 202
 203 % \subsection*{Get \emph{Testing/Unstable} Debian}
 204 %
 205 % Install on a hard-drive or in a Virtual Machine\\
 206 % \url{http://www.debian.org/devel/debian-installer}
 207 %
 208
 209 \subsection*{HOWTO install software X}
 210
 211 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc,style=nextline]
 212
 213 \item[GUI (Synaptic Package Manager)]
 214 %  \emph{Synaptic Package Manager}
 215   Select X and click ``Apply''\\
 216   \includegraphics[width=0.95\columnwidth]{shots/synaptic-fslview}
 217 \item[Command line]
 218   apt-get install X
 219 \end{description}
 220
 221
 222
 223 \subsection*{HOWTO upgrade the entire system}
 224
 225 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc,style=nextline]
 226 \item[GUI (Synaptic Package Manager)]
 227   Click ``Mark All Upgrades'', ``Apply''
 228 \item[Command line]
 229   apt-get update; apt-get dist-upgrade
 230 \end{description}
 231
 232 \subsection*{HOWTO get support}
 233
 234 \url{http://www.debian.org/support}
 235
 236 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc,style=nextline]
 237 %\item[GUI]
 238 %  Use \emph{Synaptic Package Manager}
 239 \item[Software bug]
 240   reportbug X
 241 \item[Community support]
 242   %\begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc]
 243   %\item[Mailing lists]
 244   \url{http://www.debian.org/MailingLists}\\
 245   \url{http://forums.debian.net}\\
 246   \url{http://ask.debian.net}
 247   %\end{description}
 248 \item[Commercial support]
 249   \url{http://www.debian.org/consultants}
 250 \end{description}
 251
 252 \begin{comment}
 253 \section*{Reasons to choose Debian}
 254 \paragraph{It is maintained by its users}
 255
 256 If something needs to be fixed or improved, we just do it.
 257
 258 \paragraph{Unparalleled support}
 259
 260 Mail sent to the mailing lists often gets answers within 15 minutes (or less),
 261 for free, and by the people who developed it. Compare that to typical phone
 262 support: hours spent on the phone, for money, only to get someone who doesn't
 263 know the system well enough to even understand your question.
 264
 265 \paragraph{You wouldn't be alone in your choice}
 266
 267 A wide range of organizations and individuals use Debian. See our Who's Using
 268 Debian? page for a description of some high-profile sites which use Debian, and
 269 have chosen to submit a short description of how they use Debian and why.
 270
 271 \paragraph{The best packaging system in the world.}
 272
 273 Tired of old files from software three versions old cluttering your system? Or
 274 installing a piece of software only to find it causes your system to crash
 275 because of software conflicts? Dpkg, Debian's endured packaging system, takes
 276 care of these issues for you.
 277
 278 \paragraph{Easy installation}
 279
 280 If you have heard that GNU/Linux is difficult to install, then you haven't
 281 tried Debian lately. We are constantly improving the installation process. You
 282 can do the installation directly from CD, DOS, floppies or even over the
 283 network.
 284
 285 \paragraph{Incredible amounts of software}
 286
 287 Debian comes with over 25000 different pieces of software. Every bit of it is
 288 free. If you have proprietary software that runs under GNU/Linux, you can still
 289 use it - in fact, there may even be an installer in Debian that will
 290 automatically install and set up everything for you.
 291
 292 \paragraph{Packages well integrated}
 293
 294 Debian surpasses all other distributions in how well its packages are
 295 integrated. Since all software is packaged by a coherent group, not only can
 296 all packages be found at a single site, but you can be assured that we have
 297 already worked out all issues regarding complicated dependencies. While we feel
 298 that the deb format has some advantages over the rpm format, it is the
 299 integration between the packages that makes a Debian system more robust.
 300
 301 \paragraph{Source code}
 302
 303 If you are a software developer, you will appreciate the fact that there are
 304 hundreds of development tools and languages, plus millions of lines of source
 305 code in the base system. All of the software in the main distribution meets the
 306 criteria of the Debian Free Software Guidelines (DFSG). This means that you can
 307 freely use this code to study from, or to incorporate into new free software
 308 projects. There are also plenty of tools and code suitable for use in
 309 proprietary projects.
 310
 311 \paragraph{Easy upgrades}
 312
 313 Due to our packaging system, upgrading to a new version of Debian is a snap.
 314 Just run apt-get update ; apt-get dist-upgrade (or aptitude update; aptitude
 315 dist-upgrade in newer releases) and you can upgrade from a CD in a matter of
 316 minutes or point apt at one of the over 300 Debian mirrors and upgrade over the
 317 net.
 318
 319 \rotatebox{90}{\includegraphics[height=.9\columnwidth]{distro-dev}}
 320 \rotatebox{90}{Description}
 321
 322 \paragraph{Multiple architectures and kernels}
 323
 324 Currently Debian supports an impressive number of CPU architectures: alpha,
 325 amd64, armel, hppa, i386, ia64, mips, mipsel, powerpc, s390, and sparc. It also
 326 runs on GNU Hurd and FreeBSD kernels besides Linux, and with the debootstrap
 327 utility you will be hard-pressed to find a device that can't run Debian.
 328
 329 \paragraph{Bug tracking system}
 330
 331 Debian's bug tracking system is publicly available. We don't try to hide the
 332 fact that software doesn't always work the way users want. Users are encouraged
 333 to submit bug reports and are notified when and why the bug was closed. This
 334 system allows Debian to respond to problems quickly and honestly.
 335
 336
 337 \section*{Acknowledgements}
 338 \end{comment}
 339
 340 \end{multicols}
 341
 342
 343 \pagebreak
 344 %%
 345 %% NeuroDEBIAN
 346 %%
 347 \begin{multicols}{3}    % 3 columns
 348
 349 \begin{center}
 350 \noindent
 351 \vspace{-3em}
 352 \includegraphics[width=\columnwidth]{logo_tuned/label}
 353
 354 \url{http://neuro.debian.net}
 355 %\section*{NeuroDebian Project:}
 356 \section*{The Ultimate Research Platform}
 357
 358 \end{center}
 359
 360 \section*{NeuroDebian is}
 361
 362 a Debian project aiming to provide Neuroscience community with a
 363 stable and versatile research platform -- the Debian OS.  NeuroDebian
 364 (formerly known as Experimental Psychology, ExpPsy) was initiated in
 365 2006 to provide packaging of PyEPL and FSL software so they could
 366 become an integral part of Debian, thus seamlessly available to users
 367 of Debian or any derived distribution.  Since 2006 software coverage
 368 of NeuroDebian increased more than ten-fold.  NeuroDebian repository
 369 \url{http://neuro.debian.net} makes recent versions of the software
 370 available not only for the \emph{Development} but also for previous
 371 releases of Debian and Ubuntu.  The tandem of a stable generic
 372 operating system, Debian, together with new versions of research
 373 software from NeuroDebian repository compose the ultimate research
 374 platform -- stable versatile environment with recent neuroscientific
 375 methodologies just 1-click away.  Such stability, ease of software
 376 installation and system maintenance and constantly growing coverage of
 377 software solutions made NeuroDebian project popular among
 378 neuroscientists and scientific software developers.
 379
 380
 381 \section*{NeuroDebian is NOT}
 382
 383 a yet another Debian GNU/Linux derivative distribution.  All work done
 384 within NeuroDebian project targets software inclusion in the official
 385 Debian distribution.
 386
 387
 388 \section*{Advantages from integration into Debian}
 389
 390 \begin{itemize}[nolistsep,leftmargin=1pc]
 391
 392 % rephrase to outline the benefit, not burden
 393 \item Debian standards and policies guaranty quality and robustness
 394
 395 \item Debian centralized bug tracking system provides a unified
 396   single-point of entry for bug reporting and troubleshooting for any
 397   software in Debian
 398
 399 \item Debian makes software available within world-wide distribution
 400   network, thus offloading bandwidth demands
 401
 402 \item Other Debian enthusiasts take care about large-scale aspects of
 403   deployment, quality assurance, porting and integration at the level
 404   of the entire distribution:
 405
 406 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc]
 407 \item[Porting] Software sources get built for 11 hardware
 408   architectures and 3 kernels (Linux, HURD, kFreeBSD). Ports teams
 409   maintain build infrastructure and help making the code
 410   platform-agnostic.
 411 \item[QA] Whole-archive rebuilds assure robustness of packaging and
 412   warn about upcoming problems (core libraries upgrades) beforehand.
 413 \item[Internationalization (I18n)] I18n teams contribute by localizing
 414   software for more than 50 languages
 415 \end{description}
 416
 417 \item Neuroscience software becomes 1st-class citizen within Debian
 418   project, which guarantees its availability, longevity, smooth
 419   installation and upgrades
 420
 421 \item Participation in the Debian community helps to assure Debian's
 422   aptness for the neuroscientific software demands
 423
 424 \end{itemize}
 425
 426
 427 \section*{NeuroDebian coverage}
 428 \begin{flushright}
 429 \vspace{-0.5em}
 430 \url{http://neuro.debian.net/pkgs.html}
 431 \vspace{-1em}
 432 \end{flushright}
 433 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc,topsep=0em]
 434 \item[Electrophysiology] BioSig, Sigviewer, Brian, \ldots
 435 \item[Machine Learning] PyMVPA, scikits.learn, \ldots
 436 \item[Medical Imaging] AFNI, Caret, FSL, Mricron, NiPy, Voxbo, \ldots
 437 \item[Psychophysics] PsychoPy, PyEPL
 438 \end{description}
 439
 440
 441
 442 %\columnbreak
 443
 444 \section*{HOWTO get NeuroDebian}
 445 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc]
 446 \item[Debian/Ubuntu]\url{neuro.debian.net} repository
 447 \item[Others] NeuroDebian Virtual Machine
 448 % Here place a left-top corner of OSX with seamless mode
 449 \end{description}
 450 \begin{comment}
 451 \section*{Developers oriented information}
 452
 453 %\columnbreak
 454
 455 \section*{Who is using NeuroDebian}
 456
 457 \noindent
 458 %\includegraphics[width=\columnwidth]{usage_worldmap}
 459
 460 buga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga duga
 461 \end{comment}
 462
 463 \def\blank{\hspace{0em}\vspace{-1em}}
 464 \columnbreak
 465 \section*{Work-in-progress}
 466
 467 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc,topsep=1em,style=nextline]
 468
 469 \item[Expanded coverage]\blank
 470   \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc,topsep=0em,style=nextline]
 471   \item[Electrophysiology] BioSig, Brian, NEURON, \ldots
 472   \item[Matlab/Octave toolboxes] SPM, EEGLAB, \ldots
 473   \end{description}
 474 \vspace{0.5em}
 475 \epigraph{Having FreeSurfer integrated into the Debian operating system by the NeuroDebian team would have enormous benefits for us, and for the thousands of users of FreeSurfer across the world.}{Prof. Bruce Fischl}{Director, Computational Core at Martinos Center at Massachusetts General Hospital, Charlestown, Massachusetts, USA}
 476 \item[Improved quality assurance]
 477   Extended integration and regression testing
 478 \item[Available snapshotting service]
 479   % Entire NeuroDebian repository for any given past moment
 480   All versions of packages readily available
 481 \item[Data as the 1st class citizen]
 482   \url{http://neuro.debian.net/datasets.html}
 483 \item[Universal availability]\blank
 484   % \begin{itemize}[nolistsep,leftmargin=1pc,topsep=0em]
 485   % \item Virtual Appliance enhancements
 486   %\item
 487   Cloud computing
 488   %\end{itemize}
 489
 490 \end{description}
 491
 492
 493 \section*{Testimonials}
 494 \begin{flushright}
 495 \vspace{-0.5em}
 496 \url{http://neuro.debian.net/testimonials.html}
 497 \vspace{-1em}
 498 \end{flushright}
 499
 500
 501 \epigraph{The approach taken with NeuroDebian is plainly the most appropriate
 502 approach to software distribution for the dominant platform in brain
 503 image analysis, and I have great confidence that this project will be
 504 a major asset to the neuroscience community in facilitating the
 505 distribution of stable software, improving the reliability and
 506 replicability of analyses, and in helping to improve software
 507 development practices.}{Prof. Daniel Y. Kimberg}{Director, Data
 508 Processing Facility, Center for Functional Neuroimaging, University of
 509 Pennsylvania, Philadelphia, USA}
 510
 511 \section*{Acknowledgements}
 512
 513 We are grateful to all Debian developers and contributors for the
 514 development of Debian OS, and to Prof. James V. Haxby (PBS Department,
 515 Dartmouth College) for his continued support and endless supply of
 516 Italian espresso (\url{http://neuro.debian.net/coffeeart.html}).
 517
 518 %\columnbreak
 519 \end{multicols}
 520
 521
 522
 523 \end{document}
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