Makefile

   1 CC=             gcc
   2 CXX=            g++
   3 CFLAGS=         -Wall -pg -O3 -m64
   4 CXXFLAGS=       $(CFLAGS)
   5 DFLAGS=         -D_IOLIB=2 #-D_NDEBUG
   6 OBJS=           BamReader.o bgzf.o
   7 PROG=           BamReaderTest
   8 INCLUDES=
   9 ARFLAGS=        -crs
  10 LIBS=           -lz
  11 SUBDIRS=        .
  12
  13 .SUFFIXES:.c .cpp .o
  14
  15 .c.o:
  16                 $(CC) -c $(CFLAGS) $(DFLAGS) $(INCLUDES) $< -o $@
  17
  18 .cpp.o:
  19                 $(CXX) -c $(CXXFLAGS) $(DFLAGS) $(INCLUDES) $< -o $@
  20
  21 all: $(PROG) BamConversion
  22
  23 lib:libbambc.a
  24
  25 libbambc.a:$(OBJS)
  26                 $(AR) $(ARFLAGS) $@ $(OBJS)
  27
  28 BamReaderTest:lib BamReaderMain.o
  29                 $(CXX) $(CXXFLAGS) -o $@ BamReaderMain.o $(LIBS) -L. -lbambc
  30
  31 BamConversion: lib BamWriter.o BamConversionMain.o
  32         $(CXX) $(CXXFLAGS) -o $@ BamWriter.o BamConversionMain.o $(LIBS) -L. -lbambc
  33
  34 clean:
  35                 rm -fr gmon.out *.o *.a a.out $(PROG) *~