Makefile

   1 CXX=            g++\r
   2 CXXFLAGS=       -Wall -O3\r
   3 PROG=           bamtools\r
   4 API=            BGZF.o BamReader.o BamWriter.o BamMultiReader.o
   5 UTILS=          bamtools_options.o bamtools_utilities.o
   6 TOOLKIT=        bamtools_count.o bamtools_coverage.o bamtools_header.o bamtools_index.o bamtools_merge.o bamtools_sam.o bamtools_sort.o bamtools_stats.o
   7 MAIN=           bamtools.o
   8 LIBS=           -lz
   9 \r
  10 all: $(PROG)\r
  11 \r
  12 bamtools: $(API) $(UTILS) $(TOOLKIT) $(MAIN)\r
  13         $(CXX) $(CXXFLAGS) -o $@ $(API) $(UTILS) $(TOOLKIT) $(MAIN) $(LIBS)\r
  14 \r
  15 clean:\r
  16         rm -fr gmon.out *.o *.a a.out *~\r