]>
-rw-r--r-- | 916 | AUTHORS | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 1085 | COPYING | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 205390 | ChangeLog | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 58776 | ChangeLog.old | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 1200 | INSTALL | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 2825 | Makefile | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 2096 | Makefile.mingw | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 21635 | NEWS | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 10698 | bam.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 24165 | bam.h | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 7927 | bam2bcf.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 1434 | bam2bcf.h | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 16946 | bam2bcf_indel.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 4177 | bam_aux.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 5792 | bam_cat.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 2803 | bam_color.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 1064 | bam_endian.h | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 14553 | bam_import.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 20935 | bam_index.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 4976 | bam_lpileup.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 20549 | bam_maqcns.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 1486 | bam_maqcns.h | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 2540 | bam_mate.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 11866 | bam_md.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 12551 | bam_pileup.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 34353 | bam_plcmd.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 1498 | bam_reheader.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 5631 | bam_rmdup.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 4127 | bam_rmdupse.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 13034 | bam_sort.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 2688 | bam_stat.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 12761 | bam_tview.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 5974 | bamtk.c | blob | history | raw |
drwxr-xr-x | - | bcftools | tree | history |
-rw-r--r-- | 19433 | bgzf.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 4580 | bgzf.h | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 5903 | bgzip.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 5667 | cut_target.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 3485 | errmod.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 442 | errmod.h | blob | history | raw |
drwxr-xr-x | - | examples | tree | history |
-rw-r--r-- | 10291 | faidx.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 3188 | faidx.h | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 5931 | glf.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 1799 | glf.h | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 15230 | kaln.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 2072 | kaln.h | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 17815 | khash.h | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 3472 | klist.h | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 18332 | knetfile.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 1611 | knetfile.h | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 10511 | kprobaln.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 1568 | kprobaln.h | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 8108 | kseq.h | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 10027 | ksort.h | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 5376 | kstring.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 2661 | kstring.h | blob | history | raw |
drwxr-xr-x | - | misc | tree | history |
-rw-r--r-- | 20819 | phase.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 24343 | razf.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 4137 | razf.h | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 4110 | razip.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 5732 | sam.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 2625 | sam.h | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 19200 | sam_header.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 643 | sam_header.h | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 10641 | sam_view.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 2500 | sample.c | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 396 | sample.h | blob | history | raw |
-rw-r--r-- | 21955 | samtools.1 | blob | history | raw |
drwxr-xr-x | - | win32 | tree | history |