]> git.donarmstrong.com Git - neurodebian.git/blob - survey/makestats
f12a37af2b78eadae685224314637c6463840b3c
[neurodebian.git] / survey / makestats
1 #!/usr/bin/python
2
3 from mvpa.misc.plot.base import plot_bars
4 from glob import glob
5 try:
6     from json import load as jload
7     def jsonload(f):
8         return jload(f)
9 except ImportError:
10     from json import read as jread
11     def jsonload(f):
12         return jread(f.read())
13 import sys, os
14 import pylab as pl
15 import numpy as np
16 import time
17
18 # uniform colors for OS results
19 os_colors = ['#B63537', '#4E4DA0', '#008200', 'gray']
20 os_order = ['linux', 'mac', 'win', 'otheros']
21 # resources
22 resource_categories = {
23     'vendor': 'Vendor/Project website',
24     'retailer': 'Retailer',
25     'os': 'Operating system',
26     'cpan': 'CPAN',
27     'cran': 'CRAN',
28     'epel': 'EPEL',
29     'fink': 'Fink',
30     'freebsdports': 'FreeBSD ports',
31     'incf': 'INCF',
32     'macports': 'Macports',
33     'matlabcentral': 'Matlab Central',
34     'neurodebian': 'NeuroDebian',
35     'nitrc': 'NITRC',
36     'pypi': 'PyPi',
37     'pythonbundles': 'Python bundles',
38     'sourceforge': 'Sourceforge',
39     'other': 'Other resource'
40     }
41 # software categories
42 sw_categories = {
43         'general': 'General computing',
44         'dc': 'Distributed computing',
45         'img': 'Brain imaging',
46         'datamanage': 'Data management',
47         'neusys': 'Neural systems modeling',
48         'electro': 'Electrophysiology, MEG/EEG',
49         'bci': 'Brain-computer interface',
50         'acq': 'Hardware interface/Data acquisition',
51         'rt': 'Real-time solutions',
52         'psychophys': 'Psychophysics/Experiment control'
53         }
54
55 # some meaningful groups of OSes
56 redhat_family = ["rhel", "centos", "fedora", "scilinux"]
57 debian_family = ["debian", "ubuntu", "biolinux"]
58 suse_family = ["suse", "slel"]
59 other_linux_family = ["gentoo", "mandriva", "arch", "slackware", "otherlinux"]
60 other_family = ["starbsd", "unix", "qnx", "beos", "solaris", "other"]
61
62 os_cat_names = {
63         'win': 'Windows',
64         'mac': 'Mac OS',
65         'linux': 'GNU/Linux',
66         'otheros': 'Other OS'
67         }
68
69 os_family = {
70         'win': ["windows"],
71         'mac': ["macosx"],
72         'linux': redhat_family + debian_family + suse_family + other_linux_family,
73         'otheros': other_family
74         }
75 # end the reverse mapping
76 os_family_rev = {}
77 for ost in os_family:
78     for os_ in os_family[ost]:
79         os_family_rev[os_] = ost
80
81
82 def load_list2dict(name):
83     d = {}
84     lfile = open(name)
85     for line in lfile:
86         kv = line.split(':')
87         d[kv[0]] = kv[1].strip().strip('"')
88     return d
89
90
91
92 class DB(dict):
93     os_dict = load_list2dict('oslist.txt')
94     datamod_dict = load_list2dict('datamodlist.txt')
95     sw_dict = load_list2dict('swlist.txt')
96
97     def __init__(self, srcdir):
98         # eats the whole directory
99         if srcdir is None:
100             return
101         datafilenames = glob('%s/*.json' % srcdir)
102         for dfn in datafilenames:
103             rawdata = jsonload(open(dfn))
104             self[rawdata['timestamp']] = rawdata
105
106     def get_unique(self, key):
107         # return a set of all (unique) values for a field id
108         uniq = set()
109         for d in self.values():
110             if key in d:
111                 el = d[key]
112                 if isinstance(el, list):
113                     uniq = uniq.union(el)
114                 else:
115                     uniq = uniq.union((el,))
116         return uniq
117
118     def get_not_none(self, key):
119         # return a list of all values of a specific field id
120         # the second return value is count of submission that did not have data
121         # for this field id
122         val = []
123         missing = 0
124         for d in self.values():
125             if key in d:
126                 el = d[key]
127                 if isinstance(el, list):
128                     val.extend(el)
129                 else:
130                     if el == 'none':
131                         missing += 1
132                     else:
133                         val.append(el)
134             else:
135                 missing += 1
136         return val, missing
137
138     def get_counts(self, key):
139         # return a dict with field values as keys and respective submission 
140         # count as value
141         vals = self.get_not_none(key)[0]
142         uniq = np.unique(vals)
143         counts = dict(zip(uniq, [vals.count(u) for u in uniq]))
144         return counts
145
146     def select_match(self, key, values):
147         # return a db with all submissions were a field id has one of the
148         # supplied values
149         match = DB(None)
150         for k, v in self.items():
151             if not key in v:
152                 continue
153             el = v[key]
154             if isinstance(el, list):
155                 if len(set(values).intersection(el)):
156                     match[k] = v
157             elif el in values:
158                 match[k] = v
159         return match
160
161     def get_nice_name(self, id):
162         srcs = [DB.os_dict, os_cat_names, DB.sw_dict, sw_categories,
163                 resource_categories]
164         for src in srcs:
165             if id in src:
166                 return src[id]
167         # not found, nothing nicer
168         return id
169
170
171 def mkpic_os_per_env(db, destdir):
172     envs = ['pers_os', 'man_os', 'virt_host_os', 'virt_guest_os']
173     env_names = ['Personal', 'Managed', 'Virt. Host', 'Virt. Guest']
174     env_stats = {}
175     offset = 0
176     for env in envs:
177         counts = db.get_counts(env)
178         stats = dict(zip(os_family.keys(), [0] * len(os_family)))
179         for os in counts:
180             stats[os_family_rev[os]] += counts[os]
181         total_count = np.sum(stats.values())
182         for osf in stats:
183             stats[osf] = float(stats[osf]) / total_count
184         env_stats[env] = stats
185     # make stacked barplot
186     pl.figure(figsize=(6.4, 4.8))
187     x = np.arange(len(envs))
188     bottoms = np.zeros(len(envs))
189     for i, os in enumerate(os_order):
190         stat = [env_stats[e][os] for e in envs]
191         pl.bar(x, stat, bottom=bottoms, color=os_colors[i],
192                label=db.get_nice_name(os), width=0.8)
193         bottoms += stat
194     pl.legend(loc='lower right')
195     pl.xticks(x + 0.4,  [db.get_nice_name(e) for e in env_names])
196     pl.xlim(-0.25, len(envs))
197     pl.title("Operating system preference by environment")
198     pl.ylabel("Fraction of submissions")
199     pl.savefig('%s/ospref_by_env.png' % destdir, format='png', dpi=80)
200
201 def mkpic_submissions_per_datamod(db, destdir):
202     # simple demo
203     spd = db.get_counts('bg_datamod')
204     spd = sorted(spd.items(), cmp=lambda x, y: cmp(x[1], y[1]))[::-1]
205     x = np.arange(len(spd))
206     pl.figure(figsize=(6.4, 4.8))
207     pl.title('Submissions per data modality')
208     pl.bar(x, [s[1] for s in spd])
209     pl.xticks(x + 0.5,  [db.datamod_dict[k[0]] for k in spd], rotation=-10)
210     pl.ylabel('Survey submissions per data modality\n(multiple choices per submission possible)')
211     pl.savefig('%s/submissions_per_datamod.png' % destdir, format='png', dpi=80)
212
213 def mkpic_resources(db, destdir):
214     res = db.get_counts('software_resource')
215     res = res.items()
216     x = np.arange(len(res))
217     pl.figure(figsize=(6.4, 4.8))
218     pl.title('Software resources')
219     pl.bar(x + (1./8), [s[1] for s in res], width=0.75, color = '#008200')
220     pl.xticks(x + 0.5,  ['' for s in res])
221     for i, s in enumerate(res):
222         pl.text(i+.5, 0.1, db.get_nice_name(s[0]), rotation=90,
223                 horizontalalignment='center',
224                 verticalalignment='bottom',
225                 bbox=dict(facecolor='white', alpha=0.8, edgecolor='white'))
226     pl.ylabel('Number of submissions')
227     pl.savefig('%s/software_resources.png' % destdir, format='png', dpi=80)
228
229 def mkpic_software(db, destdir):
230     for typ in sw_categories.keys():
231         counts = db.get_counts('sw_%s' % typ)
232         pl.figure(figsize=(6.4, 4.8))
233         pl.title("Software popularity: %s" % db.get_nice_name(typ))
234         if not len(counts):
235             pl.text(.5, .5, "[Insufficient data for this figure]",
236                     horizontalalignment='center')
237             pl.axis('off')
238         else:
239             # sort by name
240             stats = sorted(counts.items(), cmp=lambda x, y: cmp(x[0], y[0]))
241             x = np.arange(len(stats))
242             pl.bar(x + (1./8), [s[1] for s in stats], width=0.75, color = '#008200')
243             pl.xticks(x + 0.5,  ['' for s in stats])
244             for i, s in enumerate(stats):
245                 pl.text(i+.5, 0.1, db.get_nice_name(s[0]), rotation=90,
246                         horizontalalignment='center',
247                         verticalalignment='bottom',
248                         bbox=dict(facecolor='white', alpha=0.8, edgecolor='white'))
249             pl.xlim(0, len(stats))
250             pl.ylabel("Number of submissions")
251         pl.savefig('%s/sw_%s.png' % (destdir, typ), format='png', dpi=80)
252
253 def mkpic_rating_by_os(db, env, items, destdir, title):
254     pl.figure(figsize=(6.4, 4.8))
255     for i, os in enumerate(os_order):
256         ratings = [db.select_match(env,
257                         os_family[os]).get_not_none('%s' % (it,))[0]
258                             for it in items]
259         plot_bars(ratings, offset=((i+1)*0.2)-0.1, color=os_colors[i],
260                   title=title, ylabel="Mean rating", label=db.get_nice_name(os))
261     pl.ylim((0,3))
262     pl.xlim((0,len(items)))
263     pl.yticks((0, 3), ['Disagree', 'Agree'], rotation=90)
264     pl.xticks(np.arange(len(items))+0.5, [i[-2:] for i in items],
265               horizontalalignment='center')
266     pl.legend(loc='lower right')
267     pl.savefig('%s/ratings_%s.png' % (destdir, env), format='png', dpi=80)
268
269
270 def main(srcdir, destdir):
271     db = DB(srcdir)
272     if not os.path.exists(destdir):
273         os.makedirs(destdir)
274     for pic in [mkpic_submissions_per_datamod, mkpic_os_per_env, mkpic_software,
275                 mkpic_resources]:
276         pic(db, destdir)
277     mkpic_rating_by_os(db, 'pers_os', ['pers_r%i' % i for i in range(1, 9)], destdir,
278                        "Ratings: Personal environment")
279     mkpic_rating_by_os(db, 'man_os', ['man_r%i' % i for i in range(1, 5)], destdir,
280                        "Ratings: Managed environment")
281     mkpic_rating_by_os(db, 'virt_host_os', ['virt_r%i' % i for i in range(1, 4)], destdir,
282                        "Ratings: Virtual environment (by host OS)")
283     # submission stats: this is RST
284     statsfile = open('%s/stats.txt' % destdir, 'w')
285     statsfile.write('::\n\n  Number of submissions: %i\n' % len(db))
286     statsfile.write('  Statistics last updated: %s\n\n' \
287             % time.strftime('%A, %B %d %Y, %H:%M:%S UTC', time.gmtime()))
288     statsfile.close()
289
290 if __name__ == '__main__':
291     main(sys.argv[1], sys.argv[2])