schema/extra_schema/ideogram_table.sql

   1 CREATE TABLE ideogram (
   2        chr TEXT NOT NULL,
   3        pq  TEXT NOT NULL,
   4        ideogram TEXT NOT NULL,
   5        rstart INT NOT NULL, -- I think these are recombination rates,
   6                             -- but I'm not sure
   7        rstop INT NOT NULL,
   8        start INT NOT NULL,
   9        stop INT NOT NULL,
  10        posneg TEXT NOT NULL -- I believe this indicates whether the
  11                             -- band is black or white
  12        );
  13
  14 CREATE UNIQUE INDEX ON ideogram(chr,pq,ideogram);
  15 CREATE UNIQUE INDEX ON ideogram(chr,start);
  16 CREATE UNIQUE INDEX ON ideogram(chr,stop);