]> git.donarmstrong.com Git - xtable.git/blob - pkg/man/print.xtable.Rd
Added math.style.exponents option to print.xtable via a change to
[xtable.git] / pkg / man / print.xtable.Rd
1 \name{print.xtable}\r
2 \alias{print.xtable}\r
3 \title{Print Export Tables}\r
4 \description{\r
5   Function returning and displaying or writing to disk the LaTeX or HTML\r
6   code associated with the supplied object of class \code{xtable}.\r
7 }\r
8 \usage{\r
9 \method{print}{xtable}(x,\r
10   type = getOption("xtable.type", "latex"),\r
11   file = getOption("xtable.file", ""),\r
12   append = getOption("xtable.append", FALSE),\r
13   floating = getOption("xtable.floating", TRUE),\r
14   floating.environment = getOption("xtable.floating.environment", "table"),\r
15   table.placement = getOption("xtable.table.placement", "ht"),\r
16   caption.placement = getOption("xtable.caption.placement", "bottom"),\r
17   caption.width = getOption("xtable.caption.width", NULL),\r
18   latex.environments = getOption("xtable.latex.environments", c("center")),\r
19   tabular.environment = getOption("xtable.tabular.environment", "tabular"),\r
20   size = getOption("xtable.size", NULL),\r
21   hline.after = getOption("xtable.hline.after", c(-1,0,nrow(x))),\r
22   NA.string = getOption("xtable.NA.string", ""),\r
23   include.rownames = getOption("xtable.include.rownames", TRUE),\r
24   include.colnames = getOption("xtable.include.colnames", TRUE),\r
25   only.contents = getOption("xtable.only.contents", FALSE),\r
26   add.to.row = getOption("xtable.add.to.row", NULL),\r
27   sanitize.text.function = getOption("xtable.sanitize.text.function", NULL),\r
28   sanitize.rownames.function = getOption("xtable.sanitize.rownames.function",\r
29                                          sanitize.text.function),\r
30   sanitize.colnames.function = getOption("xtable.sanitize.colnames.function",\r
31                                          sanitize.text.function),\r
32   math.style.negative = getOption("xtable.math.style.negative", FALSE),\r
33   math.style.exponents = getOption("xtable.math.style.exponents", FALSE),\r
34   html.table.attributes = getOption("xtable.html.table.attributes",\r
35                                     "border=1"),\r
36   print.results = getOption("xtable.print.results", TRUE),\r
37   format.args = getOption("xtable.format.args", NULL),\r
38   rotate.rownames = getOption("xtable.rotate.rownames", FALSE),\r
39   rotate.colnames = getOption("xtable.rotate.colnames", FALSE),\r
40   booktabs = getOption("xtable.booktabs", FALSE),\r
41   scalebox = getOption("xtable.scalebox", NULL),\r
42   width = getOption("xtable.width", NULL),\r
43   comment = getOption("xtable.comment", TRUE),\r
44   timestamp = getOption("xtable.timestamp", date()),\r
45   ...)}\r
46 \arguments{\r
47   \item{x}{An object of class \code{"xtable"}.}\r
48   \item{type}{Type of table to produce. Possible values for \code{type}\r
49     are \code{"latex"} or \code{"html"}.\r
50     Default value is \code{"latex"}.}\r
51   \item{file}{Name of file where the resulting code should be saved.  If\r
52     \code{file=""}, output is displayed on screen.  Note that the\r
53     function also (invisibly) returns a character vector of the results\r
54     (which can be helpful for post-processing).\r
55     Default value is \code{""}.}\r
56   \item{append}{If \code{TRUE} and \code{file!=""}, code will be\r
57     appended to \code{file} instead of overwriting \code{file}.\r
58     Default value is \code{FALSE}.}\r
59   \item{floating}{If \code{TRUE} and \code{type="latex"}, the resulting\r
60     table will be a floating table (using, for example,\r
61     \code{\\begin\{table\}} and \code{\\end\{table\}}).  See\r
62     \code{floating.environment} below.\r
63     Default value is \code{TRUE}. }\r
64   \item{floating.environment}{If \code{floating=TRUE} and\r
65     \code{type="latex"}, the resulting table uses the specified floating\r
66     environment. Possible values include \code{"table"}, \code{"table*"},\r
67     and other floating environments defined in LaTeX packages.\r
68     Default value is \code{"table"}.}\r
69   \item{table.placement}{If \code{floating=TRUE} and\r
70     \code{type="latex"}, the floating table will have placement given by\r
71     \code{table.placement} where \code{table.placement} must be\r
72     \code{NULL} or contain only elements of\r
73     \{"h","t","b","p","!","H"\}.\r
74     Default value is \code{"ht"}.}\r
75   \item{caption.placement}{The caption will be placed at the bottom\r
76     of the table if \code{caption.placement} is \code{"bottom"} and at\r
77     the top of the table if it equals \code{"top"}.\r
78     Default value is \code{"bottom"}.}\r
79   \item{caption.width}{The caption will be placed in a \code{"parbox"}\r
80     of the specified width if \code{caption.width} is not \code{NULL} and\r
81         \code{type="latex"}. Default value is \code{NULL}.}\r
82   \item{latex.environments}{If \code{floating=TRUE} and\r
83     \code{type="latex"}, the specified LaTeX environments (provided as\r
84     a character vector) will enclose the tabular environment.\r
85     Default value is \code{"center"}. }\r
86   \item{tabular.environment}{When \code{type="latex"}, the tabular\r
87     environment that will be used.\r
88     When working with tables that extend more than one page, using\r
89     \code{tabular.environment="longtable"} with the corresponding\r
90     LaTeX package (see Fairbairns, 2005) allows one to typeset them\r
91     uniformly. Note that \code{floating} should be set to\r
92     \code{FALSE} when using the \code{longtable} environment.\r
93     Default value is \code{"tabular"}.}\r
94   \item{size}{A character vector that is inserted just before the\r
95     tabular environment starts. This can be used to set the font size\r
96     and a variety of other table settings. Initial backslashes are\r
97     automatically prefixed, if not supplied by user.\r
98     Default value is \code{NULL}. }\r
99   \item{hline.after}{When \code{type="latex"}, a vector of numbers\r
100     between -1 and \code{nrow(x)}, inclusive, indicating the rows\r
101     after which a horizontal line should appear.  If \code{NULL} is used\r
102     no lines are produced. Repeated values are allowed.\r
103     Default value is \code{c(-1,0,nrow(x))} which means draw a line\r
104     before and after the columns names and at the end of the\r
105     table.}\r
106   \item{NA.string}{String to be used for missing values in table\r
107     entries.\r
108     Default value is \code{""}.}\r
109   \item{include.rownames}{If \code{TRUE} the rows names are\r
110     printed.\r
111     Default value is \code{TRUE}.}\r
112   \item{include.colnames}{If \code{TRUE} the columns names are\r
113     printed.\r
114     Default value is \code{TRUE}.}\r
115   \item{only.contents}{If \code{TRUE} only the rows of the\r
116     table are printed.\r
117     Default value is \code{FALSE}. }\r
118   \item{add.to.row}{A list of two components. The first component (which\r
119     should be called 'pos') is a list that contains the position of rows on\r
120     which extra commands should be added at the end. The second\r
121     component (which should be called 'command') is a character vector\r
122     of the same length as the first component, which contains the command\r
123     that should be added at the end of the specified rows.\r
124     Default value is \code{NULL}, i.e. do not add commands.}\r
125   \item{sanitize.text.function}{All non-numeric entries (except row and\r
126     column names) are sanitized in an attempt to remove characters which\r
127     have special meaning for the output format. If\r
128     \code{sanitize.text.function} is not \code{NULL}, it should\r
129     be a function taking a character vector and returning one, and will\r
130     be used for the sanitization instead of the default internal\r
131     function.\r
132     Default value is \code{NULL}.}\r
133   \item{sanitize.rownames.function}{Like the\r
134     \code{sanitize.text.function}, but applicable to row names.\r
135     The default uses the \code{sanitize.text.function}. }\r
136   \item{sanitize.colnames.function}{Like the\r
137     \code{sanitize.text.function}, but applicable to column names.\r
138     The default uses the \code{sanitize.text.function}. }\r
139   \item{math.style.negative}{In a LaTeX table, if \code{TRUE}, then use\r
140     $-$ for the negative sign (as was the behavior prior to version 1.5-3).\r
141     Default value is \code{FALSE}.}  \r
142   \item{math.style.exponents}{In a LaTeX table, if \code{TRUE} or\r
143     \code{"$$"}, then use \verb{$5 \times 10^{5}$} for 5e5. If\r
144     \code{"ensuremath"}, then use \verb{\\ensuremath{5 \times 10^{5}}}\r
145     for 5e5. If \code{"UTF-8"} or \code{"UTF-8"}, then use UTF-8 to\r
146     approximate the LaTeX typsetting for 5e5.\r
147     Default value is \code{FALSE}.}\r
148   \item{html.table.attributes}{In an HTML table, attributes associated\r
149     with the \code{<TABLE>} tag.\r
150     Default value is \code{"border=1"}.}\r
151   \item{print.results}{If \code{TRUE}, the generated table is printed to\r
152     standard output.  Set this to \code{FALSE} if you will just be using\r
153     the character vector that is returned invisibly.\r
154   Default value is \code{TRUE}.}\r
155   \item{format.args}{List of arguments for the \code{formatC} function.\r
156     For example, standard German number separators can be specified as\r
157     \code{format.args=list(big.mark = "'", decimal.mark =\r
158       ","))}. The arguments \code{digits} and \code{format} should not be\r
159     included in this list. See details.\r
160     Default value is \code{NULL}.}\r
161   \item{rotate.rownames}{If \code{TRUE}, the row names are displayed\r
162     vertically in LaTeX.\r
163     Default value is \code{FALSE}.}\r
164   \item{rotate.colnames}{If \code{TRUE}, the column names are displayed\r
165     vertically in LaTeX.\r
166     Default value is \code{FALSE}.}\r
167   \item{booktabs}{If \code{TRUE}, the \code{toprule}, \code{midrule} and\r
168     \code{bottomrule} commands from the LaTeX "booktabs" package are used\r
169     rather than \code{hline} for the horizontal line tags. }\r
170   \item{scalebox}{If not \code{NULL}, a \code{scalebox} clause will be\r
171     added around the tabular environment with the specified value used\r
172     as the scaling factor.\r
173     Default value is \code{NULL}.}\r
174   \item{width}{If not \code{NULL}, the specified value is included in\r
175     parentheses between the tabular environment \code{begin} tag and the\r
176     alignment specification.  This allows specification of the table\r
177     width when using tabular environments such as \code{tabular*} and\r
178     \code{tabularx}.  Note that table width specification is not\r
179     supported with the \code{tabular} or \code{longtable} environments.\r
180     Default value is \code{NULL}.}\r
181   \item{comment}{If \code{TRUE}, the version and timestamp comment is\r
182     included.  Default value is \code{TRUE}. }\r
183   \item{timestamp}{Timestamp to include in LaTeX comment.  Set this\r
184     to \code{NULL} to exclude the timestamp. Default value is \code{date()}. }\r
185   \item{...}{Additional arguments.  (Currently ignored.) }\r
186 }\r
187 \details{\r
188   This function displays or writes to disk the code to produce a table\r
189   associated with an object \code{x} of class \code{"xtable"}.\r
190   The resulting code is either a LaTeX or HTML table, depending on the\r
191   value of \code{type}.  The function also (invisibly) returns a\r
192   character vector of the results (which can be helpful for\r
193   post-processing).\r
194 \r
195   Since version 1.4 the non default behavior of \code{hline.after} is\r
196   changed. To obtain the same results as the previous versions add to\r
197   the \code{hline.after} vector the vector \code{c(-1, 0, nrow(x))}\r
198   where \code{nrow(x)} is the numbers of rows of the object.\r
199 \r
200   From version 1.4-3, all non-numeric columns are sanitized, and all\r
201   LaTeX special characters are sanitized for LaTeX output.  See Section\r
202   3 of the \code{xtableGallery} vignette for an example of customizing\r
203   the sanitization. From version 1.4-4, the sanitization also applies to\r
204   column names.  To remove any text sanitization, specify\r
205   \code{sanitize.text.function=function(x){x}}.\r
206 \r
207   From version 1.6-1 the default values for the arguments other than\r
208   \code{x} are obtained using \code{getOption()}.  Hence the user can\r
209   set the values once with \code{options()} rather than setting them in\r
210   every call to \code{print.xtable()}.\r
211 \r
212   The argument \code{format.args} is used to supply arguments to the\r
213   \code{formatC} function, but will throw an error if values for\r
214   \code{digits} or \code{format} are included in the list of\r
215   arguments. The recommended approach to specify \code{digits} is to supply\r
216   the argument \code{digits} to \code{xtable}, and to specify\r
217   \code{format} supply the argument \code{display} to \code{xtable}. See\r
218   the examples.\r
219 }\r
220 \author{\r
221   David Dahl \email{dahl@stat.byu.edu} with contributions and\r
222   suggestions from many others (see source code).\r
223 }\r
224 \references{\r
225   Fairbairns, Robin (2005) \emph{Tables longer than a single page.} The\r
226   UK List of TeX Frequently Asked Questions on the\r
227   Web. \url{http://www.tex.ac.uk/cgi-bin/texfaq2html?label=longtab}\r
228 }\r
229 \seealso{\r
230   \code{\link{xtable}}, \code{\link{caption}}, \code{\link{label}},\r
231   \code{\link{align}}, \code{\link{digits}}, \code{\link{display}},\r
232   \code{\link{formatC}}\r
233 }\r
234 \r
235 \examples{\r
236 df <- data.frame(A = c(1.00123, 33.1, 6),\r
237                  B = c(111111, 3333333, 3123.233))\r
238 ## The following code gives the error\r
239 ## formal argument "digits" matched by multiple actual arguments\r
240 ## print(xtable(df, display = c("s","e","e")),\r
241 ##       format.args = list(digits = 3, big.mark = " ", decimal.mark = ","))\r
242 ## specify digits as argument to xtable instead\r
243 print(xtable(df, display = c("s","f","f"), digits = 4),\r
244       format.args = list(big.mark = " ", decimal.mark = ","))\r
245 ## The following code gives the error\r
246 ## formal argument "format" matched by multiple actual arguments\r
247 ## print(xtable(df, digits = 4),\r
248 ##       format.args = list(format = c("s","e","e"),\r
249 ##                          big.mark = " ", decimal.mark = ","))\r
250 ## specify format using display argument in xtable\r
251 print(xtable(df, display = c("s","e","e"), digits = 4),\r
252       format.args = list(big.mark = " ", decimal.mark = ","))\r
253 \r
254 }\r
255 \r
256 \keyword{print}\r