]> git.donarmstrong.com Git - xtable.git/blob - pkg/man/print.xtable.Rd
Changed documentation to advise on bug #4770
[xtable.git] / pkg / man / print.xtable.Rd
1 \name{print.xtable}\r
2 \alias{print.xtable}\r
3 \title{Print Export Tables}\r
4 \description{\r
5   Function returning and displaying or writing to disk the LaTeX or HTML\r
6   code associated with the supplied object of class \code{xtable}.\r
7 }\r
8 \usage{\r
9 \method{print}{xtable}(x, \r
10   type = getOption("xtable.type", "latex"),\r
11   file = getOption("xtable.file", ""),\r
12   append = getOption("xtable.append", FALSE),\r
13   floating = getOption("xtable.floating", TRUE),\r
14   floating.environment = getOption("xtable.floating.environment", "table"),\r
15   table.placement = getOption("xtable.table.placement", "ht"),\r
16   caption.placement = getOption("xtable.caption.placement", "bottom"),\r
17   caption.width = getOption("xtable.caption.width", NULL),\r
18   latex.environments = getOption("xtable.latex.environments", c("center")),\r
19   tabular.environment = getOption("xtable.tabular.environment", "tabular"),\r
20   size = getOption("xtable.size", NULL),\r
21   hline.after = getOption("xtable.hline.after", c(-1,0,nrow(x))),\r
22   NA.string = getOption("xtable.NA.string", ""),\r
23   include.rownames = getOption("xtable.include.rownames", TRUE),\r
24   include.colnames = getOption("xtable.include.colnames", TRUE),\r
25   only.contents = getOption("xtable.only.contents", FALSE),\r
26   add.to.row = getOption("xtable.add.to.row", NULL),\r
27   sanitize.text.function = getOption("xtable.sanitize.text.function", NULL),\r
28   sanitize.rownames.function = getOption("xtable.sanitize.rownames.function", \r
29                                          sanitize.text.function),\r
30   sanitize.colnames.function = getOption("xtable.sanitize.colnames.function", \r
31                                          sanitize.text.function),\r
32   math.style.negative = getOption("xtable.math.style.negative", FALSE),\r
33   html.table.attributes = getOption("xtable.html.table.attributes",\r
34                                     "border=1"),\r
35   print.results = getOption("xtable.print.results", TRUE),\r
36   format.args = getOption("xtable.format.args", NULL),\r
37   rotate.rownames = getOption("xtable.rotate.rownames", FALSE),\r
38   rotate.colnames = getOption("xtable.rotate.colnames", FALSE),\r
39   booktabs = getOption("xtable.booktabs", FALSE),\r
40   scalebox = getOption("xtable.scalebox", NULL),\r
41   width = getOption("xtable.width", NULL),\r
42   comment = getOption("xtable.comment", TRUE),\r
43   timestamp = getOption("xtable.timestamp", date()),\r
44   ...)}\r
45 \arguments{\r
46   \item{x}{An object of class \code{"xtable"}.}\r
47   \item{type}{Type of table to produce.  Possible values for \code{type}\r
48     are \code{"latex"} or \code{"html"}.\r
49     Default value is \code{"latex"}.}\r
50   \item{file}{Name of file where the resulting code should be saved.  If\r
51     \code{file=""}, output is displayed on screen.  Note that the\r
52     function also (invisibly) returns a character vector of the results\r
53     (which can be helpful for post-processing).\r
54     Default value is \code{""}.}\r
55   \item{append}{If \code{TRUE} and \code{file!=""}, code will be\r
56     appended to \code{file} instead of overwriting \code{file}.\r
57     Default value is \code{FALSE}.}\r
58   \item{floating}{If \code{TRUE} and \code{type="latex"}, the resulting\r
59     table will be a floating table (using, for example,\r
60     \code{\\begin\{table\}} and \code{\\end\{table\}}).  See\r
61     \code{floating.environment} below.\r
62     Default value is \code{TRUE}. }\r
63   \item{floating.environment}{If \code{floating=TRUE} and\r
64     \code{type="latex"}, the resulting table uses the specified floating\r
65     environment. Possible values include \code{"table"}, \code{"table*"}, \r
66     and other floating environments defined in LaTeX packages.\r
67     Default value is \code{"table"}.}\r
68   \item{table.placement}{If \code{floating=TRUE} and\r
69     \code{type="latex"}, the floating table will have placement given by\r
70     \code{table.placement} where \code{table.placement} must be\r
71     \code{NULL} or contain only elements of\r
72     \{"h","t","b","p","!","H"\}.\r
73     Default value is \code{"ht"}.}\r
74   \item{caption.placement}{The caption will be have placed at the bottom\r
75     of the table if \code{caption.placement} is \code{"bottom"} and at\r
76     the top of the table if it equals \code{"top"}.\r
77     Default value is \code{"bottom"}.}\r
78   \item{caption.width}{The caption will be placed in a \code{"parbox"}\r
79     of the specified width if \code{caption.width} is not \code{NULL} and\r
80         \code{type="latex"}. Default value is \code{NULL}.}\r
81   \item{latex.environments}{If \code{floating=TRUE} and\r
82     \code{type="latex"}, the specificed latex environments (provided as\r
83     a character vector) will enclose the tabular environment.\r
84     Default value is \code{"center"}. }\r
85   \item{tabular.environment}{When \code{type="latex"}, the tabular\r
86     environment that will be used.\r
87     Defaults to \code{"tabular"}.\r
88     When working with tables that extend more than one page, using\r
89     \code{tabular.environment="longtable"} and the LaTeX package\r
90     \code{"longtable"} (see Fairbairns, 2005) allows one to typeset them\r
91     uniformly. Note that \code{"floating"} should be set to\r
92     \code{"FALSE"} when using the \code{"longtable"} environment.}\r
93   \item{size}{An arbitrary character vector intended to be used to set\r
94     the font size in a LaTeX table.  The supplied value (if not\r
95     \code{NULL}) is inserted just before the tabular environment\r
96     starts.\r
97     Default value is \code{NULL}. }\r
98   \item{hline.after}{When \code{type="latex"}, a vector of numbers\r
99     between -1 and \code{"nrow(x)"}, inclusive, indicating the rows\r
100     after which a horizontal line should appear.  If \code{NULL} is used\r
101     no lines are produced.\r
102     Default value is \code{c(-1,0,nrow(x))} which means draw a line\r
103     before and after the columns names and at the end of the\r
104     table. Repeated values are allowed.}\r
105   \item{NA.string}{String to be used for missing values in table\r
106     entries.\r
107     Default value is \code{""}.}\r
108   \item{include.rownames}{logical. If \code{TRUE} the rows names is\r
109     printed.\r
110     Default value is \code{TRUE}.}\r
111   \item{include.colnames}{logical. If \code{TRUE} the columns names is\r
112     printed.\r
113     Default value is \code{TRUE}.}\r
114   \item{only.contents}{logical. If \code{TRUE} only the rows of the\r
115     table is printed.\r
116     Default value is \code{FALSE}. }\r
117   \item{add.to.row}{a list of two components. The first component (which\r
118     should be called 'pos') is a list contains the position of rows on\r
119     which extra commands should be added at the end, The second\r
120     component (which should be called 'command') is a character vector\r
121     of the same length of the first component which contains the command\r
122     that should be added at the end of the specified rows.\r
123     Default value is \code{NULL}, i.e. do not add commands.}\r
124   \item{sanitize.text.function}{All non-numeric enteries (except row and\r
125     column names) are sanitised in an attempt to remove characters which\r
126     have special meaning for the output format. If\r
127     \code{sanitize.text.function} is not NULL (the default), it should\r
128     be a function taking a character vector and returning one, and will\r
129     be used for the sanitization instead of the default internal\r
130     function.}\r
131   \item{sanitize.rownames.function}{Like the\r
132     \code{sanitize.text.function}, but applicable to row names.\r
133     The default uses the \code{sanitize.text.function}. }\r
134   \item{sanitize.colnames.function}{Like the\r
135     \code{sanitize.text.function}, but applicable to column names.\r
136     The default uses the \code{sanitize.text.function}. }\r
137   \item{math.style.negative}{In a LaTeX table, if \code{TRUE}, then use\r
138     $-$ for the negative sign (as was the behavior prior to version 1.5-3).\r
139     Default value is \code{FALSE}.}\r
140   \item{html.table.attributes}{In an HTML table, attributes associated\r
141     with the \code{<TABLE>}tag.\r
142     Default value is \code{border=1}.}\r
143   \item{print.results}{If \code{TRUE}, the generated table is printed to\r
144     standard output.  Set this to \code{FALSE} if you will just be using\r
145     the character vector that is returned invisibly.}\r
146   \item{format.args}{List of arguments for the \code{formatC} function.\r
147     For example, standard German number separators can be specified as\r
148     \code{format.args=list(big.mark = "'", decimal.mark =\r
149       ","))}. \code{digits} and \code{format} arguments should not be\r
150     included in this list. See details. }\r
151   \item{rotate.rownames}{If \code{TRUE}, the row names are displayed\r
152     vertically in LaTeX. }\r
153   \item{rotate.colnames}{If \code{TRUE}, the column names are displayed\r
154     vertically in LaTeX. }\r
155   \item{booktabs}{If \code{TRUE}, the \code{toprule}, \code{midrule} and\r
156     \code{bottomrule} tags from the LaTex "booktabs" package are used\r
157     rather than \code{hline} for the horizontal line tags. }\r
158   \item{scalebox}{If not \code{NULL}, a \code{scalebox} clause will be\r
159     added around the tabular environment with the specified value used\r
160     as the scaling factor. }\r
161   \item{width}{If not \code{NULL}, the specified value is included in\r
162     parenthesis between the tabular environment \code{begin} tag and the\r
163     alignment specification.  This allows specification of the table\r
164     width when using tabular environments such as \code{tabular*} and\r
165     \code{tabularx}.  Note that table width specification is not\r
166     supported with the \code{tabular} or \code{longtable} environments. }\r
167   \item{comment}{If \code{TRUE}, the version and timestamp comment is\r
168     included.  Default value is \code{TRUE}. }  \r
169   \item{timestamp}{Timestamp to include in LaTeX comment.  Set this\r
170     to \code{NULL} to exclude the timestamp. Default value is \code{date()}. }  \r
171   \item{...}{Additional arguments.  (Currently ignored.) }\r
172 }\r
173 \details{\r
174   This function displays or writes to disk the code to produce a table\r
175   associated with an object \code{x} of class \code{"xtable"}. \r
176   The resulting code is either a LaTeX or HTML table, depending on the\r
177   value of \code{type}.  The function also (invisibly) returns a\r
178   character vector of the results (which can be helpful for\r
179   post-processing).\r
180 \r
181   Since version 1.4 the non default behavior of \code{hline.after} is\r
182   changed. To obtain the same results as the previous versions add to\r
183   the \code{hline.after} vector the vector \code{c(-1, 0, nrow(x))}\r
184   where \code{nrow(x)} is the numbers of rows of the object. \r
185 \r
186   From version 1.4-3, all non-numeric columns are sanitized, and all\r
187   LaTeX special characters are sanitised for LaTeX output.  See Section\r
188   3 of the \code{xtableGallery} vignette for an example of customising\r
189   the sanitization. From version 1.4-4, the sanitization also applies to\r
190   column names.  To remove any text sanitization, specify\r
191   \code{sanitize.text.function=function(x){x}}.  \r
192   \r
193   From version 1.6-1 the default values for the arguments other than\r
194   \code{x} are obtainined using \code{getOption()}.  Hence the user can\r
195   set the values once with \code{options()} rather than setting them in\r
196   every call to \code{print.xtable()}.\r
197 \r
198   The argument \code{format.args} is used to supply arguments to the\r
199   \code{formatC} function, but will throw an error if values for\r
200   \code{digits} or \code{format} are included in the list of\r
201   arguments. The recommended approach is to specify \code{digits} supply\r
202   the argument \code{digits} to \code{xtable}, and to specify\r
203   \code{format} supply the argument \code{display} to \code{xtable}. See\r
204   the examples.  \r
205 }\r
206 \author{\r
207   David Dahl \email{dahl@stat.tamu.edu} with contributions and\r
208   suggestions from many others (see source code).\r
209 }\r
210 \references{\r
211   Fairbairns, Robin (2005) \emph{Tables longer than a single page} The\r
212   UK List of TeX Frequently Asked Questions on the\r
213   Web. \url{http://www.tex.ac.uk/cgi-bin/texfaq2html?label=longtab}\r
214 }\r
215 \seealso{\r
216   \code{\link{xtable}}, \code{\link{caption}}, \code{\link{label}}, \r
217   \code{\link{align}}, \code{\link{digits}}, \code{\link{display}},\r
218   \code{\link{formatC}} \r
219 }\r
220 \r
221 \examples{\r
222 df <- data.frame(A = c(1.00123, 33.1, 6),\r
223                  B = c(111111, 3333333, 3123.233))\r
224 ## The following code gives the error\r
225 ## formal argument "digits" matched by multiple actual arguments\r
226 ## print(xtable(df, display = c("s","e","e")),\r
227 ##       format.args = list(digits = 3, big.mark = " ", decimal.mark = ","))\r
228 ## specify digits as argument to xtable instead\r
229 print(xtable(df, display = c("s","f","f"), digits = 4),\r
230       format.args = list(big.mark = " ", decimal.mark = ","))\r
231 ## The following code gives the error\r
232 ## formal argument "format" matched by multiple actual arguments\r
233 ## print(xtable(df, digits = 4),\r
234 ##       format.args = list(format = c("s","e","e"),\r
235 ##                          big.mark = " ", decimal.mark = ","))\r
236 ## specify format using display argument in xtable\r
237 print(xtable(df, display = c("s","e","e"), digits = 4),\r
238       format.args = list(big.mark = " ", decimal.mark = ","))\r
239 \r
240 }\r
241 \r
242 \keyword{print}\r