pkg/R/print.xtable.R

   1 ### xtable package\r
   2 ###\r
   3 ### Produce LaTeX and HTML tables from R objects.\r
   4 ###\r
   5 ### Copyright 2000-2013 David B. Dahl <dahl@stat.byu.edu>\r
   6 ###\r
   7 ### Maintained by David Scott <d.scott@auckland.ac.nz>\r
   8 ###\r
   9 ### This file is part of the `xtable' library for R and related languages.\r
  10 ### It is made available under the terms of the GNU General Public\r
  11 ### License, version 2, or at your option, any later version,\r
  12 ### incorporated herein by reference.\r
  13 ###\r
  14 ### This program is distributed in the hope that it will be\r
  15 ### useful, but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied\r
  16 ### warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR\r
  17 ### PURPOSE.  See the GNU General Public License for more\r
  18 ### details.\r
  19 ###\r
  20 ### You should have received a copy of the GNU General Public\r
  21 ### License along with this program; if not, write to the Free\r
  22 ### Software Foundation, Inc., 59 Temple Place - Suite 330, Boston,\r
  23 ### MA 02111-1307, USA\r
  24 print.xtable <- function(x,\r
  25   type = getOption("xtable.type", "latex"),\r
  26   file = getOption("xtable.file", ""),\r
  27   append = getOption("xtable.append", FALSE),\r
  28   floating = getOption("xtable.floating", TRUE),\r
  29   floating.environment = getOption("xtable.floating.environment", "table"),\r
  30   table.placement = getOption("xtable.table.placement", "ht"),\r
  31   caption.placement = getOption("xtable.caption.placement", "bottom"),\r
  32   caption.width = getOption("xtable.caption.width", NULL),\r
  33   latex.environments = getOption("xtable.latex.environments", c("center")),\r
  34   tabular.environment = getOption("xtable.tabular.environment", "tabular"),\r
  35   size = getOption("xtable.size", NULL),\r
  36   hline.after = getOption("xtable.hline.after", c(-1,0,nrow(x))),\r
  37   NA.string = getOption("xtable.NA.string", ""),\r
  38   include.rownames = getOption("xtable.include.rownames", TRUE),\r
  39   include.colnames = getOption("xtable.include.colnames", TRUE),\r
  40   only.contents = getOption("xtable.only.contents", FALSE),\r
  41   add.to.row = getOption("xtable.add.to.row", NULL),\r
  42   sanitize.text.function = getOption("xtable.sanitize.text.function", NULL),\r
  43   sanitize.rownames.function = getOption("xtable.sanitize.rownames.function",\r
  44                                          sanitize.text.function),\r
  45   sanitize.colnames.function = getOption("xtable.sanitize.colnames.function",\r
  46                                          sanitize.text.function),\r
  47   math.style.negative = getOption("xtable.math.style.negative", FALSE),\r
  48   html.table.attributes = getOption("xtable.html.table.attributes", "border=1"),\r
  49   print.results = getOption("xtable.print.results", TRUE),\r
  50   format.args = getOption("xtable.format.args", NULL),\r
  51   rotate.rownames = getOption("xtable.rotate.rownames", FALSE),\r
  52   rotate.colnames = getOption("xtable.rotate.colnames", FALSE),\r
  53   booktabs = getOption("xtable.booktabs", FALSE),\r
  54   scalebox = getOption("xtable.scalebox", NULL),\r
  55   width = getOption("xtable.width", NULL),\r
  56   comment = getOption("xtable.comment", TRUE),\r
  57   timestamp = getOption("xtable.timestamp", date()),\r
  58   ...)\r
  59 {\r
  60   ## If caption is length 2, treat the second value as the "short caption"\r
  61   caption <- attr(x,"caption",exact = TRUE)\r
  62   short.caption <- NULL\r
  63   if (!is.null(caption) && length(caption) > 1){\r
  64     short.caption <- caption[2]\r
  65     caption <- caption[1]\r
  66   }\r
  67 \r
  68   ## Claudio Agostinelli <claudio@unive.it> dated 2006-07-28 hline.after\r
  69   ## By default it print an \hline before and after the columns names\r
  70   ## independently they are printed or not and at the end of the table\r
  71   ## Old code that set hline.after should include c(-1, 0, nrow(x)) in the\r
  72   ## hline.after vector\r
  73   ## If you do not want any \hline inside the data, set hline.after to NULL\r
  74   ## PHEADER instead the string '\\hline\n' is used in the code\r
  75   ## Now hline.after counts how many time a position appear\r
  76   ## I left an automatic PHEADER in the longtable is this correct?\r
  77   \r
  78   ## Claudio Agostinelli <claudio@unive.it> dated 2006-07-28 include.rownames,\r
  79   ## include.colnames\r
  80   pos <- 0\r
  81   if (include.rownames) pos <- 1\r
  82   \r
  83   ## Claudio Agostinelli <claudio@unive.it> dated 2006-07-28\r
  84   ## hline.after checks\r
  85   if (any(hline.after < -1) | any(hline.after > nrow(x))) {\r
  86     stop("'hline.after' must be inside [-1, nrow(x)]")\r
  87   }\r
  88   \r
  89   ## Claudio Agostinelli <claudio@unive.it> dated 2006-07-28\r
  90   ## add.to.row checks\r
  91   if (!is.null(add.to.row)) {\r
  92     if (is.list(add.to.row) && length(add.to.row) == 2) {\r
  93       if (is.null(names(add.to.row))) {\r
  94         names(add.to.row) <- c('pos', 'command')\r
  95       } else if (any(sort(names(add.to.row))!= c('command', 'pos'))) {\r
  96         stop("the names of the elements of 'add.to.row' must be 'pos' and 'command'")\r
  97       }\r
  98       if (is.list(add.to.row$pos) && is.vector(add.to.row$command,\r
  99                                                mode = 'character')) {\r
 100         if ((npos <- length(add.to.row$pos)) !=\r
 101             length(add.to.row$command)) {\r
 102           stop("the length of 'add.to.row$pos' must be equal to the length of 'add.to.row$command'")\r
 103         }\r
 104         if (any(unlist(add.to.row$pos) < -1) |\r
 105             any(unlist(add.to.row$pos) > nrow(x))) {\r
 106           stop("the values in add.to.row$pos must be inside the interval [-1, nrow(x)]")\r
 107         }\r
 108       } else {\r
 109         stop("the first argument ('pos') of 'add.to.row' must be a list, the second argument ('command') must be a vector of mode character")\r
 110       }\r
 111     } else {\r
 112       stop("'add.to.row' argument must be a list of length 2")\r
 113     }\r
 114   } else {\r
 115     add.to.row <- list(pos = list(),\r
 116                        command = vector(length = 0, mode = "character"))\r
 117     npos <- 0\r
 118   }\r
 119   \r
 120   ## Claudio Agostinelli <claudio@unive.it> dated 2006-07-28 add.to.row\r
 121   ## Add further commands at the end of rows\r
 122   if (type == "latex") {\r
 123     ## Original code before changes in version 1.6-1\r
 124     ## PHEADER <- "\\hline\n"\r
 125     \r
 126     ## booktabs code from Matthieu Stigler <matthieu.stigler@gmail.com>,\r
 127     ## 1 Feb 2012\r
 128     if(!booktabs){\r
 129       PHEADER <- "\\hline\n"\r
 130     } else {\r
 131       ## This code replaced to fix bug #2309, David Scott, 8 Jan 2014\r
 132       ## PHEADER <- ifelse(-1%in%hline.after, "\\toprule\n", "")\r
 133       ## if(0%in%hline.after) {\r
 134       ##     PHEADER <- c(PHEADER, "\\midrule\n")\r
 135       ## }\r
 136       ## if(nrow(x)%in%hline.after) {\r
 137       ##     PHEADER <- c(PHEADER, "\\bottomrule\n")\r
 138       ## }\r
 139       if (is.null(hline.after)){\r
 140         PHEADER <- ""\r
 141       } else {\r
 142         hline.after <- sort(hline.after)\r
 143         PHEADER <- rep("\\midrule\n", length(hline.after))\r
 144         if (hline.after[1] == -1) {\r
 145           PHEADER[1] <- "\\toprule\n"\r
 146         }\r
 147         if (hline.after[length(hline.after)] == nrow(x)) {\r
 148           PHEADER[length(hline.after)] <- "\\bottomrule\n"\r
 149         }\r
 150       }\r
 151     }\r
 152   } else {\r
 153     PHEADER <- ""\r
 154   }\r
 155   \r
 156   lastcol <- rep(" ", nrow(x)+2)\r
 157   if (!is.null(hline.after)) {\r
 158     ## booktabs change - Matthieu Stigler: fill the hline arguments\r
 159     ## separately, 1 Feb 2012\r
 160     ##\r
 161     ## Code before booktabs change was:\r
 162     ##    add.to.row$pos[[npos+1]] <- hline.after\r
 163     \r
 164     if (!booktabs){\r
 165       add.to.row$pos[[npos+1]] <- hline.after\r
 166     } else {\r
 167       for(i in 1:length(hline.after)) {\r
 168         add.to.row$pos[[npos+i]] <- hline.after[i]\r
 169       }\r
 170     }\r
 171     add.to.row$command <- c(add.to.row$command, PHEADER)\r
 172   }\r
 173   \r
 174   if ( length(add.to.row$command) > 0 ) {\r
 175     for (i in 1:length(add.to.row$command)) {\r
 176       addpos <- add.to.row$pos[[i]]\r
 177       freq <- table(addpos)\r
 178       addpos <- unique(addpos)\r
 179       for (j in 1:length(addpos)) {\r
 180         lastcol[addpos[j]+2] <- paste(lastcol[addpos[j]+2],\r
 181                                       paste(rep(add.to.row$command[i],\r
 182                                                 freq[j]),\r
 183                                             sep = "", collapse = ""),\r
 184                                       sep = " ")\r
 185       }\r
 186     }\r
 187   }\r
 188   \r
 189   if (length(type)>1) stop("\"type\" must have length 1")\r
 190   type <- tolower(type)\r
 191   if (!all(!is.na(match(type, c("latex","html"))))) {\r
 192     stop("\"type\" must be in {\"latex\", \"html\"}")\r
 193   }\r
 194   ## Disabling the check on known floating environments as many users\r
 195   ## want to use additional environments.\r
 196   ##    if (!all(!is.na(match(floating.environment,\r
 197   ##                          c("table","table*","sidewaystable",\r
 198   ##                            "margintable"))))) {\r
 199   ##        stop("\"type\" must be in {\"table\", \"table*\", \"sidewaystable\", \"margintable\"}")\r
 200   ##    }\r
 201   if (("margintable" %in% floating.environment)\r
 202       & (!is.null(table.placement))) {\r
 203     warning("margintable does not allow for table placement; setting table.placement to NULL")\r
 204     table.placement <- NULL\r
 205   }\r
 206   if (!is.null(table.placement) &&\r
 207       !all(!is.na(match(unlist(strsplit(table.placement,  split = "")),\r
 208                         c("H","h","t","b","p","!"))))) {\r
 209     stop("\"table.placement\" must contain only elements of {\"h\",\"t\",\"b\",\"p\",\"!\"}")\r
 210   }\r
 211   if (!all(!is.na(match(caption.placement, c("bottom","top"))))) {\r
 212     stop("\"caption.placement\" must be either {\"bottom\",\"top\"}")\r
 213   }\r
 214   \r
 215   if (type == "latex") {\r
 216     BCOMMENT <- "% "\r
 217     ECOMMENT <- "\n"\r
 218     ## See e-mail from "John S. Walker <jsw9c@uic.edu>" dated 5-19-2003\r
 219     ## regarding "texfloat"\r
 220     ## See e-mail form "Fernando Henrique Ferraz P. da Rosa"\r
 221     ## <academic@feferraz.net>" dated 10-28-2005 regarding "longtable"\r
 222     if ( tabular.environment == "longtable" & floating == TRUE ) {\r
 223       warning("Attempt to use \"longtable\" with floating = TRUE. Changing to FALSE.")\r
 224       floating <- FALSE\r
 225     }\r
 226     if ( floating == TRUE ) {\r
 227       ## See e-mail from "Pfaff, Bernhard <Bernhard.Pfaff@drkw.com>"\r
 228       ## dated 7-09-2003 regarding "suggestion for an amendment of\r
 229       ## the source"\r
 230       ## See e-mail from "Mitchell, David"\r
 231       ## <David.Mitchell@dotars.gov.au>" dated 2003-07-09 regarding\r
 232       ## "Additions to R xtable package"\r
 233       ## See e-mail from "Garbade, Sven"\r
 234       ## <Sven.Garbade@med.uni-heidelberg.de> dated 2006-05-22\r
 235       ## regarding the floating environment.\r
 236       BTABLE <- paste("\\begin{", floating.environment, "}",\r
 237                       ifelse(!is.null(table.placement),\r
 238                              paste("[", table.placement, "]", sep = ""),\r
 239                              ""), "\n", sep = "")\r
 240       if ( is.null(latex.environments) ||\r
 241            (length(latex.environments) == 0) ) {\r
 242         BENVIRONMENT <- ""\r
 243         EENVIRONMENT <- ""\r
 244       } else {\r
 245         BENVIRONMENT <- ""\r
 246         EENVIRONMENT <- ""\r
 247         if ("center" %in% latex.environments){\r
 248           BENVIRONMENT <- paste(BENVIRONMENT, "\\centering\n",\r
 249                                 sep = "")\r
 250         }\r
 251         for (i in 1:length(latex.environments)) {\r
 252           if (latex.environments[i] == "") next\r
 253           if (latex.environments[i] != "center"){\r
 254             BENVIRONMENT <- paste(BENVIRONMENT,\r
 255                                   "\\begin{", latex.environments[i],\r
 256                                   "}\n", sep = "")\r
 257             EENVIRONMENT <- paste("\\end{", latex.environments[i],\r
 258                                   "}\n", EENVIRONMENT, sep = "")\r
 259           }\r
 260         }\r
 261       }\r
 262       ETABLE <- paste("\\end{", floating.environment, "}\n", sep = "")\r
 263     } else {\r
 264       BTABLE <- ""\r
 265       ETABLE <- ""\r
 266       BENVIRONMENT <- ""\r
 267       EENVIRONMENT <- ""\r
 268     }\r
 269     \r
 270     tmp.index.start <- 1\r
 271     if ( ! include.rownames ) {\r
 272       while ( attr(x, "align", exact = TRUE)[tmp.index.start] == '|' )\r
 273         tmp.index.start <- tmp.index.start + 1\r
 274       tmp.index.start <- tmp.index.start + 1\r
 275     }\r
 276     ## Added "width" argument for use with "tabular*" or\r
 277     ## "tabularx" environments - CR, 7/2/12\r
 278     if (is.null(width)){\r
 279       WIDTH <-""\r
 280     } else if (is.element(tabular.environment,\r
 281                           c("tabular", "longtable"))){\r
 282       warning("Ignoring 'width' argument.  The 'tabular' and 'longtable' environments do not support a width specification.  Use another environment such as 'tabular*' or 'tabularx' to specify the width.")\r
 283       WIDTH <- ""\r
 284     } else {\r
 285       WIDTH <- paste("{", width, "}", sep = "")\r
 286     }\r
 287     \r
 288     BTABULAR <-\r
 289       paste("\\begin{", tabular.environment, "}",\r
 290             WIDTH, "{",\r
 291             paste(c(attr(x, "align",\r
 292                          exact = TRUE)[\r
 293               tmp.index.start:length(attr(x, "align",\r
 294                                           exact = TRUE))],\r
 295               "}\n"),\r
 296               sep = "", collapse = ""),\r
 297             sep = "")\r
 298     \r
 299     ## fix 10-26-09 (robert.castelo@upf.edu) the following\r
 300     ## 'if' condition is added here to support\r
 301     ## a caption on the top of a longtable\r
 302     if (tabular.environment == "longtable" && caption.placement == "top") {\r
 303       if (is.null(short.caption)){\r
 304         BCAPTION <- "\\caption{"\r
 305       } else {\r
 306         BCAPTION <- paste("\\caption[", short.caption, "]{", sep = "")\r
 307       }\r
 308       ECAPTION <- "} \\\\ \n"\r
 309       if ((!is.null(caption)) && (type == "latex")) {\r
 310         BTABULAR <- paste(BTABULAR,  BCAPTION, caption, ECAPTION,\r
 311                           sep = "")\r
 312       }\r
 313     }\r
 314     ## Claudio Agostinelli <claudio@unive.it> dated 2006-07-28\r
 315     ## add.to.row position -1\r
 316     BTABULAR <- paste(BTABULAR, lastcol[1], sep = "")\r
 317     ## the \hline at the end, if present, is set in full matrix\r
 318     ETABULAR <- paste("\\end{", tabular.environment, "}\n", sep = "")\r
 319     \r
 320     ## Add scalebox - CR, 7/2/12\r
 321     if (!is.null(scalebox)){\r
 322       BTABULAR <- paste("\\scalebox{", scalebox, "}{\n", BTABULAR,\r
 323                         sep = "")\r
 324       ETABULAR <- paste(ETABULAR, "}\n", sep = "")\r
 325     }\r
 326     \r
 327     ## BSIZE contributed by Benno <puetz@mpipsykl.mpg.de> in e-mail\r
 328     ## dated Wednesday, December 01, 2004\r
 329     if (is.null(size) || !is.character(size)) {\r
 330       BSIZE <- ""\r
 331       ESIZE <- ""\r
 332     } else {\r
 333       if(length(grep("^\\\\", size)) == 0){\r
 334         size <- paste("\\", size, sep = "")\r
 335       }\r
 336       BSIZE <- paste("{", size, "\n", sep = "")\r
 337       ESIZE <- "}\n"\r
 338     }\r
 339     BLABEL <- "\\label{"\r
 340     ELABEL <- "}\n"\r
 341     ## Added caption width (jeff.laake@nooa.gov)\r
 342     if(!is.null(caption.width)){\r
 343       BCAPTION <- paste("\\parbox{",caption.width,"}{",sep="")\r
 344       ECAPTION <- "}"\r
 345     } else {\r
 346       BCAPTION <- NULL\r
 347       ECAPTION <- NULL\r
 348     }\r
 349     if (is.null(short.caption)){\r
 350       BCAPTION <- paste(BCAPTION,"\\caption{",sep="")\r
 351     } else {\r
 352       BCAPTION <- paste(BCAPTION,"\\caption[", short.caption, "]{", sep="")\r
 353     }\r
 354     ECAPTION <- paste(ECAPTION,"} \n",sep="")\r
 355     BROW <- ""\r
 356     EROW <- " \\\\ \n"\r
 357     BTH <- ""\r
 358     ETH <- ""\r
 359     STH <- " & "\r
 360     BTD1 <- " & "\r
 361     BTD2 <- ""\r
 362     BTD3 <- ""\r
 363     ETD  <- ""\r
 364     } else {\r
 365       BCOMMENT <- "<!-- "\r
 366       ECOMMENT <- " -->\n"\r
 367       BTABLE <- paste("<table ", html.table.attributes, ">\n", sep = "")\r
 368       ETABLE <- "</table>\n"\r
 369       BENVIRONMENT <- ""\r
 370       EENVIRONMENT <- ""\r
 371       BTABULAR <- ""\r
 372       ETABULAR <- ""\r
 373       BSIZE <- ""\r
 374       ESIZE <- ""\r
 375       BLABEL <- "<a name="\r
 376       ELABEL <- "></a>\n"\r
 377       BCAPTION <- paste("<caption align=\"", caption.placement, "\"> ",\r
 378                         sep = "")\r
 379       ECAPTION <- " </caption>\n"\r
 380       BROW <- "<tr>"\r
 381       EROW <- " </tr>\n"\r
 382       BTH <- " <th> "\r
 383       ETH <- " </th> "\r
 384       STH <- " </th> <th> "\r
 385       BTD1 <- " <td align=\""\r
 386       align.tmp <- attr(x, "align", exact = TRUE)\r
 387       align.tmp <- align.tmp[align.tmp!="|"]\r
 388       BTD2 <- matrix(align.tmp[(2-pos):(ncol(x)+1)],\r
 389                      nrow = nrow(x), ncol = ncol(x)+pos, byrow = TRUE)\r
 390       ## Based on contribution from Jonathan Swinton <jonathan@swintons.net>\r
 391       ## in e-mail dated Wednesday, January 17, 2007\r
 392       BTD2[regexpr("^p", BTD2)>0] <- "left"\r
 393       BTD2[BTD2 == "r"] <- "right"\r
 394       BTD2[BTD2 == "l"] <- "left"\r
 395       BTD2[BTD2 == "c"] <- "center"\r
 396       BTD3 <- "\"> "\r
 397       ETD  <- " </td>"\r
 398     }\r
 399   \r
 400   result <- string("", file = file, append = append)\r
 401   info <- R.Version()\r
 402   ## modified Claudio Agostinelli <claudio@unive.it> dated 2006-07-28\r
 403   ## to set automatically the package version\r
 404   if (comment){\r
 405     result <- result + BCOMMENT + type + " table generated in " +\r
 406       info$language + " " + info$major + "." + info$minor +\r
 407       " by xtable " +  packageDescription('xtable')$Version +\r
 408                                                   " package" + ECOMMENT\r
 409     if (!is.null(timestamp)){\r
 410       result <- result + BCOMMENT + timestamp + ECOMMENT\r
 411     }\r
 412   }\r
 413   ## Claudio Agostinelli <claudio@unive.it> dated 2006-07-28 only.contents\r
 414   if (!only.contents) {\r
 415     result <- result + BTABLE\r
 416     result <- result + BENVIRONMENT\r
 417     if ( floating == TRUE ) {\r
 418       if ((!is.null(caption)) &&\r
 419           (type == "html" ||caption.placement == "top")) {\r
 420         result <- result + BCAPTION + caption + ECAPTION\r
 421       }\r
 422       if (!is.null(attr(x, "label", exact = TRUE)) &&\r
 423           (type == "latex" && caption.placement == "top")) {\r
 424         result <- result + BLABEL +\r
 425           attr(x, "label", exact = TRUE) + ELABEL\r
 426       }\r
 427     }\r
 428     result <- result + BSIZE\r
 429     result <- result + BTABULAR\r
 430   }\r
 431   ## Claudio Agostinelli <claudio@unive.it> dated 2006-07-28\r
 432   ## include.colnames, include.rownames\r
 433   if (include.colnames) {\r
 434     result <- result + BROW + BTH\r
 435     if (include.rownames) {\r
 436       result <- result + STH\r
 437     }\r
 438     ## David G. Whiting in e-mail 2007-10-09\r
 439     if (is.null(sanitize.colnames.function)) {\r
 440       CNAMES <- sanitize(names(x), type = type)\r
 441     } else {\r
 442       CNAMES <- sanitize.colnames.function(names(x))\r
 443     }\r
 444     if (rotate.colnames) {\r
 445       ##added by Markus Loecher, 2009-11-16\r
 446       CNAMES <- paste("\\begin{sideways}", CNAMES, "\\end{sideways}")\r
 447     }\r
 448     result <- result + paste(CNAMES, collapse = STH)\r
 449     \r
 450     result <- result + ETH + EROW\r
 451   }\r
 452   \r
 453   cols <- matrix("", nrow = nrow(x), ncol = ncol(x)+pos)\r
 454   if (include.rownames) {\r
 455     ## David G. Whiting in e-mail 2007-10-09\r
 456     if (is.null(sanitize.rownames.function)) {\r
 457       RNAMES <- sanitize(row.names(x), type = type)\r
 458     } else {\r
 459       RNAMES <- sanitize.rownames.function(row.names(x))\r
 460     }\r
 461     if (rotate.rownames) {\r
 462       ##added by Markus Loecher, 2009-11-16\r
 463       RNAMES <- paste("\\begin{sideways}", RNAMES, "\\end{sideways}")\r
 464     }\r
 465     cols[, 1] <- RNAMES\r
 466   }\r
 467 \r
 468   ## Begin vectorizing the formatting code by Ian Fellows [ian@fellstat.com]\r
 469   ## 06 Dec 2011\r
 470   ##\r
 471   ##  disp <- function(y) {\r
 472   ##    if (is.factor(y)) {\r
 473   ##      y <- levels(y)[y]\r
 474   ##    }\r
 475   ##    if (is.list(y)) {\r
 476   ##      y <- unlist(y)\r
 477   ##    }\r
 478   ##    return(y)\r
 479   ##  }\r
 480   varying.digits <- is.matrix( attr( x, "digits", exact = TRUE ) )\r
 481   ## Code for letting "digits" be a matrix was provided by\r
 482   ## Arne Henningsen <ahenningsen@agric-econ.uni-kiel.de>\r
 483   ## in e-mail dated 2005-06-04.\r
 484   ##if( !varying.digits ) {\r
 485   ## modified Claudio Agostinelli <claudio@unive.it> dated 2006-07-28\r
 486   ##  attr(x,"digits") <- matrix( attr( x, "digits",exact=TRUE ),\r
 487   ## nrow = nrow(x), ncol = ncol(x)+1, byrow = TRUE )\r
 488   ##}\r
 489   for(i in 1:ncol(x)) {\r
 490     xcol <- x[, i]\r
 491     if(is.factor(xcol))\r
 492       xcol <- as.character(xcol)\r
 493     if(is.list(xcol))\r
 494       xcol <- sapply(xcol, unlist)\r
 495     ina <- is.na(xcol)\r
 496     is.numeric.column <- is.numeric(xcol)\r
 497     \r
 498     if(is.character(xcol)) {\r
 499       cols[, i+pos] <- xcol\r
 500     } else {\r
 501       if (is.null(format.args)){\r
 502         format.args <- list()\r
 503       }\r
 504       if (is.null(format.args$decimal.mark)){\r
 505         format.args$decimal.mark <- options()$OutDec\r
 506       }\r
 507       if(!varying.digits){\r
 508         curFormatArgs <-\r
 509           c(list(\r
 510             x = xcol,\r
 511             format =\r
 512               ifelse(attr(x, "digits", exact = TRUE )[i+1] < 0, "E",\r
 513                      attr(x, "display", exact = TRUE )[i+1]),\r
 514             digits = abs(attr(x, "digits", exact = TRUE )[i+1])),\r
 515             format.args)\r
 516         cols[, i+pos] <- do.call("formatC", curFormatArgs)\r
 517       }else{\r
 518         for( j in 1:nrow( cols ) ) {\r
 519           curFormatArgs <-\r
 520             c(list(\r
 521               x = xcol[j],\r
 522               format =\r
 523                 ifelse(attr(x, "digits", exact = TRUE )[j, i+1] < 0,\r
 524                        "E", attr(x, "display", exact = TRUE )[i+1]),\r
 525               digits =\r
 526                 abs(attr(x, "digits", exact = TRUE )[j, i+1])),\r
 527               format.args)\r
 528           cols[j, i+pos] <- do.call("formatC", curFormatArgs)\r
 529         }\r
 530       }\r
 531     }\r
 532     ## End Ian Fellows changes\r
 533 \r
 534     if ( any(ina) ) cols[ina, i+pos] <- NA.string\r
 535     ## Based on contribution from Jonathan Swinton <jonathan@swintons.net>\r
 536     ## in e-mail dated Wednesday, January 17, 2007\r
 537     if ( is.numeric.column ) {\r
 538       cols[, i+pos] <-\r
 539         sanitize.numbers(cols[, i+pos], type = type,\r
 540                          math.style.negative = math.style.negative)\r
 541     } else {\r
 542       if (is.null(sanitize.text.function)) {\r
 543         cols[, i+pos] <- sanitize(cols[, i+pos], type = type)\r
 544       } else {\r
 545         cols[, i+pos] <- sanitize.text.function(cols[, i+pos])\r
 546       }\r
 547     }\r
 548   }\r
 549   \r
 550   multiplier <- 5\r
 551   full <- matrix("", nrow = nrow(x), ncol = multiplier*(ncol(x)+pos)+2)\r
 552   full[, 1] <- BROW\r
 553   full[, multiplier*(0:(ncol(x)+pos-1))+2] <- BTD1\r
 554   full[, multiplier*(0:(ncol(x)+pos-1))+3] <- BTD2\r
 555   full[, multiplier*(0:(ncol(x)+pos-1))+4] <- BTD3\r
 556   full[, multiplier*(0:(ncol(x)+pos-1))+5] <- cols\r
 557   full[, multiplier*(0:(ncol(x)+pos-1))+6] <- ETD\r
 558   \r
 559   full[, multiplier*(ncol(x)+pos)+2] <- paste(EROW, lastcol[-(1:2)],\r
 560                                               sep = " ")\r
 561   \r
 562   if (type == "latex") full[, 2] <- ""\r
 563   result <- result + lastcol[2] + paste(t(full), collapse = "")\r
 564   if (!only.contents) {\r
 565     if (tabular.environment == "longtable") {\r
 566       ## booktabs change added the if() - 1 Feb 2012\r
 567       if(!booktabs) {\r
 568         result <- result + PHEADER\r
 569       }\r
 570 \r
 571       ## fix 10-27-09 Liviu Andronic (landronimirc@gmail.com) the\r
 572       ## following 'if' condition is inserted in order to avoid\r
 573       ## that bottom caption interferes with a top caption of a longtable\r
 574       if(caption.placement == "bottom"){\r
 575         if ((!is.null(caption)) && (type == "latex")) {\r
 576           result <- result + BCAPTION + caption + ECAPTION\r
 577         }\r
 578       }\r
 579       if (!is.null(attr(x, "label", exact = TRUE))) {\r
 580         result <- result + BLABEL + attr(x, "label", exact = TRUE) +\r
 581           ELABEL\r
 582       }\r
 583       ETABULAR <- "\\end{longtable}\n"\r
 584     }\r
 585     result <- result + ETABULAR\r
 586     result <- result + ESIZE\r
 587     if ( floating == TRUE ) {\r
 588       if ((!is.null(caption)) &&\r
 589           (type == "latex" && caption.placement == "bottom")) {\r
 590         result <- result + BCAPTION + caption + ECAPTION\r
 591       }\r
 592       if (!is.null(attr(x, "label", exact = TRUE)) &&\r
 593           caption.placement == "bottom") {\r
 594         result <- result + BLABEL + attr(x, "label", exact = TRUE) +\r
 595           ELABEL\r
 596       }\r
 597     }\r
 598     result <- result + EENVIRONMENT\r
 599     result <- result + ETABLE\r
 600   }\r
 601   result <- sanitize.final(result, type = type)\r
 602   \r
 603   if (print.results){\r
 604     print(result)\r
 605   }\r
 606   \r
 607   return(invisible(result$text))\r
 608 }\r
 609 \r
 610 "+.string" <- function(x, y) {\r
 611   x$text <- paste(x$text, as.string(y)$text, sep = "")\r
 612   return(x)\r
 613 }\r
 614 \r
 615 print.string <- function(x, ...) {\r
 616   cat(x$text, file = x$file, append = x$append)\r
 617   return(invisible())\r
 618 }\r
 619 \r
 620 string <- function(text, file = "", append = FALSE) {\r
 621   x <- list(text = text, file = file, append = append)\r
 622   class(x) <- "string"\r
 623   return(x)\r
 624 }\r
 625 \r
 626 as.string <- function(x, file = "", append = FALSE) {\r
 627   if (is.null(attr(x, "class", exact = TRUE)))\r
 628     switch(data.class(x),\r
 629            character = return(string(x, file, append)),\r
 630            numeric = return(string(as.character(x), file, append)),\r
 631            stop("Cannot coerce argument to a string"))\r
 632   if (class(x) == "string")\r
 633     return(x)\r
 634   stop("Cannot coerce argument to a string")\r
 635 }\r
 636 \r
 637 is.string <- function(x) {\r
 638   return(class(x) == "string")\r
 639 }\r
 640 \r