code_c/Maasha/src/test.c

   1 #include "common.h"
   2 #include "filesys.h"
   3 #include "fasta.h"
   4
   5 int main( int argc, char *argv[] )
   6 {
   7     char *file;
   8     FILE *fp;
   9     char chr[ 10 ];
  10     int chr_beg;
  11     int chr_end;
  12
  13     file = argv[ 1 ];
  14
  15     fp = read_open( file );
  16
  17     fscanf( "%s\t%d\t%d", fp, chr, chr_beg, chr_end );
  18
  19     print ( "CHR: %s  CHR_BEG: %d   CHR_END: %d\n", chr, chr_beg, chr_end );
  20
  21     close_stream( fp );
  22
  23     return 0;
  24 }
  25
  26
  27 double avarage( int num, ... )
  28 {
  29     /* Martin A. Hansen, July 2008 */
  30
  31     /* Example of varable length argument list usage. */
  32
  33     /* Requires '#include <stdarg.h>' */
  34
  35     double sum = 0;
  36     int    x   = 0;
  37
  38     va_list arguments;
  39
  40     va_start( arguments, num );
  41
  42     for ( x = 0; x < num; x++ )
  43     {
  44         sum += va_arg( arguments, double );
  45     }
  46
  47     va_end( arguments );
  48
  49     return sum / num;
  50 }
  51
  52
  53
  54 /*
  55
  56 int main( int argc, char *argv[] )
  57 {
  58     char             *file;
  59     FILE             *fp;
  60     struct seq_entry *entry = NULL;
  61     int               count;
  62
  63     count = 0;
  64
  65     file = argv[ 1 ];
  66
  67     fp = read_open( file );
  68
  69     while ( ( fasta_get_entry( fp, entry ) ) != FALSE )
  70     {
  71         printf( "seq_name: %s\n", entry->seq_name );
  72
  73 //        mem_free( entry->seq_name );
  74 //        mem_free( entry->seq );
  75 //        entry = NULL;
  76
  77         count++;
  78     }
  79
  80     printf( "count: %d\n", count );
  81
  82     close_stream( fp );
  83
  84     return 0;
  85 }
  86
  87
  88 */